EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR006-00684 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_4hpf 
Coordinate
chr3:40613914-40616274 
TF binding sites/motifs
Number: 15             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
FOXE1MA1487.1chr3:40615457-40615472CATAAAACAAACAAT+6.81
Foxd3MA0041.1chr3:40615461-40615473AAACAAACAATT-6.22
NR2F1MA0017.2chr3:40615027-40615040CAGAGGTCAAATG+6.25
RORBMA1150.1chr3:40615416-40615427ATGACCTAAAT-6.02
ZNF384MA1125.1chr3:40613934-40613946TTTTTTTTTTTT-6.22
ZNF384MA1125.1chr3:40613935-40613947TTTTTTTTTTTT-6.22
ZNF384MA1125.1chr3:40613936-40613948TTTTTTTTTTTT-6.22
ZNF384MA1125.1chr3:40613937-40613949TTTTTTTTTTTT-6.22
ZNF384MA1125.1chr3:40613938-40613950TTTTTTTTTTTT-6.22
ZNF384MA1125.1chr3:40613939-40613951TTTTTTTTTTTT-6.22
ZNF384MA1125.1chr3:40613940-40613952TTTTTTTTTTTT-6.22
ZNF384MA1125.1chr3:40613941-40613953TTTTTTTTTTTT-6.22
ZNF384MA1125.1chr3:40613942-40613954TTTTTTTTTTTT-6.22
ZNF384MA1125.1chr3:40613943-40613955TTTTTTTTTTTT-6.22
ZNF384MA1125.1chr3:40613944-40613956TTTTTTTTTTTT-6.22
Enhancer Sequence
TTACGTACAT ATATGTACAG TTTTTTTTTT TTTTTTTTTT TTGTGACTAT TTTATTTAGT 60
TTTTAGGGCA AAAGTAAAAA TATTCAAAAT GTTTTTTAAA ACAAAATATA TTTTATTCAA 120
TGCGAGAAAA AACTTGTTTT TCATTTAAAA ATAACTTATT TATAGCAGTA AGCACAATAC 180
CTTGAAACCG TGATATTTTT ATTTAAGGTT ATCATACTGT CACAATCTTA TACCGCCTCA 240
AGTACTCATA TCAGTTGATA TGTCAGCCAT AGACAGACCA GCACAAGTTT AAGGCCCCGT 300
TTACACTAAT GCATTTTCAT TTATAAACGC ATAATTTTTG CTAGGGTTAC GTCATCTGTC 360
CACACTTCGC CAGAGTTCTC GAGTGCCGAA AACAGAGCGT TTTGAAAACG CTGGAGAGGC 420
CGTTTTCATT CTGAAATGTT GCTGCTCCAT CTCAGTGTGG ATGAGCAAAA ACGGAGACAT 480
CTGAAAACAG ACGCAGGACT GCTGAGATTC ACTACCTGAT TGGGGCTTTT GTGTCATTGC 540
TTATCCTTCC CTTATTCGTC AAGCCCCTAT CACATGACTA TAACACATGG CTTTAACGCT 600
ACCAAATGAC AGTACTGTAA ACAACAACAT GGGCACAGAA ATGGGAGCGT TGTTTGCACT 660
ATTGTCTGTT TTAGGCGCCA TTGTGCAGGG ATTCATTTGT TACCTTTAGT AACAACTCAA 720
CCTCGTCCTT TGTCCACAAA AATACCTCTT GCTTTCTTTG CCATCGTGTT TAATGTTCAA 780
CCGGCGTTTG TTGACTAACA ATAACCAAAT GCCAAGCGAG ACGCATGCTT TCTGGTTATA 840
CTACAATGCG CATGCCTAGA GTGTGCGAAT GGTTACGTGA TATAAGTTTT TGGTGGCGTA 900
GTGTGGACAG AGATATGTTC AGAGATGCTA GGTAAAACAC TAGTGTGGAC ACGGATCGTT 960
TTTGATCTAA AACACACTAG TGTAAATGGG GCCTAAAATG CTCGGGCGTC AACAGTGGTC 1020
AGGGGTGATG AACCCTCTCA CAGCCAATCA CAGTCATTTC TGTTGAGCAC ATGAACATAA 1080
TTGCTAATCA GTGGTGCTTA AAAATATACT CAACAGAGGT CAAATGTTTT TATAAAATAG 1140
AAGTTTTTAA TATTCTAGAA CTGACTGTTA CCGAACTCAA CACTTTTGCC AAATCAACAT 1200
CAACTAGATT AACATTTCAC AAATCTAAGG TAAAATATGT ATAATTTTGT AGCTTGTATT 1260
GAGACTTAAA ATTCCTTTTT TGAGAAATGT AAACTTTTGG TCTTGTCAAT TTAAAAAGAT 1320
AAAGCATTTA ATAATTAGCA ATCATTCCGC TATCTATTTT GATTAGCTTG AACTGCACAC 1380
CTGGAGTATG CATTTTGTGC TAGAACTAGA GCTGCATGAC ACTGGGGGAA AAAAAAAACT 1440
GGCATTGCGA TATCTTGTTT TTCTGCTATA TACATTGCGA TAAGAGTGTA ATTTTACAAT 1500
AGATGACCTA AATAACTCTA CTTGTTAAGA ATTCATACAT CTGCATAAAA CAAACAATTT 1560
GCAAGCACAG GTGAATATAA TAGAAAAATA ATTTTTAAAA ATAGTTTTGT CTTTTAATGT 1620
TTTTGTGGAG CCTAAGAACA ATACTATTTA ATCATTGTTA AATTGAATTT CTTGGTTTAA 1680
ATTCACTTGA TATCTTAGTC ACAGTTCCTT AAAACACATC CAAATGAAAA TCTTTCACAC 1740
TACTAGGGTT CAAATTTGCC ATGACTCCTC AAATCTTAAT CTGAAATGTG GTTCCAGGTC 1800
ATTATAAAAT AACAACTCAT TGCAGATGTG ACTATTGAAG ATGCGCACAT TGCAATATCA 1860
ATGCTAAAAC CATATATTGT GCAGCCCTAG CTACAACAAA CATATAGTTT AGTCTTTAGT 1920
GATTTTTAGG AAAAGCTTTG CCAAATCAGA GTATCTTTAC AGGTTTGGAA AGTACAAGTC 1980
TCACTAACAC AACAAGTTAA ACACAGTTGT TTTGCAGTAA GAAGCAAATG TGTTTTAAAG 2040
CCTGAATGTC CATGACCTTA GTTTACTACT CCAGTGTGCG AGTTTAAAAA GTAACAGCAG 2100
TAGTTAAAAA TGCAATTATA ATAAAGGCAG AATACAAATC AAGCACTTGG TAATGTTGCG 2160
CATTCTTATA CAGTTGCATC CAGACTGCCT TATTCATTAA CACAAGAATA AAAGCCAAAC 2220
AACCCAACTA ATCCACAACG CCTTCAGGGT GAATCGCAGT CAAGTCAAGT GCTTTCTCAG 2280
GGCATTATCA GCAAAGACCT TTCCAATGAG GAAACAACGA GAAAAAAATA AGAAACTTGG 2340
ATTTCTTCCC TGATTACTCT 2360