EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR006-00771 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_4hpf 
Coordinate
chr5:56168490-56170314 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
DUXAMA0884.1chr5:56168646-56168659CTAATGTAATCAA+6.37
POU4F1MA0790.1chr5:56169878-56169892ATGCATTTTTAATG+6.43
POU4F3MA0791.1chr5:56169878-56169894ATGCATTTTTAATGTA+6.2
Enhancer Sequence
AATTATTGTC AATAGTAATT ACAATGTAAT AATGGTGTAA TTACAAGCAA GATAAACAAA 60
AAGTAAATTA ATTTACATAG TTAAATAAAT ATAAATAAAT AACTAAGAAG TGTATGTTTT 120
GTAGCTTAGC ATGTTCCTGC TAGTTTATCG ATGATGCTAA TGTAATCAAG CAGCATATAC 180
AATCACTAAG TTAGCAACTA TAAGCAAGGC ACACAAACTT TCAATCACTA ACTTTCCATT 240
AAAATATTTT GACATGAAAA AAAAATGCTA AAAACAACAA AGGCTGATAC TGTTAATATG 300
AAACAACGAC AAGCACAACT CATCAAACAT CAGAAAACAA ACTGCTAAGT AAGCTCATGA 360
ATGCATATTT GCTTTGCGCT AACTGATCCT AAAGGTGATC TCTGGTTTAA GTTAGACTCA 420
GTCGCAAACA ATCACTGGAT TTCAAAGTGA AAGGTGACCC TCTTAGCCCA AGGTGCAACA 480
TTAAAGAGAT GTTTAGGTGT GCGGCGTGTG CCAGGCGGGC CTTTATGTAC CCACGCGAGC 540
TGAGGTCAGA GCAGCTACAG CTGTCAATGC AGCAGAACAA GGGGAGTCAG GCGGCCGCGC 600
AGATAAGCCG TGGATACCAG GCGCCCCGCG GACGTCCTTA TCAGCTCTCC ACTGCACTCC 660
AGGACAGATA ACGGCACTCT CCGGACGCTC GCTGTACTCC CTCTCATGTT TACTGAGCCA 720
CATCAAAGCG AGCCGACCAG TCATGTTAGT CATTGACAAA TTAAGCAGAG ACTCATCTGG 780
TCCGAATGCC CCTCCACTGC AAACTCCACC CCCAATGTTC CTTCTTCTGG AGCCACTGCG 840
CAGGCCGTCC GGTTCTCTAG CTCTGCCCTG AGGTGTTCTG CACAGTAATT ACTCCTGGGT 900
AATGACAGCC AACACTTCAG TAGGTTGTAA ACGGCAGGAG GCTTGTAAAG AGGCTGTGAC 960
CGGTGGAGGC GTGAGTGTGC TGGGGTGAAA CTACAACAGC AGGGAATCAG GCCCACCCAG 1020
TATTCTCTAA TGCACTCCAA ACAAGCTCTA CTGTGTATTG TTTTACATTA GGATGTCAAA 1080
AGATGAGAAA ATATTGAAGT ATTTTATGAA TGTGTATATG AATATGTATA TCGTCATTCT 1140
TTACATCAAG TGTTTTTGTA TATACACTGT AAAATGCTGA GTTTCTTCAT GGTTTCCCAA 1200
CACAAGTCGA TTAAGTTACC CAAATATTTA AAAGTTTTTA AAAGTTTAAG TGGATTGAAC 1260
TTAAAAACTA AAGAATTAAT CCCATCCAAA ATGAAAGTTT GTTTTGTGTA TATGAATGCA 1320
CACAAGACAG GTAATACACA TTAATACATA AAAATACACA CATTATTCCA TATATTTAAA 1380
AAATATTTAT GCATTTTTAA TGTATTTATC TATGTGGTGC AAATTATATA TACAGTATAT 1440
GTAAAAATCT ATGCAACAAA ATTGTATAGT TTTGTTTCTA TGTATGTATG AGCATGACAT 1500
ACAGTATACA TAACAATATA TAAATAAGGC CGAGAGAGCT CAACGCACTG CAATTTAAGA 1560
AAACACATGC AATTACACAA TAAACCAGCA AATAAAAAAA ACTATCTTCA TCAGTTTTAC 1620
AGCACATATG TTGAAAATTG GCCACGACAC AAACAATTTA AGAAACGCGC AGCAAACTGG 1680
TCACAACACT TGCAAATATC CACGTAACGC AACGAAAATG TTTCCAGAGA ACACAAAAGC 1740
ATGACGGACC CTGCTGAAAT GCGGATGTGT TATTACAAAG TGACTGTTGT TCAGTGAAGT 1800
GATTGGTGGT CTTTGAAAGG CAAG 1824