EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR006-00923 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_4hpf 
Coordinate
chr8:28315360-28317610 
TF binding sites/motifs
Number: 12             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
NKX2-5MA0063.2chr8:28316252-28316262ACCACTTGAG+6.02
NR2C2MA0504.1chr8:28317417-28317432CCGGGTCAGAGGTCA+7.53
Nr2f6MA0677.1chr8:28317418-28317432CGGGTCAGAGGTCA+6.47
POU4F3MA0791.1chr8:28317150-28317166ATACATTATTTATTAG+6
RARA(var.2)MA0730.1chr8:28316481-28316498AGGTCATTTGAAGGTCA+8.01
RUNX1MA0002.2chr8:28316783-28316794CTCTGTGGTTT+6.14
RXRBMA0855.1chr8:28317418-28317432CGGGTCAGAGGTCA+6.34
RXRGMA0856.1chr8:28317418-28317432CGGGTCAGAGGTCA+6.49
Rarb(var.2)MA0858.1chr8:28316481-28316498AGGTCATTTGAAGGTCA+7.62
RxraMA0512.2chr8:28317418-28317432CGGGTCAGAGGTCA+6.41
Sox3MA0514.1chr8:28316878-28316888AAAACAAAGG-6.02
ZNF263MA0528.1chr8:28316809-28316830GGGGGAGGGGCGAGGAGAGGA+6.95
Enhancer Sequence
TTCTGACCAA TCAATTGCTC TCTAGTATCT GACATACCCC ACCCCCTTCA AAATGCTACT 60
GTGATGCATG TTTGCGCTCA AACCCTCACA CTAGCAGAGT TGTAATAAAA CAAATTGCTG 120
TTGGCTGTTT TTTAAAAGCA AAGCAGCTAC TCCATGTACC ACCCTGCCTT CATCTTTAAA 180
TTCAAATGAC ATCACATATG AACTAAACAG CACATTCCAC AGGACTTGTA AAGTTACATG 240
AAACGGGACA ACTCAAGGTA AAGAATGAGC TACTTGGACA TTCTGCAAAT CATCTTTTTT 300
TTTTGTGAAA AGACCACACA AGAAAGTACG TTTAAACCAG GTATTAAACC AATGCCATGT 360
ATCATGGGTT TACTTGTACT TGGACGCTCT AGCAAAACGA TACAAACCAT AACAAATCGA 420
GTGAAGTCTA GAAAAGAGAT GCATTTAATA GATTTTAAAG CAGTGGTGCC CAAACTTGGT 480
CCTGGAGGGC TTATGTCCTG CAAAGTTTAG CTCCAACCCA ATTAGACACC CCAGAACCAG 540
CTAATCAGGC TCTTTCTAGG TATATTAGAA GCTTCCAGAT TGAAGCTACA CTCTGTAGGA 600
CATCGGCCCT CTAGGGCAGA GTTAGGGAAC CCCAGTTTTA AAGGGTTAGT TCCCCCACAA 660
ATTAAAATTC TGTTATTATT TACACACCCA TTTTATCCTG TTCCGATCCT TTGTGAGTTT 720
CTATATTTTG TTGAACACAA AAGATATTTT GAAGAAAGTT GGAAACCTGT AACCATTGAC 780
TTTCATATTA TTTGATTTCT TCTACTAAGG AAATCAATGG TTATAGATGT TCAGCTTTCT 840
ACAAGACTCC TTCTTTAGTG TTCAACAGAA AAAGAAACTC GTAAAGGTTG GAACCACTTG 900
AGGGCGAGTA AATAGTGAGT CGATTTCCAT TTTTGGCTGA ACTATCCCAA ACAGCAACAC 960
ATCTCAACTC GACTGACCGC AGATCACTAA AATCCAGCCA TACAGGTGTA GAACAACATG 1020
AAGAACTATC ACAAGAACCT TTTCTTACAT TATAATTTAA TGATAAATTA GGCATGTTTT 1080
TAATCCAGAT CAACTACATT TTAAATTCAA TGATGACTCA AAGGTCATTT GAAGGTCACC 1140
TCAGGGTTCT TCAGACAGGA AATTGTGAAA CTTCCCAATA TCCTTCTAAA CCACCATAGT 1200
TTCCCTCCAC CCTACAGATG ATCAGTGCTA ACACGTGAAT AACCTGTTAG CCCGGCTATT 1260
AAGTGTGTTA CGTCTGTGAG TGCATGCAGA AAATATCTTT TCTGATTCCT AGTTATGCTA 1320
CAACTATCAG ATTACAGATT AGCGTATAGA CTGGGGATAG CAGGAGAAGA GAGAACAGCT 1380
GGAGGTGTAA AGAGATTAGT GTGAACAGAA AGCAGGTCAC AGTCTCTGTG GTTTGAGAAG 1440
GAGTGGGACG GGGGAGGGGC GAGGAGAGGA TGCGGCAGAA GTCAAAAAAA GACAAAAACA 1500
CAGAAAGAGC AGCAAGTGAA AACAAAGGCG AGAGTAGGAG GAGGAGAATG AAAGCAACAG 1560
TGCCTCGGGA AGATAGCTGG GGGTTTGGCA GGGGGTCAGG ACCAGTTGAA AGCTGTCTGT 1620
CAAAAAAACA CAAGCTCATG CCCATTTGTC CCCCAAATGG GTTTGGAAAA AGAAATTAAT 1680
AAACACACAT GCACGCACAA CCTAAAGAAG CAAAAGTTTG TGTTTACGAA TCAAACACAA 1740
CAAAGTGATA AAGAAAGAGG AAGATCTACA GCGTAAGATA GTGGCAGGTT ATACATTATT 1800
TATTAGCATA AATTCATATA ACGATCTTTG GAGAGCTGGA GCACATTTGA AAAACTACTG 1860
AAAGCTTTCA TCGCCACAGG TTTTGTAACA ACATCATATC CTGTTCAGAT TTAAATTGTC 1920
AAATTGGAAG ATGGGGAAAG TCGACACATA CCTCCTCCAG CACAGGAGGC TCCCCAAAAC 1980
CTGTCAGTTT GACTGCAAAT TCAGGAGCCT GATGTAGAAA AGAGCATCGA ACATTACAGA 2040
GAAATTTCCA GTGACCTCCG GGTCAGAGGT CACTGATATC CCGAACCGAG ATATCACACA 2100
TTTAGTCAAT AAGAGAAAAA AAATTGTTAC GCTCCAAAAT ACTTTTGTAT TTAAAAGCTC 2160
CTTAAAAACC TTAGATAAAA AAAATACATT AAGATTGAAA CAAATCATTT ATAAAACACT 2220
TTATTTTATT TATATATTTA TTAAATGCTT 2250