EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR006-00695 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_4hpf 
Coordinate
chr3:52921315-52923084 
TF binding sites/motifs
Number: 7             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Hmx2MA0897.1chr3:52921949-52921966ACAAGCACTTAACACAT+6.62
Hmx3MA0898.1chr3:52921949-52921966ACAAGCACTTAACACAT+6.28
RARAMA0729.1chr3:52922300-52922318ACATGAACTGATGACCTT-6.53
RarbMA0857.1chr3:52922303-52922319TGAACTGATGACCTTT-6.34
TBR1MA0802.1chr3:52922410-52922420TTTCACACCT-6.02
ZNF263MA0528.1chr3:52921348-52921369GGAGGAGGAGGAGGATGGTCA+6.46
ZNF263MA0528.1chr3:52921345-52921366GGAGGAGGAGGAGGAGGATGG+9.37
Enhancer Sequence
CTGATTTCTC TAGAGATCCA GAGCCTGATG GGAGGAGGAG GAGGAGGATG GTCAATCCAA 60
AGACCCTTGC GGCAGCTACA GGCCCTGCCA GATGCAGACG AAGTATTTGC CCTAGAGCAC 120
TCGCACTTGA GCACTTTCTC ACACACATCC TGTTCTGGAG TTACTCAGTT GCTGTGTCCC 180
AGGGACCTTA AATGTGGATA GCTTAATTAG CTTCTTGTAA ACGATTAACG TCTTGGATTG 240
CTTGGTGTTC TTGTCTTGAG ATTTGTCAGG TTTTAATTGA AGAAGAGAAA CCCTCAAGTT 300
TACAAAAATG TACAACCCTT GTAGTTTTAT GCTCAGTTTG GCAGAAGCGT GACATTTGAA 360
ATAGGCCATT CTGTTCATTT GTGCAAATCT GAGGAGTTTC TTGGGTCAGG TAGTATGGTG 420
ATTAATATGG TACTCTATCA GAGTTTGGAA ACTCTTGGGG AAAAACTTTT CTGTTGTGAC 480
TTTTTTTCTT TGTACCTCTG TATAATGCCT AATGTCCTGA TGCGCTGTTT TTTTTATGCA 540
AAACTTCGTG CTATATCAGT ACAGTTGATC ACTTAGCCTT TCATAATATA CTCTAAGTGT 600
AAATACATAA GATTAGACAC ATACAAGTGC TAACACAAGC ACTTAACACA TGCGCTCATT 660
CATACTTCAT TACTTAGGGT GAAGATAATT ATCTTTGTGT TAAAGGGTCA AGAAATGCTA 720
CATATTTTTT CAATAAACCT TTTATTTAAC ATGTTTGTTC TTAAAGGCAA ATATCATTAT 780
TCATTAGTTG TAACTGTTGT TTATCTTCTT AAGGGGTTTT ATTTTGCTCT GTTTTTGTCT 840
TCTGGGTTTG AAAATACATT GATATTCCAG GTTCTGACAT GGTTAAAGGT TAATAAGATA 900
ATGACAAATA AGCCAGTGTA TTTCAAAAAG CACGTGGACA TCCTGTGCCT TCAAAATGCT 960
CTACTGCTTA TTTATCCGTG TTTGCACATG AACTGATGAC CTTTATGGGC AATCACAGTC 1020
TGTTGAACAC ATGAATGCAA GGGTCAATCA GTGGTGTTTA AAGGGCCATG AAACCCCCTT 1080
TTTTCAGCAG GGTGTTTTCA CACCTGTCGC ATATATAGAT ATAGACGGGA GTGTCTATTT 1140
GGGCATGCGC GAGTTTCAGA GTCAAAACAC ACACACGGGA GAAAGTGATG GTGCTTACAT 1200
GGACATCTGT AGTCGCATTA TTTGCCAAAT TATTAAATGG TGGACTTTAA CTGCAGTTTG 1260
GCTCTTTCAT TCAGGGAATT CATTCATGTC CCTCGCGACA AATGAGATAT TTGATTCGAG 1320
GAACTGCTCT AGGCGTGTAT TTTTCATGCA ATGTTTGATA CCGCACGGCG AATGAGAAAA 1380
AAATAAACCT CTGCATTTAT CGGAAACTTG GATGCACACG GCAGGTAGTG TCAGAAAGCC 1440
GCGTGTGTTA TTCCGGTCAC AAAATGCGTC AAAAAGCCTA CAGGAGGTTA AAGTTTGGTT 1500
GTGGTGCTAA CATGTTTACA CTTGGTGCAA TAGTTTGTTC GATACAAACA AACTGAATAA 1560
ACAAAGAGCA CTGGTCGCTC ACTTACCAAA TCTGTAGAGA CAGGACAATC ACCAGCAACT 1620
ACTAGAGCCG CGTCTTTATT AAGAGGAGAC TAAAGCGAAT CCGGATCTCA GCGTTTGCAG 1680
ATGAGAACAG CTCTCAGGTA AACAATAATC CTCCTTAGAC ACAAGTTATT GCGTAGCGTC 1740
GTTATAGTTG TAGCGTCGCG TACACTGTT 1769