EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR006-00670 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_4hpf 
Coordinate
chr3:19095882-19098044 
TF binding sites/motifs
Number: 15             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
ATOH1(var.2)MA1467.1chr3:19097238-19097248AACAGCTGTC+6.02
Creb5MA0840.1chr3:19096210-19096222CATGACGTCACT+6.04
FOXE1MA1487.1chr3:19097550-19097565CTTGTTTGTTTTAGG-6.43
Foxd3MA0041.1chr3:19097033-19097045GAATATTTGTTT+6.18
Lhx3MA0135.1chr3:19097886-19097899AAATTAATTAACC+7.22
PHOX2AMA0713.1chr3:19096602-19096613TAATTGGATTA-6.02
Phox2bMA0681.1chr3:19096602-19096613TAATTGGATTA-6.02
ZNF24MA1124.1chr3:19096336-19096349GAATGAATGAAGA-6.24
ZNF384MA1125.1chr3:19097658-19097670AAAAAAAAAAAA+6.22
ZNF384MA1125.1chr3:19097659-19097671AAAAAAAAAAAA+6.22
ZNF384MA1125.1chr3:19097660-19097672AAAAAAAAAAAA+6.22
ZNF384MA1125.1chr3:19097661-19097673AAAAAAAAAAAA+6.22
ZNF384MA1125.1chr3:19097662-19097674AAAAAAAAAAAA+6.22
ZNF384MA1125.1chr3:19097663-19097675AAAAAAAAAAAA+6.22
ZNF384MA1125.1chr3:19097664-19097676AAAAAAAAAAAA+6.22
Enhancer Sequence
TTATTGGTCA AATTGTTTAC CTGGCTGAGG TGGTGATGCG AAACGAATAA TTTTCTAATT 60
TTGACAAAAA TCTACATGTA TCTAGGTTTT TGCAGCACCC ATCCCCCATT GAGGTCGCTG 120
ATGTAGGGGG CGCTCGCGAG TCGCAGACCA AGGCGAACAG GCGGCTCTAC AGATACAATC 180
AGAGCAGACG GGAGGGGGAA GTGAGAGGGA AAAGGAACTC GCTGAAGCTG CCCTTTGTTT 240
CTAGATTTGC CGAAGAGAAC GGGGAAGAGA CCGGCGCCGA TATACACTGT AAGTCACGCT 300
CTAAACACGG CACAATGTTT GTAAATCACA TGACGTCACT GCGGACTTTT AAACGGAGAT 360
CGTCCGTAAC ATTTATCGAA CGCGAACAAG TTGTTTTTTT CGCCGGTTCG CGGTGCTCGA 420
GTCGGTCCGA CATTACAGAG CCACCGCAGA GGCTGAATGA ATGAAGAAGT TTTGGGATGC 480
AACTCGAGCG GGGTCAAGCG TACGGAAGGC GGGTTGGATC AATCATTTAA AGAAAGATGC 540
TCGCCGTATA TACACCTCTG TACTCGTGAT TTTTAAAGTA GAATTATTTC GGTTTGAAAG 600
CACACACGGA TATGGGGAAG CACAGCATGG CCGACTGTAA TCACACATAC ACACAACCCA 660
GTTCCTTTGC TTTTCTTTGT CTTTCCTATT CGGGTTTATT TATAGTTTTT AAATCGTTTT 720
TAATTGGATT AAATGAAGGG TAAACTGTCC AGCAACCATA CACTGTTTCA TAAAAACATA 780
TCCGAAATAT TTTCCGTCGT CAAGTCGTTT TGTTTCAACG TTATGTCTTT GGTTTTAATG 840
GAGCTGAGTT GTATTCTTGC TTCCTAACGT TAGCTGGGTC ACGTCTTTAA AAAAAACACA 900
AGGATAAATT TTGCATTACC CCATTTACGT TTACATTTCA CGACTTGCTT CTGTTATATG 960
TCTTGATAAT GCAGAGAAGA AACACTAATG AAGTTAATAG GTTACTGTTC GCTAATGTTT 1020
AGCTGTTGGT GTTAGCTTGC TGCTAATTCA CGTTAGCCTT GAGGAAGAAT TAAAATGTGT 1080
CGTTTTCGCT TCTTACTGCT CATTTAAACT TTTTTTTGGT GTTGTTTTAC AAATTTGTAC 1140
ACTTTATTTT TGAATATTTG TTTTTGTATA TTTGGTGATT TTTGCAAACA TCATATTTAC 1200
TCGAATTAAA CTTATTGAAA GGGTCATTAA CCGGCTTTTG AGGTTTTTTA AGCAGTGATG 1260
ACTTTATTTA CTTGATTTTG TTTTAAATAG AAGTCAGTTT ACTTTCAGAT TTGGAGTAAA 1320
TTAAATATTG CATATGTTTG TGACACTTGG TTAGAAAACA GCTGTCTGGT AATTTGGCAT 1380
TGTCTTGTAT GTATGTAGCC TACTTGTCAC ATCCTTTGGT CTAGTGAGCA TTTCTTACAG 1440
TCAATTTATT TGTGTCTGTG TTTATATACT TTTTTTATGG CTAACGTTAC AAAACATCTG 1500
AATATTTCCA GTGTTATTAG GTAGATACAA AACAAATGCA GTTCATTGAG CTTTGGATTC 1560
ACAATAAGAA CTGTTATTCA GCATTATTAA AGACTCTTCT GCTGCTGCTG CTCTCCTAAT 1620
TTTGATTCTT TGATATTAAA CTGATAGGTT TTCATGCTGT AATCGTGTCT TGTTTGTTTT 1680
AGGATATAAA AGTGTAACAT TTTGTGTGTG CATATTTCAG TTTTAATGTT AAGACAAGGT 1740
CATTTTAAGT GACACTAATG TTTATATCTA ATAAGCAAAA AAAAAAAAAA AAAACGGACC 1800
CCAATCCTCA TGTTTGAAAT GACAAGTGTA TTTTTAAAAG CTCTTGAATG ATTTCTTGCT 1860
TTATGAGTGA TACTAATTGT ATGCTTGCTT TAAATTATAT AAATGATTGT TACTTTATAT 1920
CCAATAAGCA ACCTGGATAC AATTTTTGGA AGAAAGCCCC TTCATTAAAC TGGTTAATGT 1980
TTTCATTGGC ACACATTAAG GCAGAAATTA ATTAACCCAG ACTCGTGGCC CATTTTAAGT 2040
TCTTTTATAT TGCAGCTATA ACTGGCTTCA TTCTGTAGCT GCTATGATGC TATAATTTTT 2100
TACAGATGAG CTTTCAGGGC ATTAGGATGA GATCAGATCT TAAGATGTCA AATTAGTGCT 2160
GT 2162