EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR006-00705 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_4hpf 
Coordinate
chr4:3419704-3421216 
TF binding sites/motifs
Number: 7             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Atoh1MA0461.2chr4:3420267-3420277AACATATGTT+6.02
Atoh1MA0461.2chr4:3420267-3420277AACATATGTT-6.02
BHLHE23MA0817.1chr4:3420266-3420278AAACATATGTTG+6.52
IRF1MA0050.2chr4:3421192-3421213ATTTATTTTTACTTTTTTTTT+6.06
LMX1BMA0703.2chr4:3420954-3420965ATTTTAATTAA+6.62
OLIG1MA0826.1chr4:3420267-3420277AACATATGTT+6.02
OLIG1MA0826.1chr4:3420267-3420277AACATATGTT-6.02
Enhancer Sequence
TGTTTTTGGA GTCTGCTGTT GGTGGATGAG ATGCGGTGTG AAGGCCAAAG ACTGGCTCAT 60
GAGCTGCCAG ATGCAGCATT ATTATTATTT TTATGATCAT TATTACAGTT TTTCTGTATG 120
GTGTTCTGGC GTGTTTTGAG ACCCCAGACA TCAATAACAT GCTGTAGGCC ACTGATTTGT 180
GTGTGTTTGT GTTTGCAGGT TGTTCACAGT GAGTAGACCA GGAGCGTCTC CAGCCATCCA 240
GAGCCATGCA CAGCAAGAAT CGTAAGAATA TACTAATATC AATATGTATT ACTGCATGAT 300
GTTTTTTCTG TTTTATGCAT GATGAATTTA TTGGAAATTT AAAATGACAT GGTTGCCTCA 360
CAGCAAGAAG GTCGCTGGTT TGAGTCTCGT CTGGGTCAGT TGGCATTTCT ATGTGGAGTT 420
TGCATGTTTT ACCCATGTTG GTGTGGGTTT TCTCCGGGTG CTCCGGTTTG CCCCACACAC 480
ATGCACTATT GAATAAACTA AATTGGAGCT GTATGGGTGT TTCCCAGAAC TGGGTTGCAG 540
CTGGAATGGC ATCCGCTGTG TAAAACATAT GTTGGAATAG TTGGCTGTTC ATTCTGCTGT 600
GGCGACCCCT GATGAATAAA GGGACTAAGC CGAAAGAAAA GGAACTAATG AATGAAAATG 660
AAGGAACATC ATCAATGCTG CAAAGTTTTT TATTTAGATG CTTTTAGAGT GGTTCTTTTG 720
TAATTTAATA CTTGTGAGAA TTTCTCGCCT CTTTTGAAGT CTAAAAAATT AGTAAATGCA 780
GTAAAACCAC AATAAAAGCA TGGTAACTAG TGCTGTATTT AAATAGTAAA ATAGTAAACT 840
AGGACCTAAC CGGGTGTAAC TAGTATGGGT GTTTTATGAA ATGATTCTTT GTGAATGCAT 900
AAAAAGTTAT GCTTATTTTG AATGCACATT TAATGCGTCT CCATAAGTCT CCATAAGTCA 960
ATATATATAT ATATATATAT AAATGTAATT TTATTAAACT GTATCTATAA ATCATAAATT 1020
ATTTAATTGT ACTTTATATA GAAATCATTA GATTGAAATT AACATTTCAA GTGAATCAAA 1080
TAAATGTTTA AAGTTATTTA TTATGTAATT TATTATTTTT AATATATATA TTATATATTA 1140
TATTATATAT TTGATATATT TAAATTACTA TTTAAAATAA TTTATTATAT AAAATCTAAC 1200
TTTATATTAA AATATTACTT TATTATTGTA CTGTATCTAT AAATCATTAT ATTTTAATTA 1260
ACATTTCAAT TGAATTTATT ATATATTATA TTATCTTATT TAATATTTTT ATCTTATTTC 1320
AATTAATATT TTAAATAATT TATTGTATAT TAGTTTATAT CATATTATTT TATTGTACTG 1380
TATCTATAAA TCATATTTTA ATACATATTT AAAATAAAAT ATTATATAAT ATTACGTATT 1440
TATTTTGTGT ATAATATATT CATAATATAT ATATTATATA CTAAATTTAT TTATTTTTAC 1500
TTTTTTTTTC AT 1512