EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species
EnhancerAtlas 2.0
TagContent
EnhancerAtlas ID
DR006-00722 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_4hpf 
Coordinate
chr4:73312850-73314630 
TF binding sites/motifs
Number: 35             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
FOXC2MA0846.1chr4:73313999-73314011TTTGTTTATTTA+6.18
FOXC2MA0846.1chr4:73314085-73314097TTTGTTTATTTA+6.18
FOXC2MA0846.1chr4:73314290-73314302TTTGTTTATTTA+6.18
FOXC2MA0846.1chr4:73314355-73314367TTTGTTTATTTA+6.18
FOXC2MA0846.1chr4:73314405-73314417TTTGTTTATTTA+6.18
FOXC2MA0846.1chr4:73314425-73314437TTTGTTTATTTA+6.18
Foxd3MA0041.1chr4:73313952-73313964GTTTGTTTGTTT-6.32
Foxd3MA0041.1chr4:73313956-73313968GTTTGTTTGTTT-6.32
Foxd3MA0041.1chr4:73313960-73313972GTTTGTTTGTTT-6.32
Foxd3MA0041.1chr4:73314014-73314026GTTTGTTTGTTT-6.32
Foxd3MA0041.1chr4:73314055-73314067GTTTGTTTGTTT-6.32
Foxd3MA0041.1chr4:73314104-73314116GTTTGTTTGTTT-6.32
Foxd3MA0041.1chr4:73314182-73314194GTTTGTTTGTTT-6.32
Foxd3MA0041.1chr4:73314186-73314198GTTTGTTTGTTT-6.32
Foxd3MA0041.1chr4:73314211-73314223GTTTGTTTGTTT-6.32
Foxd3MA0041.1chr4:73314350-73314362GTTTGTTTGTTT-6.32
Foxj3MA0851.1chr4:73314230-73314247TTATTTGTTTATTTTAT+6.02
Foxj3MA0851.1chr4:73314308-73314325TTATTTGTTTATTTTAT+6.02
Foxj3MA0851.1chr4:73314082-73314099TTGTTTGTTTATTTATT+6.03
Foxj3MA0851.1chr4:73314287-73314304TTGTTTGTTTATTTATT+6.03
Foxj3MA0851.1chr4:73314352-73314369TTGTTTGTTTATTTATT+6.03
Foxj3MA0851.1chr4:73314402-73314419TTGTTTGTTTATTTATT+6.03
Foxj3MA0851.1chr4:73314422-73314439TTGTTTGTTTATTTATT+6.03
Foxj3MA0851.1chr4:73314106-73314123TTGTTTGTTTATTTTAT+6.57
Foxj3MA0851.1chr4:73314213-73314230TTGTTTGTTTATTTTAT+6.57
Hmx2MA0897.1chr4:73314249-73314266ATTTATTAATTGATTTT+6.91
Hmx3MA0898.1chr4:73314249-73314266ATTTATTAATTGATTTT+6.86
Lhx3MA0135.1chr4:73314506-73314519TAATTAATTAATT-6.78
Lhx3MA0135.1chr4:73314507-73314520AATTAATTAATTT+6.92
Lhx3MA0135.1chr4:73314503-73314516ATTTAATTAATTA+6
ONECUT3MA0757.1chr4:73314254-73314268TTAATTGATTTTTT+6.22
POU6F1MA0628.1chr4:73314508-73314518ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr4:73314508-73314518ATTAATTAAT-6.02
ZNF24MA1124.1chr4:73313625-73313638CATTCATTCATTT-7.34
ZNF24MA1124.1chr4:73313621-73313634TATTCATTCATTC-7.52
Enhancer Sequence
TGTTCATGTC GTTCATTTTC CACGAGCTCT GCTGCGGACT TCTCGGGAAC ACTTCTTTGT 60
TGTGGACCAG TCGCGGATGA TCCAGTGAGT TTTGGTTCTG GTAGCTCTCT CCATCTCCGC 120
GCTTTTCAAA ACTCACCAAA GCTATCTCCA TTTCCAAGCC ATTAAACATT CATTCGTGAA 180
AAGCATGTAG ATGTCCGAAG CGAAAGCTCC TCGTAAATCC ACACTCGTTT TCTTTTCCCT 240
GCGACTGTTC CGTAGAGCTG TGTTATAATC CAAGCATCCT CTCCTCACTC TGGTAAATGC 300
GTGTGTGTTC CGAGCGTAAG TACTTGAGCG ATTCACATGA GAGTCGGTTC TTTTGAAGAG 360
ACTCTTTTGA GTGAGTCGTT TCGCAGAGCG TCAAGTGTAA CTCGGCTGGA AAGACTTTCA 420
CTATAGCGAA ATGATATAAG GGCATGACTA TAAACAAGAG TGGTTATCTA GCTGTAAAGT 480
GTAGTAAAAT GCTACAGCAG TCTACAGTCG AGTCTCAGAC AAATGAATCA ATGATCTGAA 540
CCGTTTCGCT CTTATAGAGA GAGAGAAAGA GATCGAGAGA GACTCTCTTT TCCTTCGTTC 600
ATCATCATAT ATTTATTTAT TCATTTATTA AAAACAAGTT ATACTTAATT TGTAAGATTA 660
ACTAAAAAGT TAAAGTATAA AAGTTAATGT AAAAAGTATT TAGCTGTAAA AAAATATCCA 720
GTTTATGTGT GTGTTTATGT GTTATATGAT TCTTACACTG CTTTATTTAT TTATTCATTC 780
ATTCATTTTC TTTTCCGGCT TAGTCCCTTT ATTAATCCGG GGTCGCCACA GCGGAATGAA 840
CCGCCAACTA ATCCAGCATA TGGATGCCCT TCCAGCTGCA ACCCATCACT GGGAAACCAG 900
ATCCATACAC ACTCATTCAC ACACATACAC TACGGACAAT TTAGCCCACC CAATTCACCT 960
GTACTGCATG TGTTTGGACT TGTGGGGGGA ATCCGGAGCA CCCGGAGGAA ACCCACGCAA 1020
ACACGGAGAG AACATGCAAA CTCCACACAA AAATGCCAAC TGACCCAGCC GGAACTTTTT 1080
TTATTTATTT ATTTATTTAT TTGTTTGTTT GTTTGTTTGT TTTATTTATT TGTTTGTTTT 1140
ATTTATTTAT TTGTTTATTT ATTTGTTTGT TTGTTTTATT TATTTATTTG ATTATTTATT 1200
TATTTGTTTG TTTGTTTTAT TTATTTATTT ATTTGTTTGT TTATTTATTT ATTTGTTTGT 1260
TTGTTTATTT TATTTATTTG TGTGTTTATT TATTTGTTTG TTTTATTTAT TTATTTGATT 1320
ATTTATTTAT TTGTTTGTTT GTTTGTTTTA TTTATTTATT TGTTTGTTTG TTTATTTTAT 1380
TTATTTGTTT ATTTTATTTA TTTATTAATT GATTTTTTAT TTGTTTGTTT TATTTATTTG 1440
TTTGTTTATT TATTTTATTT ATTTGTTTAT TTTATTTATT TATTAATAAA TTTTTTATTT 1500
GTTTGTTTGT TTATTTATTT ATTTTATTTA TTTGTTTTAT TTATTTATTT ATTTGTTTGT 1560
TTATTTATTT ATTTGTTTGT TTATTTATTT ATTTATTTAT TTATTTATGT AAGTGTTTAT 1620
TTATTTGTTT ATTATTTATT TATTTATTTT ATTATTTAAT TAATTAATTT ATTAATTTAT 1680
TAATTTATTA ATTTATTTAT TTAATTGTAT TTATTTATTT ATTTATTTAT GTATGTATGT 1740
AAGATATAAC CCTTTAGTGA GTGTGTTTAT GTAGTAGATT 1780