EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR006-00896 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_4hpf 
Coordinate
chr8:3017488-3020642 
TF binding sites/motifs
Number: 19             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Foxd3MA0041.1chr8:3018016-3018028GAATGTTTTTTT+6.52
Gfi1bMA0483.1chr8:3019827-3019838GGCTGTGATTT-6.02
LEF1MA0768.1chr8:3019912-3019927AAAGATCAAAGACTA+6.76
LHX2MA0700.1chr8:3019544-3019554GTTAATTAGT-6.02
Nr2f6MA0677.1chr8:3018493-3018507CAGGTCAAAGGTTA+6.63
RREB1MA0073.1chr8:3018214-3018234CGCTGGGGGGTGGGGGGGGG-6.28
RXRBMA0855.1chr8:3018493-3018507CAGGTCAAAGGTTA+6.13
RXRGMA0856.1chr8:3018493-3018507CAGGTCAAAGGTTA+6.59
RxraMA0512.2chr8:3018493-3018507CAGGTCAAAGGTTA+6.57
TCF7L1MA1421.1chr8:3019912-3019924AAAGATCAAAGA+6.74
Tcf7MA0769.1chr8:3019912-3019924AAAGATCAAAGA+6.74
ZNF263MA0528.1chr8:3018219-3018240GGGGGTGGGGGGGGGAGGAAA+6.05
ZNF384MA1125.1chr8:3019742-3019754TTTTTTTTTTTT-6.22
ZNF384MA1125.1chr8:3019296-3019308ATAAAAAAAAAA+6.27
ZNF384MA1125.1chr8:3019297-3019309TAAAAAAAAAAA+6.37
ZNF384MA1125.1chr8:3019743-3019755TTTTTTTTTTTA-6.37
ZNF384MA1125.1chr8:3019745-3019757TTTTTTTTTAGA-6.52
ZNF384MA1125.1chr8:3019295-3019307AATAAAAAAAAA+6.62
ZNF740MA0753.2chr8:3018223-3018236GTGGGGGGGGGAG-6.52
Enhancer Sequence
ATTATTATCT TTGTGATTAT TATTATTAAT AAGAGTGATA GTAATAAAAG CAATAATGAC 60
TGGACTAATA ATTTCATTTA GAACTACATA CAATAAGAAA ACAGTTATTT AAAATTGTAA 120
TAAATATATA ACAAACTTTT GACCGGTAGT GTACATATTT AGAAACATAA ATATAATATT 180
TTAATAGGTT TTTAAAAGTG ATTTAAATTA GATAGTGATG ATGAGATTCT AATCTCAAGT 240
AAAGGATGAG TAAATGATGA CAGATTTAAT TTTTGGGTGC TTGTCCCTTT AAGTAAGCAA 300
CTATATTCAA ACTTTTTTGT GTGTGTGTAA TGATACATAT TTTAACACCT TTTTAACTCT 360
TTATAAATTC CTTTTAATTC CTTTATTATC TTTTTTGTTG ATGTTTTATC ACTGTTATTT 420
TGTCAAATTC TGCATGCCTG TGTCAAATTC CTCTTATGTG TAAATATATC TGGTAATAAT 480
TCTCAATCTG ATTCTAATTC TTAATTTTTT ATTTTATAAT TTATTGGAGA ATGTTTTTTT 540
TCCCCTCCGT GCACCACTGT AAACATTGCA ATATCACACA TCACGGCTAA CGGCAATGTT 600
TTGTGTCTTT ACCAGCTATG TTATGACTCC CTTGATGTTT TACAAGTGAC ATTTGGGTGT 660
TGTGTGTTTG TGGGGGTTTC TGGAACGCTA TACCCAAAGA ACACTAAAGC TGTTTTGAGC 720
TACAGGCGCT GGGGGGTGGG GGGGGGAGGA AAAAACAGGC TGAGTTCTTA TACTCTGGCA 780
TTGACCAGAT CATCATCCAC ATGACTTTGA TCAACTCTAA GACAAGGGAA AAAAAAACAA 840
GCCAGCTGTT TCCTCCGTGT GCACGTACAG TGATGCACCC AACAACTTCA CAACATGTCA 900
TCTGTCAGTC AGCCTCGTAC CGCGGAGCGC CACAAAGAAA ACTCAATCAG CCGCGGGAGC 960
CTCTTTTTGT CTGCCAATTC TGAAACTTTC ATGCTCCTTA TTTGTCAGGT CAAAGGTTAA 1020
ATTGCTGACC CTCCCTCTCA ATCCCCCCCC CCTGTGCTCT CCATAGCAAA AACTCTATCT 1080
ACAGAATCCC CATATTTACA TGGATTAGAC TTCTTTCACG CTGGAGAAAG AAATCTGGTT 1140
CATAGTCAAA GCCCAATAAC GTCGCCGGAG TGGCCATGTT ATTCACCGCC GGACAATGAC 1200
CATATTGTCG GGATCTGAAA GAGGAGGGTG GGTGGAGGGG AGCGTCCCCG CTTTTGGCCC 1260
GTTTTAGAGC GGACAAGTTG CCCCCACCTC CTCGAATCCC CTTCTCTTTT CGTCCGCGGT 1320
AAAGTCCTGC GCTTGTGCCA CTAGGCTCAC AGGGGCAAAA CCCCATCCGC TCTCCTGACA 1380
AGAGCAAACA AAGCCTGCCC ACTGTGAACT AGATGAAGAT GTCAAAAGCT TTTAGGCTGG 1440
TTGGTGGAAG GAGGGGGCGG CGGTGGTGGT AAGACAAGGT TTAAACCAAC AAAACCATAG 1500
AAAAGGCCCT TTTCACTCCC ATGGATAAAT CCCACTAAGT CTACGTTTCC ACATCAGCTT 1560
TACTTTCCCC CGACAACAAT CCAGCGACTC AATAAAATGA TCAAGAACAA ATAAGCGAGG 1620
CCTCGGAGAG GACGGGGGCC ACTGATTTAG CAAATAGACC ATGCCGAGCT AATCAGAGGA 1680
GAACAGAAGA GCTGATACCG TATAGACAAT TTACATCGTT TAATCCAGCG TGAGCTGCAA 1740
CTTCTGCAGG AGGCCAAATC GGGGCGCAGT ACAGGGGTCA AGCTGCTGTC TGAAAAAAAA 1800
GAATAATAAT AAAAAAAAAA AGTTGTAGGC GTTCGTACCA AAGCATGACA CTTTGTTATT 1860
TATAGCAAAA GTTTCAGAAA GCGAATGTTG GAAGACATTA GAGCATTGCA TGTCACTATG 1920
ATGTTCCTAG AGAACTTGTT TACTTGTGTT ATGTGCAGCC GCACACACAC ACACACACAC 1980
ACACACACAG CTACTCACAG GCGCTTTCAC ACTCTGCTTC TCCAGTGGTG TTGAGAACAA 2040
ATGAGAGCTG TAAGATGTTA ATTAGTGTTT CCTCCTGTTC GGCAGGCCAG GGGTCTGAAT 2100
GAAGAGGTCA ACGCTATCTG TGTACCTAAG GCTCAGACAA AGACAGAACA CATTGTCTTT 2160
GACCAGCCAA GGCTGTCAGC GAGCAGAGCA GGAGGCCGCC GGCACATTTA TGCTCGGGAA 2220
TATTTTTGCA ATTAAACACA CGCTTCTCTG TCCATTTTTT TTTTTTAGAA AGGAATGGGA 2280
AACCCATCTC CTCCACGTTT CCTCTCAGCA GAGCTGCTGG TGTTGTAAAC CGAGTCGCTG 2340
GCTGTGATTT TAAAGACAGA ATCCTTAAAG ACGGTCTTTT TTTTACAGCA TGTCAGGACT 2400
GGATGTGAGC ATTTTATGGA TGTCAAAGAT CAAAGACTAT TCATCTACTT TGGGATCCAG 2460
CATCCCGGAT CTGGATAACA GTGACATTAG CACGCACAGG AAGCGTTTTT CTGTAAGTGT 2520
TTACTTTTAA ACACAGCTTT CTCTTCCAGG CCAAACCAAT ACTGGGAAGT AGGAAGCATT 2580
TAAAGCGCAA AGCCTTGTCC CTTTTGAGGA CTCAGTGTAT AAAGCAGACC AGAGTGGAGA 2640
CTATGGCCCA TTCAGATGTT AATACATACA CCATTCCACT GACTCTGATT AACTCCATGT 2700
GAGTTAATAG TTGCCCTGTT AACAAAGAGT TATCCTCCCA TTCAAGTTGG CGGTATGTTT 2760
AGGAGGAGAA AGGCTAGGAG AGGGAACTTG TAGTGAACCT TTACAGTACA AGCCCCTTCA 2820
GGATATAATA CAAGCTCCGT CTCCTCTGGC TAATCCAGCC TGCAGATGCT GGAAAGAAGC 2880
TCACTGCTCT TACAGGGACA AATAGTCAGA GAAAGGATGG AGGCAAACAA AAGAAATGTT 2940
CTCTTTTTCC CCCCGCGGGT CTAAACTGAG CCAGAGGTTC TCCAAAAGTG TGGGACAAAA 3000
CCCAAGCAGA CAGGCTAAAA GCTTATGGTG CTTTGGAAAG CACTTTTCTG TATGTGAGGT 3060
TTATCCTCAT GAATAATGAT TGGACGGACA AACTTCTCAA AGAATCTTCG GACAGAGTTT 3120
TGGGATGTTT AAGTTGTAAA GCAATCAATA AGGC 3154