EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR006-00608 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_4hpf 
Coordinate
chr23:37887043-37890671 
TF binding sites/motifs
Number: 21             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Arid3bMA0601.1chr23:37887221-37887232ATATTAATTAT+6.02
Foxd3MA0041.1chr23:37887982-37887994GTTTGTTTGTTT+6.32
HOXA10MA0899.1chr23:37887441-37887452AGTAATAAAAA+6.14
Hmx2MA0897.1chr23:37889663-37889680AGAAACAATTAAAATAT+6.1
Hmx3MA0898.1chr23:37889663-37889680AGAAACAATTAAAATAT+6.14
IRF1MA0050.2chr23:37889473-37889494GTAAAGAAAAAGAAAGTACAT-6.12
NFIL3MA0025.1chr23:37890508-37890519TTATGTAACGT+6.32
POU4F3MA0791.1chr23:37890500-37890516TTTATTAATTATGTAA-6.04
SOX13MA1120.1chr23:37889137-37889148AGCCATTGTTT-6.14
Sox6MA0515.1chr23:37889139-37889149CCATTGTTTT+6.02
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ZNF384MA1125.1chr23:37889400-37889412AATAAAAAAAAA+6.62
Enhancer Sequence
TTTTTATTTG TCACCATACT TCACCAGTAA TTTATTATTT TAACATTTAT TAATGTTTTA 60
CAAAATTTTC CTTAATAATA ATTGTTTAAA TAAATATTCA ATAATTTGCA AACATTTCAA 120
CCACAAAAAT CTCAACAATT TTGTTTATTT TATTATTTTA AAGAAATTAG TGTAAAAAAT 180
ATTAATTATA ATTCAAATCC ACAGATAGAA ACAAAAAAAT TGTGATAAAA AAAACAATTA 240
AGGGTATATT GTGTTTTTGT TTTCTCATTT GACTGAAATA AAAAAATTAA ATAAAAATAT 300
GAAGCCCAAA ATCGAACGAA AAGTGCATGC AATTGAAATA TAAAGTGCAT ATTTCACCAA 360
TCATACATAG TTGTGGACTG TCACTCTTAA AATGATCAAG TAATAAAAAG TAAAATATGG 420
AGAAGCATAA ACAGAAAATC TTGCATGCAT TGGTTTCTTT TATAAATCTT TCTGACACAA 480
CACCAATGGG ATTAGGCCTT AGGACAATAT TCTGTTTTTG CGGCCTCCCC TCTGCAGAGG 540
CAATGATAAA AGGAAAACTC TTGCTTGCCA ATCACTGTGG CCTCCATGTA AATTCAAAGG 600
CCTGTGGCCT GTTAATCCAA GGATAATGAG AAAACCCCTG GGTACAAAAA AGAGCACCTC 660
CCATCCACCC CCAAGCACAT ATTCACAGCT AACACACACT GGGCACAACA ATCTCCTCCA 720
TGCCCCCTTT TCACTGGTCC AAATGATGTG TAATCCTAGT CTAAACATGA CAGGCAAAAG 780
GCTGTGATAT TGAGATAAGG ATTGAGGTGC TGAACAATGG CGTGAGATAC AATGGCTAAA 840
TCGGCCATCA ATGTGTCACA CAAGAGCCTC CTGATCCAAA CATATGCTCA TATTCTTTAG 900
ATATATGGGC CGGTTTATAG TTCAACAAGC TGCTCTTGTG TTTGTTTGTT TAGATGTGCA 960
AAACTTTATA TCAGCTTTTG CATTGAGAAC GGCCAGTTGT GAATCAATGT TTCTATGATT 1020
TAGCATTCTC TTCCTCTTCA AAAAAAAAAA AAAAAAAAGG TTAAAATGAA TTTTTTACTG 1080
TGTAAAAGTG AGATTTACAA GTTTACCCCA ACTTAAAAAT CATTTATTTA CCCTCAAAAT 1140
GTTTCTAAAC CTGTTTTCTC TATTGAACAT GAAAGAAGAT TGTAAACCCG GCTTCCAACA 1200
TTTTTCGGAG TATCTTCTTT TGTTTTTTAA AAAACTTAAA CAAGTTTGGA AGCTCTTGAA 1260
GGTGAGTAAA TGGTAAGCTT TCATTAGAAA AAACATATCT TTAGGTAAAA TTGCTCAAAT 1320
GTGGAAATGG CATCCTCTTG TGGACAGTGA GAGTATCCCA CATAGAGTCT GTCAGACACG 1380
ATGGCTCAGT GGTTAGCACT GTCGCCAAAC ATCAAGAAGG TAGCTGGTTT GAGCCCCGGC 1440
TGGGTCAGTT GGCATTTCTG TGTAGAGTTT GCATGTTCTC CCTGTGTTGG CGTGGGTTTC 1500
CTCCCGGTGC TCCGGTTTCC CCCACAGTCC AAAGACATGC GCTATAGGTG AATTAAAAAG 1560
CCAAATTGGC CATAGTGTAT GAGTGTGTGA ATGCAAGAGT GTATTGGTGT TTCCCAGTAC 1620
TGGGATGCAG GCTGTAAGGG CATCCGCTGC GTATAACATA TTCTGGATAA ATTAGTGGTT 1680
CATTCTGCAG TGGCAACTCC TAATTAATAA AGGGACTAAG CCAAATGAAA ATGAATGGAT 1740
GATAATGTGG ACATTTAACA CATTGTAAGT AGAAAATATA TGAGAGAATC AGGAAAGTTT 1800
AATATTATGT ACAGGTTTTA TTCAACGAAA CAGGCAAAAA ACAATCACAA TTACAAATCT 1860
GTACAAAAAC TTTACACACA TATATATACA GGTTTCCCAG TCCCTAAAAA TTTGAAAAAA 1920
ATTAAATAGA TAATATTGTA CAAGCCTGTA GCCAGCCTGG TGTGTGTGTG TGTGTGGGAG 1980
GGGGGTTCTT TCTCTCAAAA TGTAGACCTT TTAGCAGTTT TTCCTCTTCA TTTTCTGTTT 2040
AATTATGAGA TTTGAATACG GTATTTTAGT ACTGTATTTA GCGGACATTT TAAGAGCCAT 2100
TGTTTTGCTG GATTAGCTAG TTGGATGGTC ATCATAACCA CACTTTTTGA TATAATATAT 2160
AATATTTCCT AAAGATTTAT AAAGAAAAAT GAAAACATAT TTTTAAAATA CACATTTATT 2220
ACATCATATA TTATTAGAAA AAAAAGTAGT ACTCTGTTTA GGTTTTACAT TTAAAACTGT 2280
AGCCTATTGT CCTTTATTAG GCAAATAACA AACTGGCTAG CACATTCAAC TGTCCTCAGT 2340
CAGAATTTGG CCATTATAAT AAAAAAAAAA TAATAACATA ATAATAACAA TAATATAATG 2400
TAGAGCTTCA TGATTTTTTC AGCCTCTTTT GTAAAGAAAA AGAAAGTACA TAACAACAAT 2460
AACCAAAATA TATTAAAAAT AATTTAATAT GGGTCGCTTT TGGTGCTTCA CACATTTTTT 2520
ATTTTAAGAA TAAGGTCCAA GATTTAGAAT AAAAGTTACC TGTAAAATGT TTTCTCTGTT 2580
TAAAAACAAT ACAGTAGCGA AAGATGACTT CTCTTACATC AGAAACAATT AAAATATTTG 2640
TTAGCATTGG CCATGACTAG GGCCAGATGG AATCTGCAGA CGTTTTTTGC CATTTCTGCT 2700
GAGAATTTTG ATAAAAATTT GCAGAATTAA TTTTGGGAGT ATCATAACTA AAATCTTAAT 2760
ATGCGAAATA AAAAAATAAT ATCTTTTTAA CTTTTTTATA TTTAAAAGAA AATCCAATTA 2820
GATCCACTTT ATTTGGTAAA CACAGCAAGT CTCTCATATA ATATATCTAC TAAAAGACAG 2880
AAAATATTAC TGTACAAACT TCAGTGTACA TAAATCAGAT GAACATTTTC ACATTAGTTA 2940
ATAATATTAC TGTAATTCCT TTAAAAACTG AATACATATA GATTTACACA CATTTACTCG 3000
AGTAAATAAA CAGAATTAAT GATGGGCTGA AAATCTGTGG AATTCTGTGG GCACAGATTC 3060
TGTGTGGGCC TACCCATAAC TGATTAGCTG AAGTCATGCC GAAGAGACAG CCAACAGAGG 3120
ATTCCGCTTG GTCTTAAAGA CTTCTACGAT GGGTTATTTG CACTATTTAT AATAGCATAG 3180
CAGTCAAAAT AGGACAAATG AGCTCATGTA TAGGACAAAT TCTGGACCTC TGTCAGTAAG 3240
GGCTGGGTCT TTCAAACCAC CAGAGCCCCC TGGCTATTTT TAAAAATTAA TATATATATA 3300
TATAAAATTT TTTTTCTTGA AAAAAATTGT TAGGCTCTTA CCATAGGGTT TGCTAATGTG 3360
TTACTTTCCC AACACTTGCT TACACTTCTT ACATAGCTTG CTTGACTTAT GTAAGCATTT 3420
ACACAATACA TCATGTTTCC TGCATGAGGT AGCCTACTTT ATTAATTATG TAACGTTGAA 3480
TTGCTTTGCT TAATGTAAAC ACATGAGGTA AGCTAAAAGC ATATAGCCTA CCTTAAAACT 3540
TATGTTTATG TGACCCTAAG CTCTTTTCAA TTAATTCCGA GCAAACGTTC AACCAATGTT 3600
GTGTTTAATA CATAAAAACT GTATCAAT 3628