EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species
EnhancerAtlas 2.0
TagContent
EnhancerAtlas ID
DR006-00686 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_4hpf 
Coordinate
chr3:41932009-41933458 
TF binding sites/motifs
Number: 13             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
BHLHE40MA0464.2chr3:41933047-41933057GTCACGTGAT-6.02
HNF1AMA0046.2chr3:41932074-41932089AATTAATCATTAAAA+6.58
MAFFMA0495.3chr3:41932402-41932417ATGCAGACTCAGCAT+6.69
MAFFMA0495.3chr3:41932402-41932417ATGCAGACTCAGCAT-6.75
MAFGMA0659.1chr3:41932399-41932420GTAATGCAGACTCAGCATTGC+6.35
MAFGMA0659.1chr3:41932399-41932420GTAATGCAGACTCAGCATTGC-6.48
MAFKMA0496.2chr3:41932400-41932419TAATGCAGACTCAGCATTG+6.43
MAFKMA0496.2chr3:41932400-41932419TAATGCAGACTCAGCATTG-6.54
SREBF2(var.2)MA0828.1chr3:41933047-41933057GTCACGTGAT-6.02
Srebf1(var.2)MA0829.1chr3:41933047-41933057GTCACGTGAT-6.02
TBX19MA0804.1chr3:41932891-41932911GTTAACACCTACCTGCTAAT-6.26
TFEBMA0692.1chr3:41933047-41933057GTCACGTGAT-6.02
USF2MA0526.2chr3:41933043-41933059GCTGGTCACGTGATGA+6.16
Enhancer Sequence
TAAATAAGCA GTTTGAACAA GCAGCAACGT ATAATACTGT CTTTGTTGTT TAAACAATAC 60
AATAAAATTA ATCATTAAAA AATGTTAAAA CGGTACAATT TCTTATGCCT GAATGCTTTT 120
AAAATCCTCA TACAATCACA GGCCTCAAAA AACACTTGCA AAATGACAGT CTGATCTCAC 180
AAGAAAATGT AAGTATTTTA CGTTTTGTCA GTTTAGTGGC TAATTCGTAC AAGTTTAATC 240
GTACGAAGAT ATACGATTTT AAAAAGGAGG CTTGGCACCC AACCGTCATT AGGGATATGC 300
AAATCGTACT AAACTAGATT GCACAAATTC ATAAGAATAA GCCACTAAAT TAAAACATTA 360
CGAATTGCCA TTAGACTGTG TTGATTGATT GTAATGCAGA CTCAGCATTG CATATTCTGC 420
GACGTGACTA TTGCAAATGA TCACAAGGCG AAACCGATGC TAAAACACTA TATTGTGCAG 480
TCCTAAAGAG AAGGGTGTTC CTGTAGTAGT TTTGTTTCAT TCAAGCAGAT CATTCCCACT 540
AAGAGTAAAA TCTTGTTGTG CTTAAAGTCT GAAATTTACA TACTGACATC CCAAAACATC 600
ACTTTCTGCT GATTTAATTT TCCTCAGGGA GCCATATAGC TTACACATTG TCATGAAAAA 660
GAATGAGGCT CTTTTCATTT GCAGTTGGAG CAGCAAGGGG CCAAATCTGG GTCAGAGATT 720
TCTTTGGGAA ACCAACAGTA ATCTGGGGAG GAGACCGAAA CACTTGCAGA GAGCATGTCA 780
AAAGCATCTC AGCCTTTGAA GGCAGAATGG ATGCCAATAA ACCTTCCCAC ACACACACAC 840
ACACACACAC ACACACACAC ACACACACAC AGGAAGTCAG TAGTTAACAC CTACCTGCTA 900
ATGTAAACTG TAAAAGCAAC AGAGCCACCC AGATCAGATT TGGAGTTGAA CAAAAGCTGA 960
GACATTAATA TTTCAAATGG GGTTTGTGTT TACATCATTC AATGAATGGT TCCTTCACAA 1020
ATCCTTCATA ACCAGCTGGT CACGTGATGA ATTTATTGGC AGTTTTCCAC AGTGAGAGAC 1080
AGCTTGTGTT TCCTGCCTCG TCAGTCTGTG TCGCACCATG CAAACACGCT GACAAAACAG 1140
ATTAGCAGCA TCCCTGCTCT CGTTTCCTGT GAGCCCAACA ACATCCCTAG CATGACACGC 1200
TACAATGACT CAAACGATTC GACAATCATC AGCGCTACGA TTAGCAAATG TGAAAATGTT 1260
TCCGTCTCTT CCCCCGTGAC ACGAAGAGGC CGGTCACGAA TTTCTCCAGC CTCCCCCACA 1320
GCCAGCCTGG GGAGTAGGTG TGGGAGTGGG AAAGCATGCT GGGGTTTTGT TTCTCAAATT 1380
TGCACTTCAT GTCGTGCTTG AGCCCACATT CTCACTACAC GAAGAGCGGA CTTTAACCAG 1440
CAAAACAAA 1449