EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species
EnhancerAtlas 2.0
TagContent
EnhancerAtlas ID
DR006-00515 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_4hpf 
Coordinate
chr21:3287578-3289948 
TF binding sites/motifs
Number: 15             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Alx1MA0854.1chr21:3288822-3288839ACTAGTTAATTAGTTCA-6.03
LHX2MA0700.1chr21:3288826-3288836GTTAATTAGT-6.02
SOX21MA0866.1chr21:3289569-3289584AACAATTATATTGTT+7.52
Sox11MA0869.1chr21:3289569-3289584AACAATTATATTGTT+6.5
Sox1MA0870.1chr21:3289569-3289584AACAATTATATTGTT-6.22
Sox1MA0870.1chr21:3289569-3289584AACAATTATATTGTT+6.43
ZNF384MA1125.1chr21:3288340-3288352TTTTTTTTTTTT-6.22
ZNF384MA1125.1chr21:3288341-3288353TTTTTTTTTTTT-6.22
ZNF384MA1125.1chr21:3288342-3288354TTTTTTTTTTTT-6.22
ZNF384MA1125.1chr21:3288343-3288355TTTTTTTTTTTT-6.22
ZNF384MA1125.1chr21:3288344-3288356TTTTTTTTTTTT-6.22
ZNF384MA1125.1chr21:3288345-3288357TTTTTTTTTTTT-6.22
ZNF384MA1125.1chr21:3288346-3288358TTTTTTTTTTTT-6.22
ZNF384MA1125.1chr21:3288347-3288359TTTTTTTTTTTT-6.22
mix-aMA0621.1chr21:3288825-3288836AGTTAATTAGT+6.14
Enhancer Sequence
AATGAACAGA TCACGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGC AATGAAAAAA CCTCCCGTTC 60
CTCTGTGTGT TTAGTCAAGA CATTAGATGC TGCTTTATCA AGTGTGTGTG TGAAGTGTCT 120
GGCTCCTCAG GGCATTTGTC TGTCTTCCAG ATTTCAAGCG ACAATGTGGC CTCACAGCAA 180
GAAGGTTGCT GGTTCGAGTC CCGGCTGGAT CAGTAGGCAT TTCTGAATGG AGTTTGCATG 240
TTCTCTCCGT GTTGGCGTGG GTTTCCTCTG GGTGCTTCGG TTTCCCCCAC AGTCCAAACA 300
CATGCGCTGT AGTTGATTTG GGTATGCTAA ATTGGCTGTA GTGTATGTGT GTGAATAAAC 360
GTGTATTGAT GTTTCCCAGT ACTGGGTTGC AGCTTCAAGG GCATCCGCTG TGTAAAACAC 420
ATGCTGGAAT AGTTGGTAGT TCATTCCGCT GTGGCGACCA GTGATGAAAA AAGGGACTAA 480
CCCGAAGGAA AAAGAATGAA TATGTTTACA GACTGACATT TTTTCTGACC CCATAACTCT 540
TTGGTTAGCT GTTTTGGAAA ATATAAACAG ATGTTTTAAT ATATCGTGAA CATATATGAA 600
TTTAAATTTA GCAAATGTCA CAGGAATTGC TCAATTATAA AGGAAACGTC CAGCTTTTTG 660
ACAGAGGAAG TGTTTGGTAT GGATCCTAAC AAGCTCAACA AAGCCTTCAC AGTTTAAAAA 720
CATGTCGTCA AAGCCGCTCG CTCTAGTAGC CGCTTTGTGT CGTTTTTTTT TTTTTTTTTT 780
TCTCCGAATG TTTTCTTTCC GTTTGGCGGA GGCGCCGCGA GGCCCGACCC AAGACTCAAG 840
GCTTTTTCCT CCGAGGCCTG ATGTCATTTC CTGTGCTGCC CTTTCCTCTT GGCTAACCCA 900
AACAAGCCCT GGAATGAGGC GGAGGTTTTC ATGCTAGCAG CGAGTCTTGA AGGGCCCCTG 960
AGGGGGATCT GAGTCTCCGG GGCCTCGGGG CCATAATAAA GGACTGATTG TGGATCAGCG 1020
GAAATGTTTG GGGGGGACAG CTTAACATAG ACGAGGGCGC CGAAATTAAG ATTTCTGGCC 1080
AAATGGAAAG CGAGGATTCA TAATATACAC CAGCGCATGA TGATTACACT CCTTCCTCTA 1140
TTGCAGCAGA CACTTTGTTA AACACTTGTG TGTTTTATGT TTGTACAGAT AGCTCTTTCA 1200
TATTTTTAAT GCGTTGTCTT TTTTTCTACA GCCACATACT AGTGACTAGT TAATTAGTTC 1260
AAGGTATTAG TAACTAATAA AGTTATAACC TCAAGTTTTT GATTGTAACG CAGTACTGTG 1320
CACTGTTTGT AAAGCCCCTT TGAAACAATA ACTATTGTGA AAGCGCTATA CAAATAAACC 1380
TGGATGGAAT ACTCTATATC AAAAGCCTTT AAATGGTTTT ATAGTTGCTT TAGACCAGAT 1440
TTTAGATTCT TATTGTAGGT ATTACTGTTA TTTTTGCTAT TGTTGTTAAT ATTTGAAGGT 1500
CACGAGTGGT TGTGTGAGCA TTTCATATCA TACTGTGTGT GACTGTATTT GAATTTGACT 1560
TTTGATTTAA ATTGAGTGAA TTTCACACTG ACTTTTATAG ATTTAAAAAA ACAACAAGCA 1620
AAAACAGCAA TTTTGCTCAT TTGAATATGC AAAGATAACA TTAGTTGAGT TAAAATGGCA 1680
GCATAATGCA AATATATGGA TATTTAAATC TTTATAATGG TTGTTTATGG TTAAAGTTAT 1740
TGCACAAATG TGTTTGTGCG CGAGATATTC CAGACAATTA TGTTGTTTTA TTAATAAACG 1800
TATTTAAATT ATAAAATATA ATAATAAATG ATTGAATAAA ATTCATTCAT AAAAGGTATT 1860
ACATACAGAT ATTTTTCAAT AAAGATATTC TTGGTTAATA TTTACAATAT GTTTTATATA 1920
ATATTAAATA TATAAATATA ATAAATATAG GTAATAATTT ATACATTCAT GTTTGTGTGT 1980
GAGAAAATCC AAACAATTAT ATTGTTTTAT CAATAAACAA ACTAATAAAT AAATATTTAA 2040
ATGATAAAAT GTAATAAAAA TTTATAAAAT ATTAATATAA AATATTAGGG AATTTAATAG 2100
TTTTTTTATA TATATATATA TATATATAAA AATATGCCAG GCTAATATTT TAATATTTAC 2160
AATACTTTTT TTTATAAAAT AATAAATATA TAATTTATAA TATAGGAAAT AATGTATGCG 2220
TTTATGTTTG TGTGTGAGAA AATCTAAACA ATTATATTTT TTTATCAATA AACAAACAAA 2280
TAAATATTTA AATAATAAAA TGTAATATTT AATGATAAAA TATCAATATA AATATAAAAT 2340
ATTAGGATAT TTAATACAGA TTTTTTTTTA 2370