EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR006-00653 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_4hpf 
Coordinate
chr25:33643813-33645287 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
PLAG1MA0163.1chr25:33644868-33644882CCCCCGATGGCCCC-6.95
SOX13MA1120.1chr25:33644996-33645007TGCCATTGTTT-6.62
Sox6MA0515.1chr25:33644998-33645008CCATTGTTTT+6.02
Enhancer Sequence
GAGGGAACAA TAGACCTACC GGCAAAGCAC ATTAGACCTG TTTAAGTCGT CCCCCCGCAA 60
AGTCACACAC ATTTCAATTA TTTCAAAGCG CTCGCCAATT AAAAAGCTGC AAGCGCGCCT 120
TTTGAATGCA AACCCACACA ATTAAAAGTG TTTCAGGAGT GTATTAGAGG AATCAGTTCT 180
GAATTAGTTC TCTGAATACA CAAGCCCCCC TCTGCCCTCA TCTCCCGGGC CTTTCAGGAC 240
AGGAGCGCGG GGCTCTGTTT GAAGTTTCCT CCCTCGCCCC GTCTCCTTCA CGGGGAAAGA 300
AGATTGAGTA AGCCTAATCT GCTACTTGTA CATTTGAATG TGTGCTGAGA GGAGATGATC 360
CCGGTCGCCT GATAATGGCC CAGGTGCAAA GACACTGGCC GTGGCTAACT TGTTCTCGGC 420
GGGGGCCGTA TATCACAGAG GGGCAGCCCA CCCTTTGAAG ATGCATGCCT GCTTTCAGGA 480
GCTGATTTGT GGCCCGCGGA GGCCAGCGCT TTACAGCCCC TTCCGAAGCA GAGCTCAAAG 540
GAGAGCGTGC CCCCTCCCCT TGCCGGGACA CGGTGGTGCT CGAGAGCCCT TCTTCAGATT 600
GTAGAGCTCG CTGTCTTGGG TGGGATGGGT TTTAAAGCAG CGTTTCTCAA CTGGCGGGTC 660
GCAGCCCAAA AGTGGGTGGC AGGAGTGTCA TGAGTGTGTC GCAGTTTTTT TCGTGATTCA 720
AAAACCTATT TTATTTTTAA AGAGTTGGTT GACCCCTAAA ATAATATTCT GTTATTATTT 780
CTTTAACAAT TTCATCAAAA ACACTGGGGT AAAATAAATA ATATAGACAT GGTGCTAAAA 840
AAATGGAATT TAATGCAGTG CTTCTTGTTG GGCCTGAGAC CCGCTTTATT TTGTATGTCA 900
ATCAGGCAAT GACGATCACT GATTTTTAAA GAAATCTGAT CTTAAACTTG GCTATTTTTG 960
GGCTGGCAGA CTAAAAATTA AGAAGTCTGT GTGCATGTAT CTCATTAGGA TATTTTAGAT 1020
GAAATCCGGG AGCTCTCTCA TCCTCCATTG ATAGTCCCCC GATGGCCCCG AGATGTTTAA 1080
GGAATCAAAA ACATTGTCAA CACTTTCCTT GTGACTTTAT CTGTAATCAT ATGAAGCTCC 1140
AAGAACAGTT TTGTGCACCA AACGCTTTAC AAATTACTTT GTTTGCCATT GTTTTTCGTA 1200
TTGCATAGGG ATGCGCATTT ACTGCAAACT GTATGATGTT TGTGTGTTGT GCTGCTGATG 1260
CTATTGGCAA TATGTCATAC TGCCTGTAGT AAATGTGCAC CCTAATAACC TTAAAGAGGT 1320
GGTTCACCCA TAAAATGATT ATTATGCTAT TAATTCCTCG CGTTCATGCT GATCAAAGAC 1380
CCCTGAGACC CTTGTTCCTC TTTGGAATAC AAATTAATAT ATTTTAGATG AAATCCGGGA 1440
GCTCTCTCAT CCTCCATAGA TGGTCCCCTG ATGG 1474