EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR006-00856 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_4hpf 
Coordinate
chr7:40346496-40348834 
TF binding sites/motifs
Number: 5             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
GSX1MA0892.1chr7:40346903-40346913TTTAATTAGG-6.02
SOX13MA1120.1chr7:40348224-40348235TGCCATTGTTT-6.62
Sox11MA0869.1chr7:40348628-40348643AACACTGAAAATGTA-6
TBXTMA0009.2chr7:40348005-40348021TCACACCATGGTGCGA-6.32
TBXTMA0009.2chr7:40348005-40348021TCACACCATGGTGCGA+6.34
Enhancer Sequence
GTAAAGATGT GGGGATATAG ATTAGGCAAT CTTTAATGAA GATAGCAACT TTATTGAAGG 60
GGTTATAATT TGGCAGGGGT GGAAAAAAGT GAGACAGCAG TAGTTCCGAG CGTTTAATAA 120
TTGGGGGAAG ACGCTACTTC AACAGCACAT TGACTGCATG CCGAATAATT TCCCACTCCA 180
ATAGACTCTG GCTTTCATGG TGACAAAACT AGAGACATGG TCGCAAATAT AGGTAGGCCT 240
GGTGGCCACC CACAGTTTCT AGACAAACTA GACATGTGAA GAGAATCAAG GCATTATTTC 300
ACTTGTGTTA CTTAAAGCCA GGCTCACAAA CATCACAATA CCAATCTGCA AGAAATGTTA 360
CACTCGTCAG TGATGCCTTA AATAGGTTTG GTGGAGATAC TGTACATTTT AATTAGGGTG 420
CTTTACTTTT TATGATTTGA AATTCGATCA CGTATAAATG AATAGAGCTC TGATTTTGTA 480
GGAAAAAAAA GCACACACAA ATAAAATGTA TATACAATTT GATTTGATTT ACAATAATAC 540
AGGTTTACAC TACTGTAAAT CTAAATGTGC TAAATATATA ACGGTTAAGG AAACTGTGGT 600
GCTAATGATA AACAAAGATT AACAAATATT ATCCTGCACA CTACTGTGCT AAAGAACACG 660
ACAGGTCTCG TCTCCCAACA CCTTATTAGT AAATTCTGGT TTGCATTTCA AAGAACCTGA 720
AATGGCTGAA GATCTTTCTA GAAAATAAGA ACAAGTGAGA AGAGGGGAAC ATGTTTTGAT 780
TTTTGTTTCT CTGTTCTGTT AACAAAACAA AATTCTATTG TGAACCGATG CTTATTTAAA 840
AAGCTCAGCG GTAACAATTA ATTTTTTGTT ATAGAGAGAT GTACCCTATT TTTGATTTAT 900
ATTTATATTT TATTTAGATT TATATTTATT TATTTGTATT TTATACTTTC TTTTTTTTAA 960
GCAAACAGTA AACACTTGCT AATATTAAAT CAAATGAAAG TTAGATCATT CAATTGTTTT 1020
TCCTGTTGTT GTTGTTTTTG AGGGGTTGGC CAAAGTATCT ATATGTATCG ATATTGATAT 1080
CAGTGTCAGT TACTAAACTA TTCAGCAACA CTTTCTAAGG TGTCACGAGA ACAATGCTCA 1140
TCTCTGGATG TTCAGATAAC CACATCTCCT GCCCATAAAA CCTAAACTTC CCAGATCTCT 1200
AGGAGGACTC ATAAAGTGGG AAAAATATAA ACAAGCCAGT GAGCTGGAAT TTCTAGTCTT 1260
TGTATGTGAC CACAGGAAAG ATTAAATGAG CCATTAAGCT TTATTTAGGT GAGGCACCTT 1320
CCATTAGTAA ACTAGCAGAC GCTTCAGGGT CGTAAACAGA CCAGTGGTTC CTGTGGGGGC 1380
TCCATTTAAG TTAATGACGA CCGTGGAGAC AATGTAGCAC GACCACAATT GCCTGACCGT 1440
AGAGGCAGTG CTGCTATCAC AGATTAGGCA CTGTGCTTAG GTCACCCAAA TCATTAAAGC 1500
TAACAGTCGT CACACCATGG TGCGAGAAAT CGCTCCGGCG ATTACAGCAT GGTTGTTTTG 1560
TGTCAAGGGG TGAAAGAATA AATAAAGCAT AATTGAAAGT AATTAGGAGT GAAAATAAGA 1620
TTAAAGCTGG TGTACAACAA GCATACAAAG CACTTCTGTT TACAGTAGTA TAGACATTTC 1680
CTCCCAATAT GTTGCAGTAA ACTGATTTTC AGCCAAAAAT GAAAATGATG CCATTGTTTA 1740
CTCATCATCC ACTTGTTCCA AACCTCTTGA GTTTCTTTCC TCTTTTGAAC ACAAAGGAAG 1800
ATATACTGAA GAATGTTGGA AAGCAGCAGT CTTTGACTTA TGTAGTATTT TTGTTCCTAA 1860
GATAGATGAC AATGACTGCT GGTTTCCAAC ATTCCTCACA ATGACAAAAG AAATAAATAC 1920
ATCAAATTTT GTGTGAGGAA ATGTAAAGGA AATTTTCCCT TTTTTGGTTA ACCATCCTTT 1980
CATCGTCAAG TTGCAATGCT GCAACAAAAT TTACATTTAT ATTTAATTAT TCAACAAGTG 2040
ACTTAGAAAA GATGCAGACC AACAAAAAAA AAACAACAAC ATGGAAGTGA TATCATGTCA 2100
AGGGTCACTC TCATTAAGAA ACGGGTGTAA CAAACACTGA AAATGTACAA CCATGTGACC 2160
AGTTACTAGC CCGAAATGTA TATTTAAATA CATAGACACT GAAAAAAACA CAGACCAAAT 2220
CTTAAAAAAA TAAATCATAA ATAAAATAAT CACAGGCCAA AAAAGAAAAT ACAAAGGCAA 2280
AAAAGAGGCT ACAGATTGTG CTGTTTTCCC AGAGACATGG GAAAAATTGA TGGGGAAA 2338