EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR006-00681 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_4hpf 
Coordinate
chr3:32411711-32412559 
TF binding sites/motifs
Number: 10             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
RFX1MA0509.2chr3:32412376-32412392TGTTGCTATGGTGACC+6.04
RFX1MA0509.2chr3:32412376-32412392TGTTGCTATGGTGACC-6.06
RFX2MA0600.2chr3:32412376-32412392TGTTGCTATGGTGACC-6.24
RFX2MA0600.2chr3:32412376-32412392TGTTGCTATGGTGACC+6.36
RFX3MA0798.1chr3:32412376-32412392TGTTGCTATGGTGACC-6.28
RFX3MA0798.1chr3:32412376-32412392TGTTGCTATGGTGACC+6.39
RFX4MA0799.1chr3:32412376-32412392TGTTGCTATGGTGACC+6.16
RFX5MA0510.2chr3:32412376-32412392TGTTGCTATGGTGACC-6.14
RFX5MA0510.2chr3:32412376-32412392TGTTGCTATGGTGACC+6.36
TBR1MA0802.1chr3:32411826-32411836TTTCACACCT-6.02
Enhancer Sequence
GGATGCTAGC ACCAGTGCCA CTTAGATGTG TCCAGTTATA CCTCTTCAAC TTTGTCGCCT 60
CCTCATTCCG TTGTTTCTGG ATCCCTCATC CTCCCTCACA TCTTTTCACA CAACTTTTCA 120
CACCTGCCCT CTTTCTTTAC CTCTTTGTCT CTCTCCAGAC ATACACAGTG CATCGTCCCT 180
CAGTCCTCAC CCCTTTCTCT CTCTCTCTGT GTGTGTGTGT ATGTATGTGT GTGTCCCCTC 240
TCTTCTCTCT CTTTGCCTGT GGCTGTGTGT CTAGTACCAT GGAGCAATTG AAGGTGACAG 300
GGCCAGAGAG AGAGGAGGGG AGAGGGAGGA CGTGGCACTC TGTAGCCCGA GGGCACACAA 360
CAACACACAG AGAGACAGAA AGAGAGAGAG GGAGATGGTA AAGGAAATGG GAGGGCAGAG 420
ACGACAAAAT AAGGAAGAAG ACAAGTGCTC GGGAACCAAA CGGATGGCAC AGAGTGATGG 480
AGAGACTGTG GGTCTAATGA ATTATTTGTA ATTGATGCAT TAACATCAAT GCCTCCGCCG 540
GATTTTGCCG TCACAGGCGG GATATCAAGT ACAACACTTA TTCCTTTACC ACAGATACAC 600
GCACTCTCAT ACATGTACCT CGTGTTTTCT TTTTTTAAGG GCTTGATGTT AATTTGTCCC 660
GGCATTGTTG CTATGGTGAC CTCTCTTCCC CCTCCCCCCC AGCAGAGAGA TAGAGAGGGT 720
GACAGGGATG AACTAACAAG ACACTGAAAA AATGTGCCCT GAAGGAGCGA GCGCTCACAC 780
ACCAGCACAC ATAATAAACA CGCACTCGCA ACGTCACATG ACACTAAATA TTAGGCGCAT 840
TTTATTAG 848