EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR006-00520 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_4hpf 
Coordinate
chr21:13874942-13877170 
TF binding sites/motifs
Number: 10             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Alx1MA0854.1chr21:13875973-13875990GGGATTAATTAATTATT+6.14
Lhx3MA0135.1chr21:13875978-13875991TAATTAATTATTC+7.12
Lhx3MA0135.1chr21:13875975-13875988GATTAATTAATTA-7.34
POU4F1MA0790.1chr21:13875979-13875993AATTAATTATTCAC-6.98
POU4F2MA0683.1chr21:13875977-13875993TTAATTAATTATTCAC-7.59
POU4F3MA0791.1chr21:13875977-13875993TTAATTAATTATTCAC-7.42
POU6F1MA0628.1chr21:13875976-13875986ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr21:13875976-13875986ATTAATTAAT-6.02
PROX1MA0794.1chr21:13875535-13875547TAAGACGTCTTA+6.62
PROX1MA0794.1chr21:13875535-13875547TAAGACGTCTTA-6.62
Enhancer Sequence
TACAACCCTA GACAACTACC CTCTGTCTGT TACAACTTGC ACCACTGGTG GGGTAAATAA 60
ACATTTTTTC TCCTGGCACC TTTGCCAATA CTGCACAGAA ACCATAGGTC TGGCGATAAT 120
CATTTCGGTG CTCATTTGCA GGAGAGGCTT GTGTGTCGTT GGTACAAAAA TAAGGTTTGT 180
CTAACCTCAT TACTTTGTTC ATTATTTGGC CGAAACCAAA AGGAGTTAAC TTATTTTGTG 240
CCCCGCTCTC CCCTACATTT CATGGGTGTC TTCTGTAACG TTAAATCAGG TTTAAAAATG 300
TGAAAGCTAT TACTTTATGT TTATTAAATT ATTTAATAGG ACACATTCTG AAAAATTGGG 360
AAACATAAAT CTGTAGTAAA ATTTTGTTTT GACATTGATA TACGAAGCTC TTGTTTATGT 420
GTAGTTCTTT AACACTTGTT TAACTTGTCT AACGAGCAGA GGGAAGTTCA ACCTGTTGAT 480
CAAGAGGAAA AGTCCTCTGT ATATGCACGT CTTTCAGCAA AAGCATTTAT TTGAAAAATG 540
CAATATGTTA TGAGATACTT TAACAAGCAA ACGTCCCAAC GTCTGAGGTA TTTTAAGACG 600
TCTTACCTCT TAGCATCTAT AAACTGCCTT CCGGTGCAAC ACAAGCGCCC TTCATGTGAA 660
CATATGAACT TCAGACGGTT GCCTTGAGAA CAGGACACAA ACTAACACCA CCATAGTCTC 720
TCAGTCACCA AGCGACGAGG CAAACACCAA TTTCCATCAT CTGCTTTTTG ACAAAATGCA 780
TGAAACTCAA TGTTCCAGGT CGCTTTTACC TTTGTTATTG TCCGGGTGTT CAGCTCGAGT 840
GCGTTGTGTT GCTCTCGAGC GAGCCAAAAT CTGTGTTATT CACTTCACGC GAAGAGTTTT 900
ATATCACTTC AAAGCAAAAT GTTGAATACA AAAGCAAGTA CAAGCAGGTT TTATATCCTG 960
GGGTGAAAAA CGTGAACTCT TTCAGCAGAA AAAATGTTCC TAATAAAGCT AGAACAAAGA 1020
TTTGGAGTAT TGGGATTAAT TAATTATTCA CAAGAGAAGA GTGAACGACG TCGGTTTGAG 1080
GGCGGGGCTT CGCTGTCAAA TTCAACAAAA TGCTGAACTG GGCGCTTTGG TTGGCTCAGC 1140
AGGGAAAGGG GAAGGGCTAA ACTTTCAGAT AATTTATAAA GCTCATACAA CAGCATTTTT 1200
TTCTTTAACT TTAATTTACA AAGAATAACA TGCTTTGTCA TGCTCAGTAT TCAAATGTAG 1260
CTCTATTTTG GGCATCATTC TTTTATTATA GTCTTAAATG AACGTGATAT CACTATCAGC 1320
CACACGATGG AGCCATATGT CGTCTTTTTA ATATCTGTAC AGATCAGTAA TCCACACATT 1380
TTAACAGTAT AGTGTTCTTA TTCATCAACT TATACTTACA ATCTCATCCA GTTATTGTAC 1440
ATTCGATGCT TTTGAACACA ATTACAATAA TTAAGCCTGC AATTAATTAT TTTTTCATAT 1500
GTGTTATTCA TCCAGCCAGG GTGTGAATTA CAGGGGGGTT TGACCCCCTA CTTAACGCTT 1560
GATCCCCCTG AAGGACTTCA TAACAACATG TTGGCTATAG TCAGCTTTTC AAAACTGAGA 1620
ATTAATTTGC TCTGCTTTTT ATTTTAAATA ATGTTAATAA TTACAATATA AAAAATCTTA 1680
TTGTAAATTT GACCACCCCT ATAATGCAAA CAAACTCTTT CAACAGTCTG GAACCAGCAG 1740
ATCTAGAGCA CCGATAGACA ACGTAACTGT TCACACGACT GTTTTTCTCA TAAATAGCTG 1800
TTTGTTTTAT ATATGGCCTT AAAGTAAAGT GAAATTAGAT GCACCTCAGA ATTAGCTAAT 1860
TGGATACTGT AGGCCAGAAT GCACAAAACA ACCCACAAAA CACTTAAAAC TTAAATATAT 1920
TTTATTAATA AATTGGATGT AAATTAAATA AATACATACA TTTGATTCAC TGAAGGATGT 1980
TTTACACCGA CAGAGGCAGA TTTTGTGATT TTGGGACCCT AAGCAATTCA AACCATAGGG 2040
CCCAAGTCCT GAAATGCACC CTTTCTACTT TTATTTAATT GTTATTTATA TTGCTATTTT 2100
ATTTATGTCT TCTTTTTGAC ATTTTAAATG ATTAGTTTTC TTAAAATAAA TGTACAAATA 2160
TATATATATA TATATATATA TATATATATA TGTGTGTGTG TGTGTGTGTG TGTGTATATA 2220
TGTATATA 2228