EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR006-00949 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_4hpf 
Coordinate
chr9:21629147-21629987 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
CTCFMA0139.1chr9:21629618-21629637GCGCGCCGCCTAGTGGCCA-6.05
FOXA1MA0148.4chr9:21629247-21629263CCCTGAGTAAACAATT+6.75
Foxa2MA0047.2chr9:21629248-21629260CCTGAGTAAACA-6.37
Enhancer Sequence
AGGTTTACAG TATGTGGCCT TGGTCATGGT GAGGGGCTTA CAGAGCACAG CTTTATTCTT 60
CACATCCTTC AGGATCCCTC CGCCAGCGTA CGATACAGGG CCCTGAGTAA ACAATTGCAA 120
CAGTCACAAC AAGAATGGAC TAATCGTTCA TAAATCATTC AGTCAAAACT GACAGGACCC 180
TCACCATTTT GGATGTTTGG GTTGGTCCTC CAAACCCTGT AAGCAGACCA AAAAAAAAAA 240
TTTCATTTTA AGGTTTAATT TAAACATGAT GGAATGATCC ATGCAAATTT TCAGGTCCGG 300
GAGTAAAACC CTACCTAAAG CAGTGTTTTC TGGGCCTTTC TGTGTAGCCA TGTTGGGCTC 360
GTTCTGTTGG CAGTAGAAGC GCAGGAGACA CTGCTGGTCA CAGAACTGCT TTAACTCTGC 420
ACGCCACTGT ACAGACTCCG TCAGGTTCCC CTGTACCTTA CAGCAGTCAC AGCGCGCCGC 480
CTAGTGGCCA CAGGAAAACA AACAGGGATT GTAAATGACT GCATTACAGA TTTAGGTCAA 540
AGAGCATCAG CACAAGCACA CAATGGACTG GTGGCTGATA ACTAGGCCCA CACGGAATCT 600
GTGTGTGCAG AAATACACAG ATTTTTTGCC AATCATTGAC TATTTACTTG TGTAAATGTG 660
TGTAAACTTA TATTTATTCA GTTTTTAATT AATTTCAGTA ATATTATTGA CTAATATGAA 720
AATGAGAAAC TATTACTTGA CAATCTGTAT TGTAAATAAA AATTCTTTCG TTTAGTAGAT 780
ATATTATGAG AGACTTGTTT TTACCAAATA AGTGGATCTA GTTGGATTAG CATTGTAGGC 840