EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR006-00580 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_4hpf 
Coordinate
chr23:9924435-9926637 
TF binding sites/motifs
Number: 25             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
HSF2MA0770.1chr23:9924947-9924960TTCTAGAACGATC+6.04
IKZF1MA1508.1chr23:9924865-9924877GAAACAGGAAGT+7.22
IRF1MA0050.2chr23:9926228-9926249CATTTGAAACTGAAACTGAAT-6.64
IRF4MA1419.1chr23:9926231-9926246TTGAAACTGAAACTG+6.5
IRF8MA0652.1chr23:9926231-9926245TTGAAACTGAAACT+6.87
IRF9MA0653.1chr23:9926230-9926245TTTGAAACTGAAACT+6.02
LMX1BMA0703.2chr23:9926580-9926591TTAATTAAATT-6.32
Nkx3-2MA0122.3chr23:9925713-9925726TTTAAGTGGATTA-6.13
PHOX2AMA0713.1chr23:9926581-9926592TAATTAAATTA-6.62
POU2F1MA0785.1chr23:9926149-9926161AATATGCTAATT+6.52
POU3F1MA0786.1chr23:9926150-9926162ATATGCTAATTT+6.11
POU3F2MA0787.1chr23:9926150-9926162ATATGCTAATTT+6.14
POU3F3MA0788.1chr23:9926149-9926162AATATGCTAATTT+7.12
PROP1MA0715.1chr23:9926581-9926592TAATTAAATTA+6.32
PROP1MA0715.1chr23:9926581-9926592TAATTAAATTA-6.62
Phox2bMA0681.1chr23:9926581-9926592TAATTAAATTA-6.62
SPICMA0687.1chr23:9924864-9924878AGAAACAGGAAGTC+6.05
ZNF263MA0528.1chr23:9925120-9925141GCTCCCCTTCCCCCCTCCCTC-6.19
ZNF384MA1125.1chr23:9925341-9925353GTTAAAAAAAAA+6.04
ZNF384MA1125.1chr23:9925344-9925356AAAAAAAAAAAA+6.22
ZNF384MA1125.1chr23:9925345-9925357AAAAAAAAAAAA+6.22
ZNF384MA1125.1chr23:9925346-9925358AAAAAAAAAAAA+6.22
ZNF384MA1125.1chr23:9925347-9925359AAAAAAAAAAAA+6.22
ZNF384MA1125.1chr23:9925343-9925355TAAAAAAAAAAA+6.37
ZNF384MA1125.1chr23:9925342-9925354TTAAAAAAAAAA+6.44
Enhancer Sequence
GAAAATAAAA AATTCATCAG ATAAATCCAA AATGCCACAT AATCTTCCAC AGCGAGGAAC 60
AAAACTCACC TTTTTCACAA GAAAATATTC CAGCAAAAAA AGAAAAAAAG AAAAGTCATA 120
AGTAATCAGC AGATTGAGTC AGAAACGACA GCAATGACAT TAGGAGAAAG ACTATCCGCT 180
TCAGAAAATC TGAATTAGAC ATAAGATGTC TGAGAAAGAA ACGCACATCT AAGTGTGTAC 240
CCAAGGGCCT GAGAGCTCTC CATTTTGGAG TTTAATGCGA GGCCGAAAGG AGCCGCATGG 300
ATGTAGTTTC ACATTAGGGC CAAGTCACGT CAGAAACTCC CATCCACTAG GCCTCCCTTT 360
TCCTTTTGGC TTCGGAAAGG TCAAGCCAAC TGTGTGGCTG AAAAATCCAG ATCCCTACAC 420
AGAAATCAAA GAAACAGGAA GTCCTGAGGC TGATCCGGTG AAGAGGAAGA AAAGCACCAA 480
TCTGCAAGCA AACCTGCCTC CGAAACCAGA TCTTCTAGAA CGATCTGAGA CAAGCAGAGG 540
TCCTCGCAAA CAGACCAAAT AAAGAGAAAG GCAGCTGTGA ATGTGGAGAT AACTGGTCAG 600
AGAGTGAGCC GAGGTCTCTC TTTTTTTCTC TCTCTTCGCA GGAAATGAGA GTGCCTCCCT 660
TCCCCCACCG CTCCGTTCGG CTCGAGCTCC CCTTCCCCCC TCCCTCTAGG CCACAGACGC 720
GGGCTCTGGC ACGTCCATGG CACAGGAGCT TACAGTAAAC AGGGAGAACG AGAGAAAACC 780
TTGCGTTTAG GCCAGTCTCA AGAGCCACAG CTGAGAAAAA AACAAGTCAA GTGGTAATGC 840
ACTTGAGTAT CAACATGCAA ACTAACCTCA TGCCACACAG ATGAGGCAAA ACCTTCCTCT 900
TGAGCTGTTA AAAAAAAAAA AAAAGTAGTG TGGCCGCTTT GCGAATCACT TCAAGGGCAA 960
CACCGTTGCT TCCTGTCACT GATGCTGACG TCGATATGAT TTGACTGCTT CTGTTGCTCT 1020
TTACTCAGGC AAAATAGCCT CGTCAAACCA CTGTAGGTCA TTTATTCCTC CAAGTGGAAC 1080
CTAGCCGATT CTTTACAACG TCTTTTCCTT GACAAGAATC CCAGTCGCAG TGGTGTAATA 1140
TCCCTGGGAA CACACAAAAC CTGAACTACA CTGTATTAAG ACAAGCTAGG TTAACAATTT 1200
ACACAAATCT ACACTGTAAA AAATGCTGGG TTCCACACAA TTCCCACATC TAGTCCCAAC 1260
ACAAATCGTT TTTACAAATT TAAGTGGATT AAACAGAATT ATTAAGTTGT CCCCCCCCCA 1320
AAAAAAAGAA ACATAAGAAT TGTGTTGTTC CAACTCATTT TAAACAAGTA GTTTGAACAA 1380
GCAGCAAAAG TCTTTTTTGA GTGTAGGCAA CTATATTGTG ATAGCAATTA CAATAATTGT 1440
CCATAATTAC AAGAGCCAAT TCACAAACCA TTTGCTGTTT GATAAACAGG CGAAATATGA 1500
TACGTATTGG ATGGGGTTTT TGAAACGCTG CCATAAATAT CATTAGAAGG GCTAAGGATC 1560
CTTTGGGAAT GTGGCAGGAG GCTTTTAGTC CCGTGTGGTT TGTGCTCGCT TGTTTTGTCT 1620
TTGGGATCAG CTGTGTGTGT ATGTGTGTGT ATATGTATGT GTTGCGGTGC TATTTTATTG 1680
TTAACTTCAT CGTAAATCTT CAACCGAGAT GAATAATATG CTAATTTCAT CTGAATAAAA 1740
GGCGAGTTTT ATGTCACAGC CTGCTCCTGC TGGGTTTTGT TCTTACACAA ATTCATTTGA 1800
AACTGAAACT GAATTCAAAT TTGATGCATT TCAGCTCAGC TAAAGAGCTA AAAACTAAAC 1860
ATCTGCTCGT AAACGGAAAT GCAATCGGAT CATAGTTCTG ATGACCTTTA AAACCTACCA 1920
TATGTCTGTT CGCATGCAAA CAGACAAAAG TACATACGTT TATGCATAAT CAGTGTGAAG 1980
CTGATGAACT CTTTCTACAA TATAACCCAC ATGTCAAAAA CAGTAGAACC TTAAATTACA 2040
AAATGGCATC TCTGGCTAGT CATACCTGCT CACACTATAT GTGACTATAC ATTAAAATGC 2100
ATGCAATTCA AAAGCAAAAT AAATAAATAA TTATTGTTGA TTTACTTAAT TAAATTACAT 2160
CCTGAAAATA AAACAAAACA CAAATGCCTT CATAATATCT AA 2202