EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR006-00720 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_4hpf 
Coordinate
chr4:27139670-27142054 
TF binding sites/motifs
Number: 8             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
FOXE1MA1487.1chr4:27139987-27140002TCTGTTTGTTTAATA-6.03
NEUROD2MA0668.1chr4:27139953-27139963GCCATATGGT+6.02
RFX2MA0600.2chr4:27141655-27141671CGCTGCCATGGTAACC+6.03
RFX2MA0600.2chr4:27141655-27141671CGCTGCCATGGTAACC-6.07
RFX3MA0798.1chr4:27141655-27141671CGCTGCCATGGTAACC+6.32
RFX3MA0798.1chr4:27141655-27141671CGCTGCCATGGTAACC-6.32
RFX5MA0510.2chr4:27141655-27141671CGCTGCCATGGTAACC-6.38
RFX5MA0510.2chr4:27141655-27141671CGCTGCCATGGTAACC+6.63
Enhancer Sequence
TGTCAAGACA TAACGTACGT TGAGGCATAT CATAATAATA CAAATTAAAG TGGTCATCCG 60
TCAGAAAAAA TAAGACTGTG CCATTATATA TGCATGTAGT TTTGTAGTAA TAGAACATAC 120
AATTCATATA TTTCTACTGA GGAAGTTCCT CGTCGGCTCG AGATCCTAAA CACGCTCTCG 180
CGACCCCACG AGATGTAGGC GCTAGCTCAA GCTACCAATG CTAGCGGCTA ACACGTTAGC 240
TCGCAGACAA AAACAACAGG AAAACACTTC ACGGTTCTCT CCTGCCATAT GGTTGTAAAT 300
AGCTGGAGTT ACTTGATTCT GTTTGTTTAA TACTTAACGT TAATATGCAA AACATTTGCT 360
ACATAGTTAA AATGCATATA TGGAAACATT TAAAGACAAA ACGTGAGGAT TTGACTTAGT 420
GACAACTCAA TGGGGTGGTA ACGTTAGGCC ACAAAGGACA TAGCCAGATG AGGCAGAACC 480
GGATCCTGAT AGCACAAAAC AGAGAAGCTC GTCGAACTAG CCGGGTCACT GGATCTTAAC 540
CAAAAATCGG GCATGCGTGT GTTTAGGACA ATTTGAAACA CTCGGTTAAA ACATTATGCA 600
TCGCTTACCT TTATATCCTG AGGTTTACTT ATGCGACTTT CGGTTGTGAA ATGGTTAAAT 660
AAAGCGTATG GTTGATCCAG TGTTGTAATT GAGTTGGTTG CTTTGTCTTC TGTGCCGTAA 720
ACAGTGCGCT GTAGTAGCGC CACACGGCGT CAGACGGAAG AAACAGTATT CTATGGCGTC 780
ATAGAGGCTT TCGATACGGT GGGTGGGGTT AATAAATAAA AACAACATTC TGTTCCATAG 840
TTAATAATAT GACATTATCG TGTAGGACTG TGGAAAATAT ACACGCATAA AATACAAACT 900
ACTTATTTTA AAATTAAAAC ATATCTAAGT AGCTTGTTCA CTAAAAGAAT CATACGGGGT 960
TTCTTGACCC AAGGGCCTTT CTCAGGGGCA GTTCGTTTAG GTCGGTTTAA AACACGAAAT 1020
TTACTGCTGT TAAGGGGGTG TCTTTAAAGG ACATCTAATT TAGCAAATTT CAAATAATCG 1080
AACATGTATA AAACATGAGA TTAGGAAAGA AAATGTTGTT TAAGTTGTCT GGAAACAAAA 1140
AAAATCTATA AAATATAGTT TACTTCAATT ATAATTTTCA TAATCAAGTA TTTCTGCGTT 1200
GTCTGCGCGA CTTTAGCTGT GTCTCATTTC AGAGACTGCA TGCTTCGAAG AACACACACG 1260
AAGAGCATTT GCGTCATCGT GGCGCGACGA ACGTTGGCTC AAGCAATCTC AATTCTATCA 1320
AATTTGAAGG CTACTTCAAA CAAATACTGC TTCTGTTCTG AAATGGGATC GCTTATTATG 1380
CCACTGATCC TGTACGTCAT GACGTTGGGC GGTGCGTGTG GGACGTCGAG TCGTAGTGAG 1440
CATCCGCATT GTTGTTGGTT GCAGGCGAGA ATCACATCAG ACAGAAAACG ACACTGGTGT 1500
TGAATAGCAA TCAAACTGTG CGTTTTTCTG GTGTTTATCA GTAAAGTGTT ACAGTCCTGG 1560
CGATCGCTGC TGATAAGCGT TTGCAGCATT ACAGATTTAT TCATGCAAAA CTAAATTATT 1620
GGCCCTCGGA TGAGAACATT GTGTGCGGAA TTACGGCAGG CCATCTAGCA ATCGCTGTAG 1680
AAAGCTGCTT CTTTCTTTAC ACAACAGATC AGAGGTAATA TGATCAATAC ATTACTCACT 1740
TTTAGCTATT TGTAAGGAAT CGCTTGTTTA TTGCATGGGA ATATAAAACA ACGACAATGG 1800
ACTGCTTGTG TTTATGGCAT GTGAGTCTGC CGATCAGTAT CCAACATGAT CCCCTGTAAA 1860
TGTGTGCATG CATAATCTAC AAATGTATTG AATTATATGT TCTTAGCATG TATGTCCTTA 1920
GCATTCTTCT GTTTATGCTT CTGATTAGCG AAGATACTTC GATAAAATAC CTTAAAATGC 1980
TGATACGCTG CCATGGTAAC CAGTGTTATT TTGTAATGTC ATAACATCTC AATTATGACA 2040
TTGGCTTGGC TTATGGCTTG CTATTATATA GAAAAAGCAT TAGACGTACT TGCCATAGGC 2100
ATTCAAATAT CATGAAATTG CTGTCTAATA CAATAGTAAG AATGCAAAAT TTTCTCGTCA 2160
ATTCAATTCT TCTTTGATTA CATATTATTT AAATTTAAAC CAGTGTTTTA ACTAGTATTA 2220
AAGTATTTAA ACCACACTGA ACTAAACTAA ACTGAACTTC AACTCTGAAA TTTGTACTTC 2280
ACTAGAACTA TGTTTAGCTG CTTTGACTCA ATGTACATTG TGAAAAGCGC TATTTAAATA 2340
AACACGAATT GAATTAAATA TAGCACTTTT TACAAAGTAG ATTG 2384