EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-00013 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr1:787971-789429 
TF binding sites/motifs
Number: 6             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Foxd3MA0041.1chr1:789192-789204GTTTGTTTGTTT+6.32
GBX1MA0889.1chr1:789212-789222GCTAATTAGT-6.02
HOXB3MA0903.1chr1:789212-789222GCTAATTAGT-6.02
LHX2MA0700.1chr1:788187-788197GTTAATTAGT-6.02
LHX6MA0658.1chr1:789212-789222GCTAATTAGT-6.02
mix-aMA0621.1chr1:788186-788197AGTTAATTAGT+6.14
Enhancer Sequence
ATGTCAGTGA CACCAGAGCA GCTCTTCACC ACATTTATAC TCTGCTGCCA TCAAAACAGA 60
GAAAACGAGA GCATCAAAAC TATAAAGAGG AATACAGACA TAATCTAAAC ATTTCTGCAT 120
CCCAAAACTG CATAAACCTA CGTTTCATCT GTACATTCAG TCTAACACTT TGTTTTGATT 180
TAACATTAGT TACTTAGTTA GTTAGTTAGT TTGTTAGTTA ATTAGTCAGT AACTTAGTTT 240
GGTTAGTTAG TTAGTTAGTT AGTTAGTTAG TTAGTTAGTT AGTTAGTTAG TTAGTTAGTT 300
AGTCAGTAAC TTAGTTTGGT TAGTTAGTCT GTTACATAGT TTGGTTAGTT AGTTAGTTAG 360
TTAGTTAGTT AGTCAGTAAC TTAGTTTGGT TAGTTAGTCT GTTTCATAGT TTGGTTAGTT 420
AGTTAGTTAG TTAGTTAGTT AGTTAGTTAG TTAGTCAGTA ACTTAGTTTG GTTAGTTAGT 480
CTGTTACATA GTTTGGTTAG TTAGTTAGTT AGTTAGTTAG TTAGTTAGTC AGTAACTTAG 540
TTTGGTTAGT TAGTTAGTTA GTTAGTTAGT TAGTTAGTCA GTAACTTAGT TTGGTTAGTT 600
AGTTAGTCAG TCAGTCAGTT AGTTACTTAG TTATTTATTT AGTTAGTTAG TTAGTTAGTT 660
GGATGGTTGG TTGGTTGGTT GGTTGGTTAG TTACTTTGTT TGTTTGTTAG TTAGTTAGAT 720
GTTAGTCAGT AGTTAAACTA ACTAACTAAC TAACTAACTA ACTAACTAAC TAAACTATGT 780
TTGGTTTGTT AGTTAGTTAG TTAGTTAGTT AGTTAGTTAG TTAGTTAGTT AGTTAGTTAG 840
TTAGTTAGTT AGTCAGTAAC TTAGTTTGGT TAGTTAGTTA GTCAGCCAGT CAGTTAGTTA 900
CTTAGTTATT TAGTTAGTTA GTTAGTTAGT TGGATGGTTG GTTGGTTGGT TAGTTACTTT 960
GTTTGTTTGT TAGTTAGTTA GATGTTAGTC AGTAGTTTAG TTTGGTTAGT TAGTCAGTCA 1020
GCCAGTCAGT CAGTCAGTCA GTCAGTCAGT TGGTTAGTTA GTTAGTTAGT TAGTTTATTT 1080
GGTTAGTTAG TTACTTTGTT TGTTAGTTAG TTAGATGTTA GTCAGTAGTT TAGTTTGGTC 1140
AGTCAATCAG TCAGTCAGTC AGTTAGTTAG CTAGTTAGTT AGTTAGTTAG TTGGTTGGGT 1200
GGTTGGTTAG TTAGGTATTT AGTTTGTTTG TTTCTTAGTT AGCTAATTAG TTAGTTGCAC 1260
TGTTAGACAT TTCAAAGGGT TTTTACAGTA ACTTACTGGC AACACTGTTG CCAGTAAGTT 1320
ACTGTATTTT AGATTTACAG TATACAACTG TAAATCCGTT TACAGCATGT TACTGTAGTG 1380
TCTGAAAATG GTTAACTACT GTAAAAACCT AAGTTAACAG TTAGCTACTG TAAACCTTTT 1440
AATTTTGTCC TAAATATT 1458