EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR006-00767 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_4hpf 
Coordinate
chr5:48988135-48989569 
TF binding sites/motifs
Number: 13             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Lhx3MA0135.1chr5:48989370-48989383TAATTAATTATTA+6.18
Lhx3MA0135.1chr5:48989367-48989380TATTAATTAATTA-6.25
POU4F3MA0791.1chr5:48989369-48989385TTAATTAATTATTAAG-6.19
POU6F1MA0628.1chr5:48989368-48989378ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr5:48989368-48989378ATTAATTAAT-6.02
RREB1MA0073.1chr5:48989050-48989070CCCCCCCCCCCCCCCCAACC+6.06
RREB1MA0073.1chr5:48989051-48989071CCCCCCCCCCCCCCCAACCA+6.16
RREB1MA0073.1chr5:48989057-48989077CCCCCCCCCAACCACCCCAC+6.62
RREB1MA0073.1chr5:48989061-48989081CCCCCAACCACCCCACTCCG+7.62
ZNF740MA0753.2chr5:48989050-48989063CCCCCCCCCCCCC+6.03
ZNF740MA0753.2chr5:48989051-48989064CCCCCCCCCCCCC+6.03
ZNF740MA0753.2chr5:48989052-48989065CCCCCCCCCCCCC+6.03
ZNF740MA0753.2chr5:48989053-48989066CCCCCCCCCCCCC+6.03
Enhancer Sequence
TTGATCGAGG ACCTGCCTTC AAGGTTTTTT AGATGTGCGC ACATTTCTGT TTTTTGCTTG 60
CGTAACCCCT GCACTACACC CTTAAGCCCA CTAAGGGCAT TTATACTAAG AACAATACAA 120
AGACCTACAT TATGTTTGGA AAGAGCCACC ATTAGCAGAG CAGCATTTCA TTACATGACT 180
TCTAGACTTG TTCTGTGTCT AGATCCATAA TAGCCATTGC TTTGACCCCG TCCCTTGTGG 240
GAGTCGACGA AGTGAAGTGG AAAATCCTCT TGATTGGAGC ACGAGCTGGT TTTTACACAC 300
TTATACACAC ACACACACAC ACACACACAC ACACACACAC ACACACCCAC ACACACACAC 360
ACACAGTAAT GGGTGTGAGA GTGTCAGAGA CTGTAAGTGT CTCTCACCTT CCTGTCCCTT 420
CTTCTGTCCC CTTTTCAGGT CAGTAAACCG TCAGGCGACT ACCGACCATT TCTGCAAGGC 480
TAAAGAGAGA CAAAGAGACA CGAAAGAAAC AGGGAAACGG GACCAGACAC CTCCGCGGAG 540
GGCACCAGAC AGCCAGGGTG TTGAAAGTTA ATGGAGCACT CTTTCACAAA CACTCTTCTC 600
TCTGGGGGCC TCTTTCTGTT CTCCTCCCAC CGCTGAGCCT GCCTTTATTT TATTTACGAA 660
AGGCCCCTTT ATGTGCTTTC ATCAGTGCTG CAAATTATGT AGCCCGGGTT AATGCTGGAT 720
GTGACCAAGG GATTCCCTTC TGGTAAGACG ATGCAGCTGA AGATAGTTTG CAGAACTGGC 780
TCTTAACATT GGCCATGTCA TGTATTCCAG TTTGTGCGAG ACAGAAACGT GCTAGCTTGG 840
CCTTTTTAAA GCGGTCCTCT GGGCTATGCC CCAAGTAATC CCCCCTCATT TCGATGACCC 900
TGCTGGGTAA TGCAACCCCC CCCCCCCCCC CAACCACCCC ACTCCGAGCT CTGCCTCGCT 960
TTTTTTCTCT TTCTAAAGGC CTGTAGGCTA AAGCCAAAGA GGCTGTGGTC AAGTGTGAAT 1020
GTTTGAGAAA ACTGTGCACT GCATAAGCAA CAAGCTTGAG AGGCCCCCTG TGTGAGAGTG 1080
TGTGTATTTG TAAACGTGTA GGTATATTGC ATATGTCAAA TGACATTACA CTACTGTAGT 1140
ATTTAGACAA GACAAAGAAA GTTTTTACAG GGAGTCTACA TCTTCAGACT TTTTTTAGAA 1200
TCACAGCTCG TAACTTTATA ATAACTACAC ACTATTAATT AATTATTAAG CATTAGCACA 1260
TGGTGAATTC ATTATTTGTT AAGCATTAAC TCTACATTAA TAGATGCTAG TAAGCAGTTT 1320
ATAAATACAT CTACAAAGGC TGTATTCTTG ACTTAAGCAC ATTTATAATG TGCTTAATAA 1380
TTGTACTTTC ACAGTTTGTT ACTAATTGAT TTTTCATTTC TAAGTTAAGT ATTA 1434