EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR006-00938 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_4hpf 
Coordinate
chr9:13400713-13402293 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
CEBPAMA0102.3chr9:13401375-13401386ATTGCATAATA+6.02
KLF9MA1107.1chr9:13401578-13401591AGTGGGTGTGGCA-6.54
YY1MA0095.2chr9:13400983-13400995GCGGCCATCTTG-6.62
Enhancer Sequence
GCTGGACTGC ATCCGTCAAT GGTTTACAGA GCCGCTACAG TACAGGCCAG AGGTATGTTA 60
CCTCCGCAAA CCTGGAAAAA GCATGGCCGC CAGGAGAAAC TGCGTGATGA AAGGATGATT 120
TATGCAGCAC AAATACGCCG TGCGTATGGT CTGTTGGCAA ATGAGCGGGT AGGCTGTTTC 180
TGGCTGGTGG GACGGGTACG TGCTGCCGGT GTATAGAGCA AGAGGCGGAG GGATGTTTTA 240
ACAGCCTTAT GTAAACCAAC CGCGGTGGGG GCGGCCATCT TGTGTTTATC ACATGTCAGA 300
AAAAAAGCAA GGCCAGGGCA CCTCTGGGAG CTCTGCGCTG TTTGAAAGTG GCATTCTTAT 360
GTAGGATTAA TAAACAGAGC CACCCGGCGG AGTGCAAGAG CTCAATATGT GCTGCACTTT 420
AGCAGGAGGA GGCCTTCCTC TGTTTATGAC ATTTACATGG CCGTTCTGTG TTGTGAGTAT 480
CCAAAGCTAG ACTATAGCCA ACAGTAGGAT ATCAGATAAA ATAGAATCAT TCAGGTCCAG 540
TAAATTATGT ACAATTTATT GCCACTGTGC AAGTAATTTG TAATTGTGTA ATCCATTAAG 600
AATGGCAAGT AGTCTGATAA CAAACATTTT AAAATGTACT AAGTACTATA TTTTGGAGTT 660
TGATTGCATA ATACAGGTAA CATGAAATGG CTCAAATGGC TCGCACATCC TATTGGAATT 720
GCTCCGTTTT TTCTTCTTCT TCCTCTTCTT CTTCTCTAGA ATGAATCACA TTTTTTGAAG 780
GTCTAAACTA AAATGCTTAA AAACTCACAA AATATTGCAC TAGCACTAGA AGTGGCAAAC 840
ATTTTTGTTC GTTATAGATT TCGGAAGTGG GTGTGGCAAA ATGACTCGAC AGCACCACCT 900
ATGCACATTT GACGGAGTGG CCCCCGAGCC ACGTTTCACA CACACGCACG AAAATTGGCA 960
CACACATCAA ACATGAGCAG TTTTAGCTTA GCTTAGCATA GATATTTTTT TTATCGAATT 1020
ACACCATTAA CATCTCGCTC AAAAATGACC AAATAGTTTA GATATTTTTC CTATTTAAAG 1080
GTTGACTTTC CAAAGGGACA TTGTGTACAT AAGGAAAATA AAAAGTTGTT TTCTGGTCTC 1140
ATATGGCTTG GAACTATACT CTCATTCTGA CGTAATAATC AAGGAACTTT GCTACTGTAC 1200
CATAGCTGCA GCAGCCGCAA TCAGAAAATG GTAAATTTTA ACATTTTTAT TCTCGGTCTA 1260
AGTACACAAT GTGACTACAG AAGAGTCAAT CTTTGAAAAA CAAAATTATC AAAACTCTTT 1320
GGTCATTTTT GAGTGAGATG CTAATGGTCT AATAGGATTC AATGATCTAT GCTAAGCTAA 1380
GCTAAAAGTG CTCCCGGAGA TCAGCTGAAT AGATTTAATA GTCAAACTGT TTAACGCTAG 1440
AGTGGTTGTA AAATAAGCTT AATTTCCAAA AAAGTAGAGT TTTCCAGTAA CACTGAAGTA 1500
AACTTTTAAA ATGTGAAGTT TGTAATAATG TAATATTAAA AGTTTTACAT TAAATGACTG 1560
CTGTACTGTA TATTTGCTTG 1580