EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR006-00674 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_4hpf 
Coordinate
chr3:23609844-23611460 
TF binding sites/motifs
Number: 16             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Alx1MA0854.1chr3:23611117-23611134GTTAGTTAATTAGTGCC-6.02
Alx4MA0853.1chr3:23611117-23611134GTTAGTTAATTAGTGCC-6.05
DMRT3MA0610.1chr3:23610541-23610552AATGTATCAAT+6.62
DMRTA2MA1478.1chr3:23610541-23610553AATGTATCAATT-6.92
DMRTC2MA1479.1chr3:23610541-23610553AATGTATCAATT-7.22
LHX2MA0700.1chr3:23611121-23611131GTTAATTAGT-6.02
ZNF384MA1125.1chr3:23610853-23610865TTTTTTTTTTTT-6.22
ZNF384MA1125.1chr3:23610854-23610866TTTTTTTTTTTT-6.22
ZNF384MA1125.1chr3:23610855-23610867TTTTTTTTTTTT-6.22
ZNF384MA1125.1chr3:23610856-23610868TTTTTTTTTTTT-6.22
ZNF384MA1125.1chr3:23610857-23610869TTTTTTTTTTTT-6.22
ZNF384MA1125.1chr3:23610858-23610870TTTTTTTTTTTT-6.22
ZNF384MA1125.1chr3:23610859-23610871TTTTTTTTTTTT-6.22
ZNF384MA1125.1chr3:23610860-23610872TTTTTTTTTTTT-6.22
ZNF384MA1125.1chr3:23610861-23610873TTTTTTTTTTTT-6.22
mix-aMA0621.1chr3:23611120-23611131AGTTAATTAGT+6.14
Enhancer Sequence
TTTAATTGGA ATTACATTTC AAGCATTCCC ATTTCAGTTT TTGGTCTAAT AATATGTAAT 60
ACAAAAGCAT ACAAATGCAT GCTTGACTAC GTATACTAAA CTAAATGTGT ATGGCAATTA 120
AACGGTTGTA TACTACAGAC ATTACAAAAA ATCTCTCTGC TGTATGTTTT ATTTATCGAT 180
GCACATTTCG CATATACGTT GTGTTAAAAT ATATACAAAG AATGTTGTCC TTGGAAAAAA 240
GTGTAATCCA AATAGCCTAT GAAATCTGCA TTGCAGTGAT ACAGTAAGTC GTGATTACGT 300
GCGTTTTTCA TTTTGGGAGT TGCTCATGCG AAACATTTAT TTGCAGTCTT TGAGAAAGCG 360
TTTGACACCT TAAATAATTG CTTAGCAAAT GGCAAGTCAC AACTCACAGT AAGTCCCATG 420
CTAGAATAAC ACTCACAACA TGTTTTTCCA TGTAAATAAA CATCCAAACA ATAACATCAA 480
CAGCAGTTCA TTAATTGTTT TGCCAAAAGG CTACTAGAGC ACTTTGCTGT ATTGTTGCAT 540
GCCATATTAA TCTAAAAAAT ATTTCTTAAT GTCATTATTT TTTAACAACA TTAGTGCCTT 600
ATATCAATGT GACACGGTAT TCGTCTTTAA ATTGCTTCCA CAATAGTGAT TGAAAGTGAC 660
TTATTGCAAA GATTTGCATG CTTTTTTTAT TTTTCGAAAT GTATCAATTT GCAAAATGTT 720
TTCAAACTGT TAAAAAATAC ACACGGCATT GACACTGAAG AAGTGGAGCA CAAACTAAAA 780
TATTTCATAA TGCTGCGTAA ATAGTTGGTG TACAATTTAA TACTTCTTTA ATATCCTTTT 840
TAACATCTAT ACAAAATATT TAAAATCCTT ATAATCAAAT TCATTATAAT AAAATTCAAA 900
ACGAATATCC AGTGTTCCAC TTGAGGTCGG ATAGTGTCCG GAAGTGTCGT TTCTTCTGGT 960
TTTTAGTGAT GTACATCCAT GAAAATAATG CTCTGAGATT GCTGTTGTCT TTTTTTTTTT 1020
TTTTTTTTTG TATTCCAGTC GAAAAGAAAG CGAAATGTAA CATCCATTTT CGTGCAGCTT 1080
AATATGCTGT CCTTTTTTAA TGAAAATTAA CAATATTACT CCCAGTCCAT GAAATCATGT 1140
CATAATCCAA GCTGTAAAAT TCGTTCCACT GTCTGAACAA TAACAGTTTG TTAATGTTTA 1200
TATCACAGCT GAAAGATGGC AAAATGAAAG AGTAGAAATT GTGTTTTCTG CATTTCGTTG 1260
CCTCAGCCCA CGTGTTAGTT AATTAGTGCC CTTTTAAGTG GCTCCCCATT GGATCCTTTT 1320
AGCAAAGGTT GCAAAATAAG GAACAATGCC GTTTAGTAAA AAGTTGCAGA CACCTACATT 1380
TTTGCCTTGT GCCTTCCTCC CACACCGTTG GTGATGCTCT CTATTCAAGC ACCTAGAAGA 1440
AATGCATCTT TTTAAAGTTG CCTGTTTACA GCTGCCTGTG TATGGTGGAA GTCATAAATC 1500
TTACGTAGCC ATAAACGACG GGGGTAGTGT CCTGAATAAT AAAAACAGTG AGAGAGTAAG 1560
AGAGAGAGGG AGACGTGGTG TTTGGCTTAA GGAGAGAGAA GTAGCAATAT CGCTTG 1616