EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR006-00804 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_4hpf 
Coordinate
chr6:33506165-33507402 
TF binding sites/motifs
Number: 12             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
DUXAMA0884.1chr6:33507323-33507336CTGATTACATTAA-6.04
Lhx3MA0135.1chr6:33507333-33507346TAATAATTAATTA-6.18
Lhx3MA0135.1chr6:33507336-33507349TAATTAATTAATG+6.46
POU4F1MA0790.1chr6:33507331-33507345ATTAATAATTAATT+6.36
POU4F1MA0790.1chr6:33507330-33507344CATTAATAATTAAT-6.37
POU4F2MA0683.1chr6:33507331-33507347ATTAATAATTAATTAA+6.34
POU4F3MA0791.1chr6:33507328-33507344TACATTAATAATTAAT-6.19
POU4F3MA0791.1chr6:33507331-33507347ATTAATAATTAATTAA+6.78
POU6F1MA0628.1chr6:33507338-33507348ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr6:33507338-33507348ATTAATTAAT-6.02
POU6F2MA0793.1chr6:33506533-33506543ATAATGAGCT-6.02
TFAP4MA0691.1chr6:33506427-33506437ATCAGCTGTT-6.02
Enhancer Sequence
TGCTCTCAGC AAAGGCTTTT AATGCATTCC AGGGGTCTAA TTCCTCAGTA TGAGGGGGCT 60
TTGGGGAAGA ATTGCCCTGT TATGTAAGAC TGAGGCTCGC GCTCTGAGCT GGGAAGAAAG 120
AAAGAGGCCG TGAGATTGAG GTCTGCGCTG GCTGTGAGCT TTACATCGGG TGAGTGGTAA 180
AGTAAGGCTG ACGCACTTTA AGCTGATTAA GGGTTAGTTA GGTCAGTGTC CCGGTCTGAA 240
CTAGAGAGCG GGGGAGGGGG ATATCAGCTG TTCCCCCAGG CGGTAAATGA GCACTGCCTC 300
GTCCTACCAG ACCACAAGTC TCTAGGGCCA ACGGGATGTG ACCCACATGG AGCACTGACG 360
CCAAACACAT AATGAGCTTG GAAGGCTGTG TGTATGAGAA AGAGAGTGAA TTATGGCCCG 420
TGCTTATGTA TGTAATCTTT TAATATGAAG GTTAGGTGTG TTAAAAGGAA CCCTCGGCTA 480
CTCATCTAAA AATACTGACA CGATGCCACA TTATTTAGCT TTTGGCACAA CAGAAGCAAG 540
TAAAGTGTAC ACTACCTTTG ATTTTTCTCC ACAATGAATC TAAAAACCAC TGGATATCAA 600
ACAAAATCCA TACTGAAAAT GTTTGATATT GATGAAATAG AAAAAAACAT GAGCTGTTTG 660
ATGCTGAGGA TGCATTTCTG CATCAGTCAT AACTATAGTA TATTGTACGC TTACTGACTG 720
CAGTGAATCT GATGAATCGG CAAGCCTCTT CATGAATCTC CTTTTGTGTC TGACAATCTT 780
CAGCATGTTT ACTTCCAGCA CAGATTTCAC TCGAAATCCA GGATGGTTTA GGCTCCTTGT 840
TGGGGGAAAA TCGATGGTAG GCATTTGGTT TAAGCCTACA CTTATGTCCA TCACCACCTG 900
TAAGCTCTTT CAGTAGCTGT GGTCTGCTAA AAGCCTCAAA GGAATCAGGG CTAGTGGAGA 960
GAACATGGAT GGGAGTCTTC AGAAAGTTTT ATTTGTTCAC AGGCATCTTT CCATTCTCTT 1020
TTCCTTATCA TGTGGAAGCC AGTGAAGACT TAATAATTAT AACAAAAAGT CACATTAAAT 1080
GTTGCCTCCA GTGTTGGTTA AGTTACTTTA AAAAAGTAAT AGATTACAAG TTACTGACTA 1140
CTACTCAAAA ATTTTAATCT GATTACATTA ATAATTAATT AATGTAAAAA GGAATCAGAT 1200
TACTAATTAC TTTACTTTAA AAATAATTTT AAAACAT 1237