EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR006-00718 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_4hpf 
Coordinate
chr4:21388506-21389978 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
IRF1MA0050.2chr4:21388662-21388683AGTCAGTTTCTGTTTCATTTC+7
IRF3MA1418.1chr4:21388665-21388686CAGTTTCTGTTTCATTTCCTC-7.56
IRF9MA0653.1chr4:21388666-21388681AGTTTCTGTTTCATT-6.25
Enhancer Sequence
CTTCATTAGT ATGCAAGGCA TATCACGCTC GAGAGAAAAA GTTTGGTTAA AATTTCATCT 60
TAAGCAACAC AAATACAATT GCTTAATGAA AGAAAAAGAG ACAAAAATAA TTTAAAAAAT 120
ATTCCTTATT TCTATCACTT CCTGATTGTT TATTGTAGTC AGTTTCTGTT TCATTTCCTC 180
TTCGCTGTAT ACGTTTAAGC ATCGACATTT ACTTCAGTAA GGCTTCATTT TAACTTAAAC 240
TTTCTTTGGT TGAAAAATAT TGGAAGCTGT CGTATCATTT GCAGTTCCAA TCTGCCCTGG 300
TGAACAGGCT GTTCACTTGC ATGTTTATTC AGATGTTCCC TCAGATGCAA AGTACAGTTT 360
GTTACCTCAC AGCTCCGATT GCACATCTTT CAATGTGAAA TATCTCTCAC TTGATTCATA 420
ATGTCAGATT TTTCCTGTTG TTCATTTCAG TCAGTTGATC AGCACTCCAT ATGCATTCAT 480
CCATTTGTCA GACGTCTTAA TAGAATCAAA CTTGGCTTCG TCAGGGACAC AGATATTCCC 540
CTTTCCAACA CATTCCACCT TTAAACTAGG TTTTGAATAG TCCCAAGCTC AAGTCATCAT 600
AATTGGATGT TAAGTTTCAG GCTGGCGGTG TGTACAAACT GCAACCGTGA GCTGAAATTC 660
AAAAGAAGAG GCCTGAGATT TCCATATTAA TAAAAGTCAC ACTGGCTGTT TTCTAGGTTA 720
TCATCCGAGG GCCGGATATT ATGCCAGTGT TCCTGCTGCC AAGCGTTCCA GCAATCTATT 780
GTCCAGCCCA TTACTCCTAT TTACCACTTT TATTGAATAG ATTGTGATCG CATCTTATTT 840
AGAAATGCAT TTGGGGTTTG CTCATTTACC TTCTGTTTGT GTTGCATAAC ATGCACAGCA 900
AAGTAGCTTT TAATGGAAAT GAGGCTGGCT ATCTATCTCC GCAACACAGG TTGCTTGAGA 960
GATGGGAGAT TACGGCCTCC ATTTTGTTTT AGGTAGACTT TTCTAAGCAA TATAATATTC 1020
AAGATGTGGG CTCTAAGTAC CTGCATAATT ACCTCATTCA ACTAATATAT TTCAATGGAT 1080
GATTCATTGG CCGTTCCAGT TTAGAGCAGA GCTTTCTTTG TAAGATACAT GTTAATATAG 1140
GCAATTTAAT CCAAGAAGCT GCAAGCTTTG AGCATCTCAA TGCCCTCTCA ACTGCAGGGC 1200
CCCTTGTTGT GCTTTCTTTA TCCAAATGAA GTCAGACCAG TCAGGTCTCC CACTGCGGCT 1260
CTGTCTCCTC CCAGCCTGTG CCACTTTGAA GTCTGGAGTA ATTAGCCGCT GCCTGTGAAG 1320
TAGCTTCGCT AACTGTGATG TGCAGACTCC ATTTTCACTG ATAATGATCT AGGAAATGTT 1380
CCAGCACATT TGTTATCAAA TGCATTGAAA CTCATGACCT GAGTCTGTGC AAAGAGGCAT 1440
CCCAACAGGC ACCAGAAGGT CACTGAATTG AA 1472