EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR006-00507 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_4hpf 
Coordinate
chr20:52199455-52201633 
TF binding sites/motifs
Number: 11             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
DUX4MA0468.1chr20:52201077-52201088TGATTAAATTA-6.62
DUXAMA0884.1chr20:52201076-52201089TTGATTAAATTAA-7.34
FOXC2MA0846.1chr20:52199702-52199714TAAATAAACAAA+6.18
Foxd3MA0041.1chr20:52199990-52200002AATTGTTTGTTT+6.22
Foxd3MA0041.1chr20:52199550-52199562GTTTGTTTGTTT+6.32
Foxd3MA0041.1chr20:52199707-52199719AAACAAACAAAC-6.32
Foxj3MA0851.1chr20:52199700-52199717AATAAATAAACAAACAA+6.03
LMX1BMA0703.2chr20:52201508-52201519AATTTAATTAA+6.32
NFAT5MA0606.1chr20:52201216-52201226ATTTTCCATT+6.02
NFATC1MA0624.1chr20:52201216-52201226ATTTTCCATT+6.02
NFATC3MA0625.1chr20:52201216-52201226ATTTTCCATT+6.02
Enhancer Sequence
ATAAACAAAC AGACAAATAA ACAAATAAAT ATAATAAATA AAAATATAAT GATTTAAATT 60
ACAATTGCAA CTTAATAATA AAAGTATAAA TTATTGTTTG TTTGTTTGTA GACACATTAA 120
CTACTGAACC ATTATTTTAG TGTCATACAT TAACTGATTA GCAACAATAT TGTAGTGTTG 180
ACACCATAAA TAAATAAATA AATAAATAAA TAAATAAATA AATAAATAAA ATTAATAAAT 240
AAATAAATAA ATAAACAAAC AAACAAATAA ATAAAAATAA TTCAAATTAC AATTGCAACA 300
TAATAAAAAT GTATAAATAA TTGTTTGTTA GTTAATAAAC ACATTAACTA CTGGACCATT 360
ATTTTAGTGT TTTACATTAA CTGATAAGCA ACAATATAAT GGTGTTGCCA CCATAAATAA 420
ATAAATAAAT AAATAAATAA ATAAATAAAT AAATAAATAA ATAAAAAACA AATAAACAAA 480
TAAATAATAA TAATAATTCA AATTACAATT GCAACATAAT AATAAATGTA TAAATAATTG 540
TTTGTTTGTT AGTAAACACA ATAACTAATG GACCATTATT TTAGTGTTAT ACATTAACTG 600
ATAAACAACA ATATTGCAGT GTTGCCACCA TAAATAAATG AATAAATATA ATAAATATGA 660
TATAATAATA CAAATTACAA TTACAACAAA TAAAACAAGT CAGCATATAC ACTCAGAGCT 720
CACCCGCCGC TGATTTCATT TCAACCTGTT GACTCTGGAG CCGTAACTCT AATAGACTCT 780
TTCTCATTTC TTAAGGGAAT TAAAAAAAAG AAGAAAAAAA AAGAAAAAAG CAGTGCAAAT 840
AACTCTGCCG GATGGCTTTG GTAGGGCAAA CCTCCCCGTG GGACGACGCT GGGAGCTTAA 900
TCTGAATGTC AGGAGACGCT TTCAAAAGTA TCCTGAGTTT CTCCAATAGG AAACACGAGC 960
CGATCGTCTT TCCCAGTTCA AGGCGGATTG TTGAATGGAT GAAACTCCAG GAATCGGGAG 1020
ACCCATAAAG AGCGGCACAC GGGGGGTCCG GTTCACAGTT TGCATGCACT TAAAAGTGTA 1080
ACGATACAAG AACATGAGCT ATATTAATAC ACACTCTCAC AGTTTACTCC AAAGAAAATG 1140
TGGAGTTATT TTAATGACGT GTTATGATGA AGATTAAGAG CAGGCTGTGA TGGAGGAGAA 1200
ACACAATGAT TATTATTGCT GTGGAAAATA TTTGAGCAAT GATTTAAAGA ATTATACACC 1260
AATCTCTTCA TTAGTTTGAT CAAAAAATAA ATGTAAAAAT GGTAAATATT TGCATTTAAA 1320
TAGCTATTAA ATTTAACAAA AATTTGGATA AATTAAATGA TTGCTGTTGA AAATATTTGA 1380
TCAATAATTT TAAGAATTGT GCGAGAAAAA CTGCATTTAT TTGATTAAAA ATTCAGTGAA 1440
ATGGGAAATA TTTGCATTTA AATAACTATT AAACTAAATA CAATTTTAGA TTAAATTATT 1500
GTCGTGGAAA ATGTTTGATC AATAATTTAA GGAATTATTT ATTTAATTAT AAATACAGTA 1560
AAAATGTCAA AACTAGGAAG TATTTGCATT TAAAGAACTT AACTAAATAA AATAATTTTT 1620
TTTGATTAAA TTAAATAAAT GCAGAGTTTC GGCATAATCC CTTCGAATTA TTGATCAAGT 1680
ATTTTCCACA GCAATAATTT TATCACAAAT ACAGTAAAAA TTGGAAATAT TTGTGTTTAA 1740
ATAACTATTA CATTAAATAA AATTTTCCAT TAAATTAAAT TATTGCTTTG GAAAATACTG 1800
GATCAATAAT TCAGAGAGTT ATGCAAGAAA CTCTGCATTT ATTTGATCAA ACACACAGTA 1860
AAACTGGTAA AACGGGGAAA TATTTGCATT TAAATAACTA ATAAATTAAG TTAAATTTTA 1920
AGTTAAGTTA TTGCTTTGGA AAATATTTGA TCAATAATTT AACGAATTAC GCACAAAACT 1980
GGTAATTTAT TTGATCAAAA ATACAGTAAA ATAAATATAA AAATGTTAAA TATTTGCATT 2040
TAAATTGCTA CAAAATTTAA TTAAGATTTA GATTAAATTA AATGTTTGCT GTTGAAAATA 2100
TTGGATCGAT AATTCAAAGA ATTATACAAG GAAATTGCAT TTATTTGATT ATAAATACAG 2160
TAAAAATGTC AAAACTAG 2178