EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR006-00595 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_4hpf 
Coordinate
chr23:23429581-23431653 
TF binding sites/motifs
Number: 10             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
FOXC2MA0846.1chr23:23430543-23430555TTTGTTTATTTA-6.18
LMX1BMA0703.2chr23:23431316-23431327TTAATTAAATT-6.32
Lhx3MA0135.1chr23:23431313-23431326AAATTAATTAAAT+6.07
NR2C2MA0504.1chr23:23430611-23430626ACAGGTTAAAGGTCA+6.03
Nr2f6MA0677.1chr23:23430612-23430626CAGGTTAAAGGTCA+6.7
POU4F3MA0791.1chr23:23429590-23429606CTAATGAATAATTCAA-6.18
RXRBMA0855.1chr23:23430612-23430626CAGGTTAAAGGTCA+6.33
RXRGMA0856.1chr23:23430612-23430626CAGGTTAAAGGTCA+6.62
RxraMA0512.2chr23:23430612-23430626CAGGTTAAAGGTCA+6.69
SOX10MA0442.2chr23:23430048-23430059AAAACAAAGAA+6.62
Enhancer Sequence
TAAGCAGCCC TAATGAATAA TTCAATGTTA TCATTCAACT TGCCGCTCAG TTATTATGTT 60
TTGATTCTCT TTTTTTTCAC ACGTGAGGGA ACCGGCCGGA CAGGGGGTAT CGTGCAGGGG 120
CACCTAGGGG GAAATAATGC ACGGCATGGG ACAAAACAAG AAAGGCCCCG GCGCAGGACT 180
CTGGCTGTCA GCTTGATAAA TATAATGTGT CACCAATTAA AAACTCATTG CCATTCTCTA 240
ATTCAGCCAG TGCCTTGTTA ACCGCTGCCT GGCAGGGAGG CTCCCGCTCT GTCCCGGCCC 300
CTGCTACCAG CACCCTCCAT AATAGAGGGC CTGCTTTTCC CATCCTTTAA AACCACATCC 360
CCTTTCCATT GGCATGTAAA TAAGACATTC ATTCAGCACC ACTTTTTCCA TCCGAGGCCG 420
AAAAAAATGA CCATCAATGT CTTTGATTCA AATCTTTTTT TCTCCGGAAA ACAAAGAATT 480
CTATAGTTTT GGATTTTTTT TTTCTTTTTA CGCCAAAAAA AACTTTTCTT GCCTTTCTTT 540
TCGGCCATTC TCATGTTAAT GGTGTTGACA CAACTTTGGG CAACGTGGGT ATACAACGCA 600
TATGAACCCT AGCAGGAGTC CATTACAGAA ATGCCATTTA GCAAGCTGTT TCTGTGAGAA 660
AGTCAAACGT TTAAGAGGTT TTTTTTAAAG AGCCTGAGAA TCAGTGCTTC ACAGGAGCAG 720
CGGGAGGCCT TTTTTCAAAG AGTTTTCCTG AAACTAAAGG CTTTCCAGGT CTCTGATGTT 780
TGCTAACCAG AGTCAAAAGT GGCGGAATGC ATAAGAATGC TGTTTATTCT TAAGCGATGT 840
GTAAATGGTT TGTCTTCTAG GAGTTTTGCA CTCGAGCGGT TTAGTCCTCA TTCAGAATGT 900
CCTTTGGTCT TTTGCCTTGA AGTGCTAGAG TCATGTTTGT TTATTTGTTT ATTCGTTCAT 960
CATTTGTTTA TTTATTGTTA TTAAAATTTT GTTAAACGTG TCTCAGAATC CAACATACAA 1020
ATTGGAGCAG ACAGGTTAAA GGTCAGAGGA CTAATCAGAG CGATGGATCA GTTGAGTCAA 1080
CGAGGTGTCA GTGTGTCAGC ATCTAAGACA GGAAGAGAGT TTGGCTTGGG AGATTTTGTG 1140
TTCAGACAAA GCAGAAAACA CCTTATTGTT GCATCTGCAT TCAATTAAAC ATTGAATTCA 1200
CAAAAATACT TTTATATAAC CTGAAAGCAA AAAGTCTAGT TTAAGGATTT AAATAATATA 1260
ATAAGTCAAA ATGTGCAAGA AATAACATAC CTATTCTGAT TTTAACTTAC AAGATTATAT 1320
TAAAAAAGTC TATTTTTAAG GACTTAAATA AAATAAAAAG GTCAAATATG CAAGAACTAA 1380
CACTTATTTT TCATTCTAAC TTACAAAATT ATATAAAAAA TCTATTCTAC ACTCTCAGAA 1440
ATAAAGGTAC AGGAGCTGTC ACTGGTGCAG TACCGTTTCA AATAGTACAT ATTTGTACTT 1500
GAAGGGTTCA TTATGGCACC TCAAAATGAC TTTTTAGGTA CATTTGAGCA CTGTTATGCA 1560
CCATTGATGT ACCAATGTGG ACTCTTTGGC TACAAATTTG TATCTTTTAA AAAGATACTG 1620
CCTCAGTGAC AGCTCCTGTA CCTTTATTTC TCGGAGTGCA AGGTTTCATT ATATAATATA 1680
AAAAAATTAA AATATGCAAT AAATAACATA TTTAGTCAGA TTTTAACTTA CAAAATTAAT 1740
TAAATTGTCA ATTTTAAGGT TTTAAATAAC TAAAAATGTC AAAATTCAAG AAATAACATA 1800
CTTATTCTGA TTCTAACTTA CAAAATTATA TTAGTCTATT TTAAGGTTTC AAAAAATCTA 1860
AAAAGGTCAG AATATTAAAG AAACAACATA CCTATTCTGA CTCTAACATA TAAAAGAACA 1920
AGTGATCGCA CTGCATTTTA TTGTATTTAA AAATTAATCA AAATATTTTC CTGACAAATG 1980
ACTATAACTT TTTGGTGGTT TGAAGCATTG TGACAAGCAT AAAGATTTAC AATGATAAAT 2040
AATTTCTTTT TAATGTGTAA TGTAATCTTT TT 2072