EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR006-00808 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_4hpf 
Coordinate
chr6:35090394-35092718 
TF binding sites/motifs
Number: 8             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
ALX3MA0634.1chr6:35092332-35092342TTTAATTAGA-6.02
ARGFXMA1463.1chr6:35092332-35092342TTTAATTAGA-6.02
Alx1MA0854.1chr6:35092226-35092243TGTACTAATTAATACCC+6.07
POU3F1MA0786.1chr6:35090608-35090620TAATTAACATAA-6.04
POU3F2MA0787.1chr6:35090608-35090620TAATTAACATAA-6.07
POU3F3MA0788.1chr6:35090608-35090621TAATTAACATAAA-6.15
ZNF24MA1124.1chr6:35091568-35091581AATTCATTCATTA+6.17
ZNF384MA1125.1chr6:35090582-35090594ACTAAAAAAAAA+6.32
Enhancer Sequence
ATATTTATAA TAATGCTTAA AGGCCTTTAT TGACTCGAAT TTAGAGAATT AAGTTATTTG 60
GTAACACTTC AAAAGGCTGT AATCGTGGCA TGAATATGAA TGAGATTTTC TGCTTGCTTG 120
ATAACCGTCA TTAAGTGTCA TAAGTGCAGT TGTCGTTTTA AATGCAAAGA GGACAAAAGC 180
CATGTTTAAC TAAAAAAAAA TGTAAATAAA AAAATAATTA ACATAAAATA TGTGCGACTA 240
AAGCAGCGTT TCCATCCATG TAGTCAGAGA GAACTAAATC GTCACATCCT GATTAACTGG 300
CGCCAAATGT CAAAAGTAAA AATGGAATTT GCTGCGAAGG GAGAAGTTGC ATCAATTTTT 360
TCCTTATTTA ATAAATGACT TGCACATCAG AAGACGATGC CGACACGCAA TGGAAGCGTT 420
GTGGCATTTG AAGGCATCAG ACATGGAGCA TAGATGCTCT TGACAATTCT AAAGGTAATT 480
AATAATATAA TAACACAAAT ACTGAGATGG TTAGGCATTT TAGAATTACC AAAACAACAT 540
TTCAGATGTT TTACAATGTG CTCAGCCTGC TGGTTTGTCC ATTCACACAC ATTTTTATCA 600
TTACGTGATC TCTTATAACA AAATCACATG ACTTTTTTTA ATGTGCATAC TGGAATTTGT 660
TCGATAAAAG TGTTTCCATC ATAGTTTATG CACATCTTTT CTTATGGAAA ATAAGTTTAT 720
CCTACTCAGT TATGCACACG TTTTTTCTGC ACATTTTCAA AATGTATGCA CATCTCGGCG 780
CTTCCATCAA AATGCATATC CAAAATGCAC ATAAAAATAG GTGGATGGAA ACGTAGCTGT 840
TGTTTGAGAT GACTTTATGA CAACTTGACA AAACTTGAAA ATTCATCATA ATCTGACTTT 900
GTCATGACAA CTTGACATTA CCAAGACAAC ATAACTTGTT ATAAATTGGT CATAATGATG 960
ACTGTCATGA GGCTACTGTA ATTGTGTCAT GAACATTTTT CTAATCACTT TTATTCAGTT 1020
TTTTATATTT AAAATTTTCA TTAAGGTATA TCATTAAATG AGTTAGTACT TTGTCAAATA 1080
TTGAATAAAG CGTCATAATT AAATTTAATG ACATTCAATT TGTACCACTG CAGTTACACT 1140
GTAGTAAGAC TGTTTTAAAT TCAGGAATTT TATGAATTCA TTCATTAATT TTCCTTCGGC 1200
TAAGTCCCTT ATTTATCAGA ATAAATGCTC TGCTTATGCG CGCCTCAAGT TTTGCCGTTG 1260
CGCGCTGTGT GCTCGAGCCT TGAGCGGAAA AAGCGTGTTA CCTCAGTCTT TTAATAGCGC 1320
ATGTCTTTAG ACTGTGGGGG AAACTGGAGC ACCGGAGGAA ACCCACGTGA ACACGGGGAG 1380
AACATCCAAA CTCCACATAG AAATGCCAAC TGGAGCAGCC AGGACTCGAA CCAGCGACCT 1440
GAATTTCATG AATTTAAGAA TTAAATTGTT TATAAAATGT TTTCATTTTA ATTTTTTAAT 1500
CATTTAAATA CAAAAGTATT TATTAATAAC TTTTTAAAAA GTAACTTAAC CAAAACTGGT 1560
CACAGTGCAG AACTCATGCT TATTTAGCCA CAGGTGTTTT ATAGATGCAT GTGTATATCG 1620
TCAGCACAGA GATAAATGCT CAGCTTTCCA GAAGGCACTG ATCCTGAACC TCCTCTGCCA 1680
TACATATTCT GAAACAAGAT TGTGCAGTCA TGCATGGATC TCCTGCAAAT GCAGGACGGA 1740
AAGGTTGTAG CGCAGGTTTA CATTTACTTT CAAGACCACA AATCTTTCAC TTTGCTTGAA 1800
TGGGAACTTT ACTGTTTTTT CCCAGAGAAT CCTGTACTAA TTAATACCCC CTCATTATGA 1860
TAGGCGTTCT TTTATAATTC ATTCAGCTGA CACTGTTGGG AAACTGCTTA CCTCAATGAA 1920
AGCCCCATAC AGGGCCCCTT TAATTAGACT GCAGTAAATT GCTGAAGCTT TAAACCCGGC 1980
AGGGATGTGG AGCTATAGAA ATCCGCAGGA CCCTGTGGGG GTCTTTGGAA AGCAGCCAAC 2040
AAGAGAGGAT ATTTACTGTC CCAATCTGAC CAAAAACAGA CAACAAGAGC TGAAAAACTA 2100
AATGTTGAAA TGGCATTGTC TTCGGTTCAA ACTTTCTGAA ATTTCTTTTA GTTTAAATAT 2160
TGTAACTCCC TATATAGAAA GAGAATTAAA ATATTAAATT GCCACCCAAA TGAAACACTA 2220
TGCAGCATTT AACAATTGAT ACAACAATGA AATGACCAAA CTAAAAAAAA CTTTAAAGGA 2280
TACCTATTTT ACCTCATTTT TTAAGATTTA AGATAAGTCT TTTG 2324