EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR006-00672 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_4hpf 
Coordinate
chr3:23581061-23583446 
TF binding sites/motifs
Number: 2             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
RARA(var.2)MA0730.1chr3:23582782-23582799GGATCATCCAAGGGTCA+6.03
ZSCAN4MA1155.1chr3:23582491-23582506TTTGCAGGGTGTGTG-6.1
Enhancer Sequence
TTGAAGACCA TCTCCATGGA CTTCACTCTC TTTCACACAT ACAAGAGACA CACACAGGGA 60
CAACAATATG ACAATATACC TCCCCTAAGG TTCTACAAGA AAAGCTTTGT TCCTTCCACG 120
CCCCCGTATT TTTCAGGGAG GAAGTGCGTA GAGAACACAT AGCTGTACTT TTTTTTAAAC 180
GAGAAACTGG AGCAAAGTAT TTTGATACAC CTTGATACCA CAGTCGTCAC AATATTACAC 240
TTTTTTATCC TATATATTTA AATGCTATAT TTTAATAGTT CTATTTGACC ACTTTTGTTG 300
CCTCAAATCA GCTCAGAGTT CAACCTAAGT GTATTGTTTA GAGTCTGTTT CATTGTTACA 360
CTCATAGCAG TGCGAATGAC CTTTTGCTTA TGTGTTGCTG CGTGTTGCTG CAGCAGAGAA 420
ACTAAGACTG TACTTCTAAA AAACATTTGA CTTGTAAATC ATACCAAAGA TGTTCAGAGT 480
GTAGCGGGAG CTAAATCATT TACTCGGAAT CTGACTGAAA GTATAATTAC CAAAACTTTA 540
ATAATGGTTT CAAAACACAA TTCTAATTTT CCAACATGTA CTTAAGCATT TAATTATCTT 600
TTTTGTGGAT ATTGACAATC TATTTATCAA TGTATTAAGT ACAAATAAAA ACAATTTTAG 660
CTCCCCACAA ACGTCCATGT GCTATTTCAT TATAAACAAA ACTGAAGAAA AAAACATACT 720
AGATGTGAAT GTGACATCAT CTGTTGGACA TTGATTTTCT GCACTCACTT TAAACTATTT 780
TCAAAAGCTC AGCCTTGATT AGAAAACATT TAGCAAATTG TATGTTTTAT GTGCATACGA 840
ATAACGTTAG TGCTTATTTT GCTAATCGAA AAATTGTTTG TTCTTGCCCG CTCCTCTAAA 900
CATCAACATT ACCTAGACAA TAATAAATGT TAAGCTTTCA GAGTGTTTTA CAACCTACTT 960
CAAATGAGTG TTACAGATTT TATAGCCCTC CATTTGGCAT TGCTGTGTGT GAGAAAGAGA 1020
GGAGGGAGAG AGCGCGCGAC CTCAAGAGAG AGTAGCGTTT GTGTCTATGA GTATGTGTCC 1080
GAGCAACAGA GTTAGGAAGT TTCAGGCCGT AAACAGGAAG GCGAAATTGT GGTCGTGAGC 1140
ATGAGTCGAG GGCTACCGTT TCATTTTTCA CCAGCTTCCT TTTTGATGAT ATGAGTGGGG 1200
AGGGCTCCGG CCTGCAAGCA AAACAAATAA ATATATTAAA TTAAATTACT AATAAAAATC 1260
ACTCAGAAAG CCAAACATCA GTACTTCCAC AATAATCAAG TACTTATATA CAGTGCAAAT 1320
ATAACAATGC AAAGAGAGGA AAATCCATAT CCCTTGAGTG TTTATATGCG CTGTGGGTAA 1380
CTAAGGTGAC TGGGCGTTAA TTCAAGGTGT GTTTGTGCGT CAGAGAAATA TTTGCAGGGT 1440
GTGTGTGATA CGTTTTCACA CAAACTCGGG GGATCAAAGA CTACAGTTTA TGAAAACGGT 1500
TTTAAAGGTT AGCCCAAAGA CACATACGAC TAGTTGCAGG ATTTTCCAGC ATTCCCTGCA 1560
ATTGAGCATC TGGTACTAAA AATCAATTTC TGAGTTCTTT AGGTTTCAAC CATGTAGACG 1620
CAGCAATTTT AAACGTTTAA ATAGCAATTT TGAGACTAAT GCTTTTTGCA TATTGATAGG 1680
AGCAATCTGC GAGCATATCT CATCCATAAT GCATAGGGAC AGGATCATCC AAGGGTCAGC 1740
AGACGGGAGC TGCTGCGAAG GCGCAAGCGC GAAACAATAC AACTAGTCCA TAAAGCAAAA 1800
TTATGCGATG TTTGTCCTAA AAAGGTTTTC TGACTGAGAA TGTTATAGAG CATTATTTTC 1860
TTTTTAGCTA CAACATAAAT TCTATCTATA ATTACCAAAA CCAAAGCAAC AAACAAAACA 1920
TCCTACATTT ATGTGTAAGG GTGAAAAGGC TGGCAGTTAA AACAACCAAG AGTTAAATTC 1980
GCATCGCCCG CACATCATGC CTAAACCACG ATCGGATTAT TCATATAGCC TGGTTTAACT 2040
TACTTAAATA GAAAATAGAA AAGTAAGCTA AGCTAATTTC AAGTGAAAAC TGCAAATATT 2100
TTTATGAATA TAAATAACTG CTTAATTAGA AAACATTGAT AACGTACAGT GTTTATTAAT 2160
TTACGCCAGC CGTTACAATG AGAAAACATA TTTTTGTCGA AACTTTAAGA CATGCAAATT 2220
TACATTTGCA ATAACTTAAC AACAAAGTTA TTACAATCAT AAAACAGGAT TAAGAGCAAC 2280
AGTGAAATAC TTCTGTGTTA GCGATTGGGA ATCACAATTA ACATTTTGCA TTAAAATTTA 2340
AGGCATAATT TTGCTATACA CATTGTCAGA TGATTTATAT ATAAT 2385