EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR006-00791 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_4hpf 
Coordinate
chr6:16034726-16036559 
TF binding sites/motifs
Number: 18             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
BACH2(var.2)MA1470.1chr6:16034882-16034902AAACCATAACGTGATCCGAA+6.04
ESR1MA0112.3chr6:16036229-16036246GGGGTCAACTTGACCCT+6.05
ESR1MA0112.3chr6:16036229-16036246GGGGTCAACTTGACCCT-6.11
EVX1MA0887.1chr6:16035430-16035440GCTAATTACC-6.02
EVX2MA0888.1chr6:16035430-16035440GCTAATTACC-6.02
KLF9MA1107.1chr6:16036253-16036266CCCCACACCCACA+6.02
PHOX2AMA0713.1chr6:16034737-16034748TAATTAAATTA-6.62
PROP1MA0715.1chr6:16034737-16034748TAATTAAATTA+6.32
PROP1MA0715.1chr6:16034737-16034748TAATTAAATTA-6.62
Phox2bMA0681.1chr6:16034737-16034748TAATTAAATTA-6.62
RARA(var.2)MA0730.1chr6:16036239-16036256TGACCCTGACGTGACCC-7
SP2MA0516.2chr6:16035608-16035625ATCAGCCCCCCCCCCTT+6.6
Sox3MA0514.1chr6:16034959-16034969CCTTTGTTTT+6.02
ZNF384MA1125.1chr6:16036531-16036543TTTTTTTTTTTT-6.22
ZNF384MA1125.1chr6:16036532-16036544TTTTTTTTTTTT-6.22
ZNF384MA1125.1chr6:16036533-16036545TTTTTTTTTTTT-6.22
ZNF384MA1125.1chr6:16036536-16036548TTTTTTTTTAGT-6.32
ZNF384MA1125.1chr6:16036534-16036546TTTTTTTTTTTA-6.37
Enhancer Sequence
ACAGCAACTA CTAATTAAAT TAATGAGTAT TTGCTGGAAG AAAAACATTA CTTTTTATTA 60
AAACATACTA AGCGTGCACA ATATATGGTT TCAGCAGTGC CGGCCTGTCC AACAGGCAAT 120
ATAGGTCGTC GCCTAGAGGT CCAATCCGTG ACTAAAAAAC CATAACGTGA TCCGAATTGT 180
GATCGGTTAC ACCACTAATT TACTGCAGAT GGAATGATTT CCATGGAACA AAACCTTTGT 240
TTTTAGAATA CTGTTAGTAT TAAAAAAATT AAGATTTAAT TTATTTTTAT CTGCTTATTG 300
AGAGACGTGC TTGTGTTGCT CAATTCATAT GTTAATTGAG TTATGCTTCG CAATCAAAAT 360
TGGGCCCAAG AATCATGCAT TTTCCGCAGA AAGCTTTGCT AGTGGGACAG TCCCACATCA 420
GCAGCAACCG ATTACAGCAC CATTTCGTTG TCTCGAGGTC TTTTGTAAAT GTCTTTGCCT 480
CAAATGGAGT CTCTCTGCAA TATTCAAACA CAGCTAAAAG ATCAGCAGCT TGGCTTTTAA 540
ACGGCAACTG TACAGCGCTC TGGACGACGG AAGAGCTGCT CCACTGCGGC TTGCTAATAA 600
ACACAGATCT CACTTAAAGG CAGCTTTAAT CAGAGATGCA ATTTGTTCAT TAGAAAATTA 660
CAAACAAGGC CACGGCGCTG ACATGAGAGG GCACGATTAG TGCCGCTAAT TACCTGATTC 720
TTTCACTCCA GCTGAGATGC GCAGAGGATG ATCTCGCCCC CCCGCCACAC GCTCTCCTTT 780
ACTCTCTCGC TACACGCTCT TGTTTGTGAC AAATTAAGGC CAAGTCAAAC AATCTCTCCC 840
ATGGTGCAAT GGAGGGGGTC TTCTTCACAT CACATTCTGC TTATCAGCCC CCCCCCCTTT 900
ACCCTTCGAA GCACAGCACT AATTCAAGGC TTTCTGGGGG GGAAAGATGG ACCCGTATGC 960
AGATTGGTAG ACTGCACTTC ATTAGGATCC TCTTAGCTTT CTTCTAGCCC ACTTTTGACG 1020
GTGGAAAAAG AAGGTGGGAG AAGGAAATGT GGAAGGGGTT TTGGCTTGTG GGGGAGAAAA 1080
AAAATCCCTT CCCACTTCTT ATCCTAATGA TCTCATTTCT GCACACGGGA GAGCCTGGAT 1140
CTAATTGATG TCAAGTGCGT GCTTTCACTG TTAATCAAGA CGATGGCATC AAACGCGTCC 1200
GAGTGCTGAT CTGAGGCCTG TTCGTCCACA ATAGACCGCT GTTGGACTCC AATTATACCA 1260
GCCCAGACGG CCGGCCAGAC CCTACCTGTT TAATTGGGAT AGCGCGGCCA CTTCCAATGC 1320
TGTCTGCGCG GCCATCCATC CCTTTCTTCT CCCTGTCTGG TTCGCTTCCC TTGCGAGACT 1380
GTGGGGGAGA AGACATGATT TTAGTCAAAG ACGAGCTGGC TGTTAATTGA GCCCGACTTC 1440
AGCCTGGATT CAGTTTGGAG TGCGGGGCTC TCACACGACT TCAAAAGTCA AGGGGGTGTG 1500
GGAGGGGTCA ACTTGACCCT GACGTGACCC CACACCCACA ACTTCTTGAA AGGAAAACAT 1560
GTGATGGATG TGCACTACCA TTAATGTGAA CTACTACGTT TAGAAAGTTT AATGATCATT 1620
CAGTTCAACA TTTTTTAACA AAAAAAATTT AAATAAATAA AATAAATAAA TGACAAATAT 1680
ATTTATTGGT GAATGACTAA CCTTTGTATA ACATTTATAT TATTAAAGTC GGACGAGCAT 1740
TTAAAGGTTT GAGGCCTGTA AAATAATATT TTAAAAAGTG ATTTAATCCA GTGATTGTGC 1800
GCTCATTTTT TTTTTTTTTA GTAGCTATTA GTC 1833