EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR006-00940 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_4hpf 
Coordinate
chr9:13462665-13465669 
TF binding sites/motifs
Number: 11             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
HOXD9MA0913.2chr9:13464280-13464290GTTTTATTGC-6.02
MAFGMA0659.1chr9:13463072-13463093AAAATGCTGTTTCATCACATT+6
ZNF263MA0528.1chr9:13463255-13463276TCTCTTCCTCTCCCTTCCTCC-6.08
ZNF384MA1125.1chr9:13463765-13463777AAAAAAAAAAAA+6.22
ZNF384MA1125.1chr9:13463977-13463989TTTTTTTTTTTT-6.22
ZNF384MA1125.1chr9:13463978-13463990TTTTTTTTTTTT-6.22
ZNF384MA1125.1chr9:13463979-13463991TTTTTTTTTTTT-6.22
ZNF384MA1125.1chr9:13463980-13463992TTTTTTTTTTTT-6.22
ZNF384MA1125.1chr9:13463981-13463993TTTTTTTTTTTT-6.22
ZNF384MA1125.1chr9:13463764-13463776TAAAAAAAAAAA+6.37
ZNF384MA1125.1chr9:13463982-13463994TTTTTTTTTTTA-6.37
Enhancer Sequence
TATAATAACA CAAAAGATCA TACCTGTCAC TAATGCCTTA TTGATTAACA GTGACATGTC 60
ATTTCTGGTG CAAGCAGTGA GGGAGGAGGC AGCACATTAT GTGGGACACG TTTAGATTTA 120
TAATACTTGG ACAAATGGCG TTTGTATTAG ACTCTGTGTT TCCTTAACTC CACTCCAGCC 180
TTGCTCTTAC ACTTTAGAAC CAATGTGTAA TGGAAAGACT TGAAGCACAA TACAAAGAGT 240
CTGTAATCTG TGCGTCTTTA TTCAGACAGA CCAACGAAAA GTGCTACAGA CAAATTCAGA 300
TGTCAGCGAA AGGACTCTGA ATAACAGCGG TGGAGGTTTT GAAATACATG ATTTCAAATA 360
TCGCTGAGAA TGTGATATCA CACAAAGCAA AGAATCTGTG CTAATAAAAA ATGCTGTTTC 420
ATCACATTGA ACACTTTTTT TAGATGTGTT TTGTGACTTT TGAAGGTGTG GAATTCGGGT 480
GTATACGTCT GTTGCTCTGC CGTGATCTCC TGGGTGCTTT CGACAGCTGC ATAAACAACA 540
CTAAATCCTG GGCAGCCTCT CCGCTCAGCT GGGGGTCACG ACAAGGTTTG TCTCTTCCTC 600
TCCCTTCCTC CACTGTTCTG TCTTTTTCTC TATCTCTTCC TCTCTCTCTC TCTCTCTCTC 660
TCTCTCGCTC TCTCTCTCTC TTACATACTT ATATGCAGAT TTGGAGGTGA TCTAATAGAC 720
CTTTTTTACA CATTTCCAGC TTTCTCAATG GTGTGTTTGT AGTTGGTTAA ACTTAGGGGC 780
CATTGAATGG AAAAGAGTGC GACAAGTACT TTTAAATTTG CTCAAATAAC ACAAGAAATA 840
TACCACAAAG TAAAAAGAGA GATGCTTATT GGTACTGATG GAGAGTGCGC TGACATATAT 900
CACCATTGCT ATATTCCTTT TGTTTTTGAG ATTGCAAATA TGGATGACTT TTAACAGACT 960
TTGGTCTAAA TCTTTGCTGT AATCACTTTC AATGTTGTGG AATTTTCCAG GTGATGGTCA 1020
GGAAACTGGC TTGCGGTGCA GTCACATTAG TAAAATGGTG ATTGATTGCA CATTGTCTAT 1080
TGTCAGCAAC AAATTGAAGT AAAAAAAAAA AATTGAAAAA GTAAAATTGT CATTCAGTGC 1140
TTGAACATTG TAAGGGTTTG TGTGTTTGCA CCTTTAAAAA GTTTTCCCTT CCCCCTGCCT 1200
GCACTGCCCC ACTGTGTGTA TGAGATGCTG GGCTTGTGTT CTGCGTCTGT TGTGTGTGTG 1260
TGTGTGTGTG TGTGTGTGTG TGTGTGTGTG TGTGTGTGTG TGTGTGTGTG TGTTTTTTTT 1320
TTTTTTTTAC CTTAGTAAGG AAATACTCCT CTAACCATGA TCTACATCGT GTGAAGCTTT 1380
CTAGATTCAT GATAAGTTAC AATATGATGC AAAGTTTTTT TTTCTGATCA AATAGATTCC 1440
TTTTGAAATG ACTGGATTTT GTCTGTGCCA AAATGACCCA AAATTGTAAA TATTACAGCA 1500
AGTTTTCAAT ACTATGTTAA AACTAATCTC ATTCCTAATT TTCAGCCTTG GTTAATTGGA 1560
AATACCTGCC CCAGCCTACA TTTTTGTGAA ACATAAAATA CGTTGCTCTG GGTATGTTTT 1620
ATTGCACGTT TCAGATGACA AATTCAGAGC ACTGCACGTT TTGGTGAATA CGAAATACAT 1680
TACTTAGGGT ACATTTTGTT GTACTTTTCA GATACGCGTC CATCTTGTAC ATTTCTACGA 1740
GAAGGTGGGA CTTACTTGTC ATACAGATTA CCTTACTGTC GTGGTTGTAC TATGCAGTAA 1800
AATTTGTGCA ACGAGCATTA TCAAAAATCA CACATTTCTT TACACAAAAC ACTTACAACA 1860
GGAACTGGAA CCATCAAACT GCAGACAGGA CAAGGAGTTG TGACAATACA ATACCGGACA 1920
ATGAACTAAA CACACTCACA CTCACACTCA GGGGTATAAA TAACAAGACG TGATTGAACT 1980
GATAACAAAC AGGGGAGAGA CACAGGTGGA ACTAATAAAA CTAATGAATG GCGGGAAAAC 2040
TGAAAAAAAG GAATCACATG ACAATAACAG AAATCACATG GAACACAACA CATTGGGAAT 2100
CACATGACAG AAATACAAGG AACACGACAC AATAACACCC GAATTGTATC ACTTGCTAAC 2160
CACTCACCTA AACCCAACCA ATAGTGTTTT TAAAAGCAAA CATGGGAGAA AAGTACACTA 2220
TTACAATAAA GTTTTACCTT GATTTTACAT TACTTTTATG TTTTTTGTGA ACTGTGCAAT 2280
ATGTTTGAAC TGCAACAATA TGTGTCTGTG AATATCATTA ATGTAAAAGG GAGCAAAAGT 2340
TGTTGGCGTC ATATTGCCCT GTAGTGTTTG TTTTAGTGTT TGTGTGCTTC TTGGGATGTT 2400
TTCATCCACT CTGGGGTGAT TTTAAATGTA AATTTGGTCA CAATTTTTGG TGACAAATCT 2460
TATTTTGATG CATATTTTGG AAAAACATTA TTATGAAAAT GTTCAAAAGT TTAACAATAC 2520
ACTCTGGTCA AATTTACTAA CCTTTCGTTA TGTTTATGGC TGATTTTTCC TTATTGACTT 2580
CCACGAACAT AATGAAAGGG GAGTAAATTC CTAGCAGACA CACAACATCA TAAGACATTA 2640
ATATTAGGTT AGATTTAGTT CACCAACGTC TAAGGACAAT GTTATTATGA CATGCAATAA 2700
TGAGGTAAAA TTATGTTAAT ATTTTGTTGC GTTGGAAACT GACCAAAATT CAACGTTGAG 2760
TCAACATGTT ACACCAACAT CAAATTGACG TAAAATACTG ACATTAAATC GTCGGATATG 2820
ACAACCGAAA TCCAACATAT AATAGACATC ATATTGGTGA TGTCCAGCTT TAACATCATT 2880
ACATGTTTGG TTGTTTTAAA GTTGCTTTGG AAAGTAACCA AAATGCAACG TCTGTTGAAC 2940
ATTGGACATC GACATCGGCC TGATGTTGGG TTCTGATGTC AACCTGATTT TCATTGCCAA 3000
TTAA 3004