EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR006-00715 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_4hpf 
Coordinate
chr4:16654040-16655422 
TF binding sites/motifs
Number: 4             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Arid3bMA0601.1chr4:16654435-16654446ATAATTAATAT-6.02
HOXA13MA0650.2chr4:16654597-16654608GCCAATAAAAC+6.14
HOXB13MA0901.2chr4:16654597-16654608GCCAATAAAAC+6.14
HOXD13MA0909.2chr4:16654597-16654608GCCAATAAAAC+6.14
Enhancer Sequence
GAGCTGCTCT TATATAACAG GGTGCTGATG ATGGAGCAGG ACAGTCACCG GTGACGGACA 60
GCAGCACTTT CATTTATTAC AGAAGAAAGA AAAAACATCT GTATAAGCTT ATCTGAAGCC 120
TTTCATCGTG TATATACATG TTTTTTTAGA TAGCCTAAAT GTTACCATAG CCTACTATTG 180
AAACATGTTT GTACAGTATA AGAGTTGAAC GGGCGCTTGA CTGTATATTC TGCCTCTGAC 240
GCAATTCAAA CATGGCAACG CGTTTGAGAA GAGAGGAGGG GCAGAAAAAT GGGGGCAAGA 300
AAGTAATGCG ATGCCGTCGC GGAAACCTCG ACCAAAAGTG AATTCAACAC GCTTAAATGT 360
GTCACCTAAA GTTACCCATA TCATATAATA ACCGCATAAT TAATATTTTG CGGCGTTTAG 420
ACGCACGGCC GTCCGCGCAC TGCAGTGAAA TGGTGCGCGC GTCCCGCTGT ATTCACCGCC 480
CACCAGCTCG CGCGGAAGCA TGGCACGCCA CACGGCATCT TTAAACACAC ACATTCAGCA 540
GGTTTTCGCC GCAGTTTGCC AATAAAACGA CCTCTGCTCT GTGCGAGGAA TCAATTCGCA 600
GGGTTTCCCT GATGTTAGAC GTGTCTAATA AAGACAGCCA GCTGAAGGAA AGCGCTCTCC 660
TCGTCCGCTG CTCTTTGTTT TCCGCGCGGC TCTGCGTCAG TGGCTCGTGC GCCTCCATGC 720
TTCGCGCTCG AGACTGTAAA CACATGCTGT CCGCGTAACA ACTTCACCCA AGGACACAGA 780
GCGCGACTAA ACTCCCATTT GCAAGTTTAT TTCATCAACA GGACGATTTA AGACACTTTT 840
AAACACTCCA GCGCAATACT AAAACATCGA TTTTATTAGC TCCACGATTA AATGCGTCAG 900
TGACACCGCC TCCATCTCTC ATGAAATGAA TCTTTAAGAC TACCACAGCT AGTTTTTATA 960
AACGTCGACC TCTTTTGAGT TCCAGAAGCA GAAGTTTGTA AACGCATGTT GACGAGCTTG 1020
TGAAAATGCG GGTTTGTTTT GAAGCACACC CACCAACAGG AGTGAACAGA CCACACGCAG 1080
TCACAAGGAT AGTTCACTAT CCCAAGTTCA AATCGAGTAT AAACAGCGAA ACTTGTCCTA 1140
AATGCGCGCA ATGTGACGCC ACGTTCGCGT TTATTAGATA TTTCGTGTAC ATCTTATAAT 1200
TCGCGCACCT ATTTATTGGG TTTTTAAACG GAATACGAAT GCAAATGTCC TATTTTTAAA 1260
AGCTCTTTCT ATCTAAACAA TCATCCAGAG CGTGTTTCTA ATACGCCTAA GTTCTGTTAT 1320
AAAGAAAATA AATCAATTCC GGCGTCAAAT GTATCGATTT AGCCATAAAA CACTTAACAG 1380
CA 1382