EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR006-00673 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_4hpf 
Coordinate
chr3:23604811-23607302 
TF binding sites/motifs
Number: 4             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
HOXD9MA0913.2chr3:23605087-23605097GTTTTATTGC-6.02
SOX10MA0442.2chr3:23604991-23605002TTCTTTGTTTT-6.62
ZNF384MA1125.1chr3:23605543-23605555TTAAAAAAAAAA+6.44
ZNF384MA1125.1chr3:23605542-23605554TTTAAAAAAAAA+7.22
Enhancer Sequence
AGGCCCATCT TCGACGGAGA AACCGGGAGG AATGCTGGAT GTCAGGTAAG ATTTGCAAGC 60
TTCGAATGAT GCCGCATGCC TGGACTCTTC CTTGTGTCCC GAGCTCTTCT GCCGACAAGT 120
CATTAATTAT CCGTTGTGTG ACCTAGTCAT CCCTGGGTGT GCCCGATTTC GAAAACTTTT 180
TTCTTTGTTT TCAAACAACT GAAGATACTT GCTTTCAAAT TGGTAACCAA CGAGGACTAA 240
AAAGCTGTCT CATTCCACGC ATAGCTAACC TCATTTGTTT TATTGCTGTA TTATACTGTT 300
TTTAACTGAC GTTACTCCTC ATAAGATTAT TCACCAGTTA GCCTAATTTC TCAAATAGCC 360
TACTCACTAA CGTTAGTTGG AAAAGTGTGG AGATTCGCGC AGAGGTCTGA AAGTGTAAAA 420
AGACAGATTT ATGACCCAAA CAGACAGACT GCTTATTCTA CTAACAGCTC CTAATTTCAG 480
CCTTTGCTTT GCTCTCCACT GAAAGCGCCA CAGGTATCAC AAAATGGGCT TATGGCCATT 540
TAGTCTTGTT GTTATTTTTC AATTTTGCAG CTTGTAAAAC GACTGGTGTC CCTAAAACCT 600
ACAGTAGGCG CAAGCTGTCA AATGTAATAG AGGAGCGGCT AATAATTCAA ATGTGGCCTC 660
AAGGTAGACG GCTATATTGA AACATAATGT CTCCTCTGTG TTTCCTGTTC CTTGGTCGTT 720
TAAACGTGGT CTTTAAAAAA AAAAGAAAAG AAAACAAGGA ACAACAACAA CGAATTTTTA 780
TTCTACAATA GCCTGGTCAC ATTTTATTAT TGCTTAACCC TGCAGTTTTT ATTTCATCCG 840
AGACATTTGT ATCTTTTATA CAGATGCAAA TGCATCATAT TAGTGTTAGA TGCATTCATA 900
TTATTTGGTT ATTAAATATG TGTAATATTT TACAATTTAC ATGATAATTG ATTTAGAGCA 960
CCACTATACA ATACACAATA ATAACAAAAT ACCATCACTA CTACTAATAA TAATTTCCTA 1020
GTTATGCGTC GCGTAAAAAC TACAACTTTT TAATAGTTTT TCTTTTAATG AGTAAAGATG 1080
AGTGAATATG CCCCTTGTAA CATAGGACGA ATACATAATA TAATCAAATG TCAACAAACA 1140
TTGACTATAA ATCATTTAAA GATTCTGGCA CAAATGTTTG ACATCAAACA AGTAAAAGCT 1200
ACATGGTCAC TTGCAGACAT CTGCACCAAA AGGTTCTACC AAGCTCAGAA AGCAGCCAAC 1260
TGAGGCAAAC TGCGCGCTTT GACACATTTT GAAAAATCTG TTCTCTAAGT ACTACTTTTG 1320
GTTTTGTTGT TGCCTTCATG GTCGTTAGCC CAAAAGAGAA CTGTGACCAG CGGTTTCGTG 1380
AACTAGTTCA CAGATCTCAA TAAAACCCAC AAAACTCTTA GTGAATATAA TTTAATTGAT 1440
TTTATCATAA ATCACTGACA AAGAGAGAGG GGGACCAGTA AGAGGGAGCA ATTTAAAGTA 1500
TAGTGCAGTT GTCAAATAAT TCATAAACCT TTTTTATATA CATTTTAGTC TCAGAATAGG 1560
TTATTGCTGT CATAATTACC ACAATCTGTG ATTTTCATGG GCACCCATAA CTGCAATAGT 1620
GTGTGGAGTT GTGTAGCTTT GAACGTATTT ACACAGTGAC CACGAAATAA ATCATTCATT 1680
GAATGATTTA ACTTTTCTAT TAGTCTTGAA GTTAAAATCA AACTGCAGTT GTTTCACGTC 1740
TAACGGAGTG TATTTTTTAT GTTCTCTGGT CAGTTGTCTA ATTTGTGAAG TTGGCAGTTT 1800
TGGGGACCCT GGGGGCATGG GTCTGGGTTG ACCCAAAGAC CCTGTCTCTT CCCCAGTCAG 1860
TGTCTTTATT CAAAAAAAGT TAAACATTAT CCACCCTGTG CACAGATGGT CCTTAAAAAT 1920
TAACTTTGTG GAAGAATAGC TCAGTTTCTT TTTGATACAA GACCATCCTG GTGAGTACTA 1980
TTAGATTATT TAGGGTACGG GGTTGCGCAG CAATGTGTAA TCTCCAGGTT TGTAGTTACG 2040
TTTAGTTAGT CTTACAAGTA AATCCATTTA AACGATATTT TCATCTAGGT ACACCTCTAG 2100
GCCGGGTCAG TTAAACAGAT CAAACAGTGT AACCACCTGA CCCAACAAAT GAGAATAAGT 2160
TCTTAATTTG TTCAATCTTA TTTGTTCTGA GCATTGCATA CAGGTCAGTA AGCCAAACGA 2220
GAAATCTTTA GTTGATGCTA TATGCGTGGG TGTCAGAAAC CAAGCCCCCT GTCCATTCAC 2280
ACAGCCTGCG AGAGCAGAAA CGCCTTTAAT CGTTCAAAGA TTGGCCACAG AAGGCCTAAC 2340
GTATCCAGTG GCCTCACACT GAAGTTTGTG GTGTTGAAAG TTGGATGTCA TCCGCCAGAC 2400
TGCAAGAGAA AAGAAGACAT ATCTAGCCTC TCCCAGTTAA AAACAGCCTT CTCTCTCGGC 2460
ATCTGGGTAT GCTAAGCGTT CGAGCTCATT A 2491