EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR006-00656 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_4hpf 
Coordinate
chr3:54094-56524 
TF binding sites/motifs
Number: 10             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
DMRTA2MA1478.1chr3:54583-54595AATGTAACAATA-6.37
KLF13MA0657.1chr3:54495-54513TAGACACGCCCATTACTG+6.1
NFYBMA0502.1chr3:54513-54528CTGATTGGCTGATGT-7.12
NRF1MA0506.1chr3:55496-55507CGCGCATGCGC-6.02
NRF1MA0506.1chr3:55497-55508GCGCATGCGCA+6.32
POU3F1MA0786.1chr3:54168-54180TTATGTAAATTA+6.27
POU3F2MA0787.1chr3:54168-54180TTATGTAAATTA+6.11
POU3F3MA0788.1chr3:54167-54180TTTATGTAAATTA+6.07
Pou2f3MA0627.1chr3:54166-54182TTTTATGTAAATTAAA+6.1
ZNF384MA1125.1chr3:54176-54188ATTAAAAAAAAA+6.74
Enhancer Sequence
ATTTTTACTG TCAAATACAC AATTTTCTTT AACCTGCTTA AATTAATGGG AATGTTAGCT 60
AAACAATCTC CTTTTTATGT AAATTAAAAA AAAACAATTC TGAATGTTCT CCAAACATTC 120
AGCAACAATT TAAAGGAGCT TTACTTTTAA TAATTTTGCA AACATTATAG GAGCAATATT 180
TGGTGAATGT TACTTTTAAA TAGTCTAATA TATCACGATT AAATAAAGAA TAATTATATA 240
AGAAATAAAA CTTTCCACTG GCAATGTATG ATGCTTTTAA AATGTTTGCA CGTGTTACGA 300
ACATTATAAA ATACCAGATG AATGAGGCTC GTTTAAAACT GCACAAAACA AACCAAGCAC 360
GCCCATAACC CATCAAGCAC CGCCCCTTTT GTTATCTCCG CTAGACACGC CCATTACTGC 420
TGATTGGCTG ATGTGCGTTT TTGGACACCA GGCTCCAAAT TAGGCTATTT TTCAAATAAT 480
CGCACCTTTA ATGTAACAAT ATTTGTCAAA ACTTTGGCTG ATATTTCAAC AAAATCTCAC 540
AGCAATTCAT AACTTTTTGA TTTAGTGGCT AATTCGTGTG ATGTAATTCG TACAATATAG 600
TACGATTTGC TCATCACCCA ATGACACTTG GGGTTAGGGG TGGGGTTGGG TGCCACGTCT 660
CTTTTTTTAA AATAGTACAT TTTCGTATGA CGAATCCATA CGAATTAGTC ACTAAACTGT 720
CAAAACGTAA AATACTTACG TTTCCTCATG AGATCAGGCT GGATATTCCA TCAAAAATCT 780
AATAATGTTT GTTGGTTAAT CGGTGAACCA GTCACTGATG ATTTTAGTAG ATTTCTAAAA 840
TGTTTTAAAT GTTGTTTCAC AACCTTCAGA GAACATTCAG AATAAACATT ACCGTAAAGT 900
ATCGTTAAAT TGTGAATGGG AAGTTTCCTG TACCAAATAA TAGTCTATAA AGTATTTCAA 960
AAACATTAAA TATTTGGATG TTCAGAGAAA ATACAAAAAT AAAATCTTCA TTATAGCTTA 1020
ATTAGAGCGC TCTTAAAAGT CTTAAACAGT TGTAGAGTTG CGTATTTTGC TTATAAAGGT 1080
TTCACGTCCA GTTTAAACAA TATAAACCAT AATTATTACA TTTAAATAAA CTTGAAATGC 1140
CTTTATAATA CTGAAAATAT CGTGACTATA CTGAGTTGCA TTGATTTTTA TGGTAGCCTG 1200
CCTACTGAAT AATCACAAAC ACCACATTTT TCATGTAAAT ACCATGGTTT GTATTCAAAC 1260
TATGACCACA GTAAAATCAT GGTGGATGTC TGTAAGCGTG GAAACTGTTT GTGAGTGCAT 1320
TAAGTGCATT AAGCTCATAT TGATCAGGGG AATCAGATTC TCCGGGACAA TCAGCGCTTT 1380
CCACTGGAAA CTGGCTGACT GGCGCGCATG CGCACTGAGG AGGACGAGCG GCAGTTTCGC 1440
GCGCTCGCAG TTCAAACGGT CATTCTTCAG ATTTTCCTCA CAGTAAACAA TGTGGAAATC 1500
TCATCAGAAA ACTTTTAATA ACTCTCCAGC GGGAGACGGT CGTCGTGCAG CAGATGTTCG 1560
GCTCAGATCT GCGGGATTGA GACTGTGACA TAAAGCGTGA CGCGCAGGTA GGCTATGTTA 1620
AAGCGCACGC GGTAAATCCG GTAAAGCTCC AGATGCGGCG CGCGATCAAG TGCATGATCT 1680
CAGATGGAGA GTAATCTCTT TTCATTATTA TTACAACTGC AAGTTTCTTT TCTCTGCTTC 1740
AGCCGCATTC ATCCTCCCCT CATCTGTCCA TCCATGAGTG TTTCTGTACC CAGCCCTTTA 1800
AACGCCTGCT CGATATCAGA GTCATAATAT TATAATATGA TTAGCATATT TAATAATAAT 1860
GTAAACACAT GTTTGCTAAA TCAAGAATGC TATTTTTCTG AGGTAAATTT GCAGCTATTA 1920
AAACATGACT TCTTAAAAAT GAACCTTGTT TTCTTACAAA CACTCTAAAA AACATTGAGT 1980
TATTTATTTA ACCCAATGCT TGAGTTAAAC ATATATGGTG CTTTGTTGGG TTAGTTTTTA 2040
ACCTTTATTA GGTGATTTAT TAATAACTCA ACGAGTTGAG TTAAATATTT GGTGCCTTGT 2100
TGGGTTATTT TAACCTTTAT TAGGTTATTT ATTAATAACT CAACCAGTTG AGTTAAATAT 2160
TTTGTGCCTT GTTGGGTTAT TTTTAACTTT TATTTGGTTA TTTATTAATA ACTCAACCAG 2220
TTGAGTTAAA AATTTGAATT TCAACAGTCA ACTGATTTAA CTGACACAAA ATAACGGTAT 2280
TAATATGCGT GTGCAATGTT GTTTTTGCGT TCTAAAGTTT ATTTTAGTTA TAACACAATA 2340
ATTTTGTTGT TATTTTTGAT CAAATTACCT CTCTGTGTTG TGGTTTTTAT ATCCGTTTCA 2400
CCATCCAAGA CCATCTTTTA GAAGCGTTTG 2430