EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR006-00548 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_4hpf 
Coordinate
chr22:16251604-16253610 
TF binding sites/motifs
Number: 18             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
GSX1MA0892.1chr22:16252110-16252120TTTAATTAGG-6.02
HNF1AMA0046.2chr22:16253409-16253424AGTTAATTATTAGTT-6.36
NFYBMA0502.1chr22:16251744-16251759AAACCAGCCAATCAG+7.34
PHOX2AMA0713.1chr22:16253328-16253339TAATTAGATTA-6.32
POU4F2MA0683.1chr22:16252407-16252423CAAATTAAATATGTAT-6.02
PROP1MA0715.1chr22:16253328-16253339TAATTAGATTA-6.14
Phox2bMA0681.1chr22:16253328-16253339TAATTAGATTA-6.32
SP1MA0079.4chr22:16252982-16252997GAAGCCCCGCCCACA+6.6
SP2MA0516.2chr22:16252981-16252998AGAAGCCCCGCCCACAG+6.39
SP4MA0685.1chr22:16252982-16252999GAAGCCCCGCCCACAGC+6.28
ZNF24MA1124.1chr22:16252855-16252868AAATGAATGAATG-7.34
ZNF384MA1125.1chr22:16253565-16253577AAAAAAAAAAAA+6.22
ZNF384MA1125.1chr22:16253566-16253578AAAAAAAAAAAA+6.22
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ZNF384MA1125.1chr22:16253563-16253575ATAAAAAAAAAA+6.27
ZNF384MA1125.1chr22:16253564-16253576TAAAAAAAAAAA+6.37
Enhancer Sequence
CTACCAGCTT GGCTAGGCTG GTCAAGCTGG TTTTAGCTGG TCATCTCCCA GCCTGACCAG 60
CTAAGACCAG GCTGGAAATG GCTGGAAACC AGCCTGGAAG TGGCCAAAAC CCCTCTAAAA 120
CCAGGCTGGT CGACCAGCTA AAACCAGCCA ATCAGCCTGG GCTGGTTTAA GCTGGATTTT 180
TCAGCAGGGT GGTAAATACA GTGAGGTGCT GCTGTCAGCA CATCCATCCA ATCTACATCA 240
AGAGTGAAGT CCATACGGTT ATTAAAAACC AACACTGTTC GAGTTTAATA AAACAGAGTG 300
ACGTAACCGG TCGTGTCTAA ATTAGCCTTC ACCCGTGACG TTATCTGTTT GCACTAACCG 360
CAAACTCATA AAACACAGTA GTTTATGTTC ACTCCGACCA CAGCGTTATC ATAATTGCAT 420
GATTGTACTG TAGGCTATAT ATGTGGAGAG GACATAAGAC AGGGCTGTAT TATTTGCAAA 480
GATTTATGTC AGGATACCTT CTCATATTTA ATTAGGTCTA CATTCTTTTA AAAGAATGAA 540
TCAATTATAA AATCGATTAA AGGCAATAAA TAGTCTATAA AAATCATAAA CTTAACTAAT 600
TTACTTTTTT TAAGTCTCAG TATTTTATTT TATATGTTTT GCTTTATTTG TGATTTTGAA 660
CAATTAAGTT AAATTCAATA TAAATATGAA TGAACACTTA TTTCACACAA GTTTACGCAC 720
ACAACTTTTA TAAAATTTGA TGTAATTATG GATTTTATAT TTTTAGTGCT AAAATAATTC 780
TAACTGAAAA TTAACAATTA CATCAAATTA AATATGTATA AACATTCTGA AACGTAAATT 840
TTAAATATTA ATAATTGTGT TGTATAATAA ATTATGAAAT ATTTTGTCAA TATAATATAA 900
TTTTATATCT ATTTATTTAT TTATTATACA ATTGTTACAC TTTAAAAAGC CTGATTTGTC 960
TCACAGCATG AAAGTCGCTG GTTCGAGCCT CAGCTGGGTC AGTTGGCATT TCTGTGTGGA 1020
GTTTGCATGT TCTCCCCGTG TTGACGTTGG TTTCCCCTAC AAGTCCAAAA ACATGCGGTG 1080
TAGGTGAATT GGGTGTGCTA AAAAATGACC ATAGTGTATG TGTGTGAATG AGTGTTTTCC 1140
AGGGATGGGT TGCAGCTAGA CAGACAGCCG CTGTGTAAAA CGTGCTGGAT AAGTTGGCGG 1200
TTCATTCCGC TGTGGCGACC TCTGATTAAT ATAGGGACTA AGCGGAAAAG AAAATGAATG 1260
AATGATTTGT CTGAGTGATC TCCCATACCA AATGTTGTTT TCATCTCCTC CAGTATTTAA 1320
TTACTCTTGG CCGCAACAGA TGCGTCAAGG AGCCAATGAT CATGCAGAAT GCGCTCAAGA 1380
AGCCCCGCCC ACAGCCCGGC CCCCACCGGG TGCCGGTCGC TTTAACAATG TCGAAATGGC 1440
CTTTCCAGAC CCGCGGTTCA ATGAATATTC AAGGCTCCTC ACAAGGCTTT TCTATTCTCT 1500
TCTGCTCCTG CTATTGTTCT GGCATCTGCC GGCTGTAATT GTGCCGGTCT AGGGCACAAA 1560
AGAGCCGACG AAAAACTCTC CTGTCCGGCT GACACTTGTA GACCGTCTCT GGGGTGAGCT 1620
CGATGTGGAG ATTTTAACAC AAACAAGTCG TTTAGTTGCT TCTTGTTTGA GACGCATAAG 1680
TGCTTTATAA GTGCTCTTAA AGCCACAAAC ATACAAAATA AAAATAATTA GATTATTAAT 1740
TGACAAATTT AACCATTAAT AAAACTTATT TATATTAATG ATAACATATG ATATAAATAA 1800
AAATTAGTTA ATTATTAGTT TTTAATAACT CCACTTATGT TTTTCATGTA GTGAATTTTC 1860
CAGTCACTAG CTTCTAAAGT TTGTAAGTTA AAATAATTCC TTATTTTACA TTGTTTGACA 1920
AATAAAATAA ACTATTAAAA CACATAAATT CAATGAACCA TAAAAAAAAA AAAAAAACAT 1980
TTCCATTAAT CATAATTTTA AGATAA 2006