EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species
EnhancerAtlas 2.0
TagContent
EnhancerAtlas ID
DR006-00975 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_4hpf 
Coordinate
chr9:51896726-51899520 
TF binding sites/motifs
Number: 12             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
GRHL2MA1105.1chr9:51898279-51898294TCCAAACCAGTTTGA+6.3
LMX1BMA0703.2chr9:51896781-51896792GTTTTAATTAA+6.14
LMX1BMA0703.2chr9:51896798-51896809TTAATTAAATT-6.32
Lhx3MA0135.1chr9:51896795-51896808AAATTAATTAAAT+6.07
MEF2AMA0052.3chr9:51897123-51897135ACTATTTTTAGA-6.02
MEF2CMA0497.1chr9:51897122-51897137GACTATTTTTAGAAT-6.02
PHOX2AMA0713.1chr9:51896799-51896810TAATTAAATTA-6.62
PROP1MA0715.1chr9:51896799-51896810TAATTAAATTA+6.32
PROP1MA0715.1chr9:51896799-51896810TAATTAAATTA-6.62
Phox2bMA0681.1chr9:51896799-51896810TAATTAAATTA-6.62
SOX8MA0868.2chr9:51898802-51898812CCATTGTTCT-6.02
ZNF384MA1125.1chr9:51899207-51899219AATAAAAAAAAA+6.62
Enhancer Sequence
CTAATTTAAT GTCATTATCT GTGTCCCTAT TTCTGTGCTC GACGGTTTAA GTAGTGTTTT 60
AATTAATTCA AATTAATTAA ATTACAACGC ACCGCATTTC CAGCGACGTC TCAGTTTATA 120
TTAGAAATAT AGAACGTCGC CTATATGTTT TAAGAAATGT AGATAGATAG ATAGATAGAT 180
AGATAGATAG ATAGATAGAT AGATAGATAG ATAGATAGAT AGATAGATAG ATAGATAGAT 240
AGATAGATAG ATAGATAGAT AGATAGATAG ATAGATAGAT AGATAGAAGT AAATGGTGGA 300
AGAGTTTAAT AACTTTTAAG GAGCAGCAAA TTGGTAGTTT ATTGAGCGAG AAGTCTTAGT 360
TAATGGTTTG TTAATAGCGA GAATTGTATA AAGTGAGACT ATTTTTAGAA TTAACTTTAT 420
AAGTCCAAAC ACATTTGGTT TTGTGGGTTA AAATAAGGCA TTTTATACAC ACACACACAC 480
ACACACACAC ACACACACAC ACACACACAC ACACACACAC ACACACACAC ACTACAGTGC 540
ATATACTTAA GACTAGTCAG CAGAAAATCT AGAGAAACAA ATATATATAT ATATATATAT 600
ATATATATAT ATATATATAT ATATATATAT ATATATATAT ATATATATAT ATATATATAT 660
ATATATATAT ATATATATAT ATATANNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN 720
NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN 780
NNNNNGTGTG TGTGTGTGTG TGTGTGTGTG TGTGTGTGTG TGTGTGTGTG TGTGTGCGGT 840
GTGAGCGCGC GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT ATATATATAT ATATGTGTAT ATATCTGTCT 900
CTCTCTCTCT CTCTCTATAT ATATATATAT ATATATATAT ATATATATTT TCACACACAC 960
ACACACTCAC ACACTCACAC ACACACATAT ATATTATATA TATATATATA TATATATATA 1020
TATATATATA TATATATATA TATATATATA TATATATATA TATATATATA TATATATATA 1080
TATATATATA TACAATTTTG AATAAATTTT GTATTTTAAC ATCGATTTAA ATGTAATATA 1140
TTTCTTTTTT TAAAGATGTT CTCTGAAAAA AAATATTTTT ACAAATTATT ATTATTATCA 1200
AAAGTATGAC CTATATTCAC TGAGAAATTT ATAAGAATTT TAATTTTCAA ACTGGGTTGT 1260
GCTTATGCAA TATTTCTCAG TGATATGGAC AATACACTGA ACACACTAAG AAATGCTGGG 1320
TTATTTAAAC TCAAATTAGA CTAACCCAAA TCCTGACTTA AATTTGATCC TATTTATTTA 1380
ATTTAAAAAA ATTATCCCAT CTGTCGGGTT AGTCCCTATT ACTCTCAGAA TTGGGTTGAA 1440
ATAATCCAAC AAATGGCCGT ACTTTGTTTT AATGTACAAT TAGACTTTTT GCTCAGTAAA 1500
CTACTGTTTT GCTGCTCATT AAAAGTTATT AAACTCTTCC ATCATTTACT TGTTCCAAAC 1560
CAGTTTGAGT TTCTTTAATC TGTTGAACAC AAAAGAAGAT ATTTTTAAGA ATATTGGAAA 1620
CTTGTAACCA TCTACCACTA CCATACAGGA AACACAAATA CCGGGGATGG TTACAGGTTC 1680
GAGCGTTCTT CAAAATATCG TTTTTATTAT TAGTTTTTAA TGCAATTATA GAGTAGCCAA 1740
AGCAACAGGC TTACTTTAAA TAAGCGATAT TTTAAATTAG TATGCAAGCA ATGCAACTCT 1800
TTTTTGCTTG CAGCAACCTT TTGGCTCGTT CATGCGTTGG TGGAACTTGA GCCAACACAC 1860
TTCTGTGCAA GTGCATGTCC CTCTCTCTCT CTCTCTCTCT CTCTCTCTCT CTCTCTCTCT 1920
CTCTCTCTCT CTTTCCCTCT CTCTCCATCG GTTTTCTTCG CGTTGGAATG AAGCGGGTGA 1980
CTTGCTGTTT TTCCCTGAAC TGTGCGGCAG CAGCGGCGGC AGCGGCAGCG CGGCGCGTCT 2040
GATTAGCATG CGGCAATAAT GAGGGTGAGC CGGGCTCCAT TGTTCTAACA CCTCCCCTCT 2100
CCTCCGCACC AATCTGTCAG CGTTCAGCCT CAAATGCTGC TCTCCACAAA TGAATTGGAT 2160
AATTAGTTGC CCCTCACGAA TGCTGCACTC TTCTCACCCC TGATTGCTTT CACCTTTTTG 2220
CTCCTGGCAA TTTTGACACC TCGTAATCAG CCTGCTGCTT CTCCTTCTCA ATCTATAACT 2280
TCCTCCTCCT CTTTTTTTTT TTGGAGGGGG ACTTCTTTAA TCCAAACACG GACGCGATAG 2340
TCGGATGAAT GGAGAACCCG CTTTATATAC GCGCGCACAA TGCGATCATT TGAATAATCA 2400
ATGATATTTC TGTCTTACAC TTTCGGCATT ATGCTGTCAA AATTGAGTCA ACAGCAAGGA 2460
CAAGAAAAAA AAGACAAAAA AAATAAAAAA AAACACATGG ACCCAGAAAC TGTCAGTACA 2520
GCTTTCCTCT TCCAAATAAC GAGCACTGAC AACGTAATTA TGTACAAGCA TCTGTCCACG 2580
ACTCCAGAGA GAGAGAGAGA GAGAGAGAGA GAGAGAGGGA GATAGAGAGA GATCATTAGG 2640
GAGAGAGGAG TTCATATTTG CTGCCTTTTA GAATAAATTC ATGCTTTGAT GTGAGAGATG 2700
ACAATTTGAA CGCTCTGTTT ATCCAAGTTG GGTCGTGTAT TATGCGCAAC ACATGCGCGC 2760
TTTCGACATG CAATATTCAG CATTGCAAAT AGAG 2794