EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species
EnhancerAtlas 2.0
TagContent
EnhancerAtlas ID
DR006-00707 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_4hpf 
Coordinate
chr4:7737490-7739728 
TF binding sites/motifs
Number: 41             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
BHLHA15(var.2)MA1472.1chr4:7738063-7738073AACAGCTGTT+6.02
BHLHA15(var.2)MA1472.1chr4:7738063-7738073AACAGCTGTT-6.02
BHLHE23MA0817.1chr4:7738962-7738974AAACATATGCTG+6.04
CDX1MA0878.2chr4:7738138-7738149GTTTTATGGCC-6.62
CDX2MA0465.1chr4:7738139-7738150TTTTATGGCCT-6.02
CDX4MA1473.1chr4:7738138-7738149GTTTTATGGCC-6.32
FOSMA0476.1chr4:7737882-7737893GATGAGTCACA-6.14
FOXC2MA0846.1chr4:7738668-7738680TAAATAAACAAA+6.18
FOXC2MA0846.1chr4:7739122-7739134TAAATAAACAAA+6.18
FOXC2MA0846.1chr4:7739298-7739310TAAATAAACAAA+6.18
FOXD2MA0847.2chr4:7739120-7739133ATTAAATAAACAA+6.06
FOXD2MA0847.2chr4:7739296-7739309ATTAAATAAACAA+6.06
FOXE1MA1487.1chr4:7739119-7739134AATTAAATAAACAAA+6.29
FOXE1MA1487.1chr4:7739295-7739310AATTAAATAAACAAA+6.29
Foxj3MA0851.1chr4:7739143-7739160ATAAAATAAACAAAAGA+6.09
Foxj3MA0851.1chr4:7738478-7738495ATAAAATAAACAAAACA+6.18
Foxj3MA0851.1chr4:7738700-7738717CAAAAATAAACAAAACT+6.32
Foxj3MA0851.1chr4:7739219-7739236AAAAGATAAACAAAACT+6.3
Foxj3MA0851.1chr4:7738503-7738520AAAAAATAAACAAACGA+6.87
IRF1MA0050.2chr4:7739498-7739519AAACAAAAAATAAAACCGAAA-6.07
IRF2MA0051.1chr4:7738357-7738375GGAAAACGAAAACAAACC+6.18
JUNDMA0491.1chr4:7737882-7737893GATGAGTCACA-6.14
Lhx3MA0135.1chr4:7739114-7739127AAATTAATTAAAT+6.07
MSCMA0665.1chr4:7738063-7738073AACAGCTGTT+6.02
MSCMA0665.1chr4:7738063-7738073AACAGCTGTT-6.02
MYF6MA0667.1chr4:7738063-7738073AACAGCTGTT+6.02
MYF6MA0667.1chr4:7738063-7738073AACAGCTGTT-6.02
PHOX2AMA0713.1chr4:7739071-7739082TAATTAAATTA-6.62
PROP1MA0715.1chr4:7739071-7739082TAATTAAATTA+6.32
PROP1MA0715.1chr4:7739071-7739082TAATTAAATTA-6.62
Phox2bMA0681.1chr4:7739071-7739082TAATTAAATTA-6.62
SOX10MA0442.2chr4:7738620-7738631AAAACAAAGGA+6.32
SOX10MA0442.2chr4:7739449-7739460AAAACAAAGAA+6.62
Sox3MA0514.1chr4:7738620-7738630AAAACAAAGG-6.02
Tcf21MA0832.1chr4:7738061-7738075AAAACAGCTGTTAC+6.53
Tcf21MA0832.1chr4:7738061-7738075AAAACAGCTGTTAC-6.53
ZNF24MA1124.1chr4:7739045-7739058AAATGAATGAATG-7.34
ZNF24MA1124.1chr4:7739049-7739062GAATGAATGAATA-7.52
ZNF384MA1125.1chr4:7738414-7738426AAAAAAAAAAAA+6.22
ZNF384MA1125.1chr4:7738415-7738427AAAAAAAAAAAA+6.22
ZNF384MA1125.1chr4:7739058-7739070AATAAAAAAAAA+6.62
Enhancer Sequence
TGGTAGTCTT CAATTAAAGC CTGACCATGT GCATCTACAT TTGGAGTGTG GACTGTTCTG 60
TTGACGTCAG TTTAATGAGT TCAGCCACAA TATTCTTAGC CACGGCTCTT GCACTGTTAG 120
TTTGCTATGA AGGAAAGATG CGCGAAAAAA GCTTAAAATA TTTAGGTATT TCTGTTTATA 180
CAGACTAAAT TAATCCATAA AGAAAACAGG GCTTTCCTAA AGAACTAGAA CTTTAATAAA 240
AATATGTGCT ACTTAGTTAT TTTTATGTAA GACAGCTTAA ATATTCAATT TAGTTGAGGA 300
CTACCCTTAA GCCTAGTCTG TGAAAACTGG AGAAACTGTC ATTTAAAACA TACAGGATGT 360
ATTTGCTGTC GTCTTTTTTT CCTAAAACTT GAGATGAGTC ACAAAATTAA AACCAAGCAT 420
AGCATTAGTA ATATAATCTG GGGTTGTCAA ATCAGAGAAT GACCCAGAAT AGCCAATTAG 480
AGTGTAAATG TGAGCAACCG TGATTTCTGT TTGGTCCGTT GCAACACTAA AACAGGACCT 540
GCAGCATTTT CACAGATTTT TTTTAAGGGT CAAAACAGCT GTTACGGAAG AGATTATATT 600
CCTGGGAACT GGAATGAAAG AGTGTAAAGG TGTGGTTGTG GCTCTGTAGT TTTATGGCCT 660
CCTCATCAGA CTGAGTCCCC CAGGGGTGAA ATAATGGCCT CTCTTTATCA GGCCGAGGCA 720
GTAAAACTGC TAACCTGAAG CTCATCCATT ACACCACTCT GTATGTCTGT CTGTCTCTCT 780
AATAACGGCG CTTAATTAAA AGTATTTTTG GCCATTTTCT GACTTTAAGT GAAGGTACCA 840
GTTCTTAATT AGCACAAGGT AAATGTGGGA AAACGAAAAC AAACCAAAGA GAAAAAATTA 900
AAATAAAACA ACAAAACTAA AAACAAAAAA AAAAAAATAC AATTAAACAG TGTTTTATGA 960
TTGGATTTTT TTAAAATAAA TAAATAAAAT AAAATAAACA AAACAAAACG ACAAAAAAAT 1020
AAACAAACGA TAAACAAACC TAAAAACTCA ACAAACAAAC AAGCCAAAAC ACAAAAAATA 1080
AAATCACAAA ACAAAACTAA ATAAGTAGAT CAAATAAAAC AAAAAACAGA AAAACAAAGG 1140
AAAATAGCCA AAACTAAACA TTAAATAAAG AAATAAAATA AATAAACAAA AATCTAAAGA 1200
ATAAACGAAA CAAAAATAAA CAAAACTAAA AACTCAACAA GGGTGTCAAG GTGGTGCAGT 1260
GGGTAGCACA ATCGCCTCTC AGCAAGAAGA TTGCTGGTTC AAGCCTTGGC TGGGTCATTT 1320
GGAGTCTGTG TGGAGTTTCC CCCACAAGTA CAAAGACATG TGGTATAGGT GAATTGGGTA 1380
AGCTAAATTG CCTGTACCGA ATGTGTGTGA ATGCAAGAGT GTATGAGTGT TTTCCAGTCA 1440
TGGGTTGCAG CTGGAAGGGC ATCCGCTGTG TAAAACATAT GCTGGATAAC TTGGCAGTTC 1500
ATTTCACTGT GGCGACATCA GATAAAAAGG ATTAAAGGAT AAAAAGCCGA AAAGAAAATG 1560
AATGAATGAA TAAAAAAAAA CTAATTAAAT TAAACAAAAA AACAACACAA AACATTAAAT 1620
AAATAAATTA ATTAAATAAA CAAAGAAATA AGAATAAAAT AAACAAAAGA AAAAAAACAG 1680
AACTAAAAAC TAAAATCAGA TCATACAAAA CACTAAATAA AAAAAATAAA AAAGATAAAC 1740
AAAACTAAAC AAAACAATAC ACAGAAAAAC TAATTAAATC ACAAAATAAA ACACTAAACA 1800
AATAAAATTA AATAAACAAA AAGACAAAAA ATAAAAGAAA TGAAAGAAAA ATAAACAACT 1860
AAACAAAACT AAAAACTCAA ACAAACAACT AAATCAAACC ACAAAAAAAC CCAAAACATT 1920
AAATAAATAA ATAAATAAAA TAAAATAAAA TAAAACAGAA AAACAAAGAA AAAGAAACAA 1980
ACTCAACAAA CAAAAAAGCA GAACAACAAA ACAAAAAATA AAACCGAAAA ATGAACTGCC 2040
CTTTTATCTG GTAATGAAAA AAAAAATAAA TAAAAAAATA AAAAGTCTAA AATAAATAAA 2100
ATTGATAAAT AAATAAAAAC ATCTAAATAT GTTTAATAGT CTTAACTGAA AGATAATGCT 2160
TTACACAGAA TATAATTATT TGATATCTTT TTAATCTTCT GTATTAGTGT AATCCAGTGT 2220
AGAGTAATCA CAGTTGTG 2238