EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR006-00477 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_4hpf 
Coordinate
chr2:52980166-52982232 
TF binding sites/motifs
Number: 16             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Hmx1MA0896.1chr2:52981931-52981948AGTGATTAATTGCTGGG-6.83
Hmx2MA0897.1chr2:52981931-52981948AGTGATTAATTGCTGGG-6.14
Hmx3MA0898.1chr2:52981931-52981948AGTGATTAATTGCTGGG-6.38
Lhx3MA0135.1chr2:52982193-52982206GAATAATTAATTT-7.34
NRF1MA0506.1chr2:52981330-52981341GCGCATGCGCA+6.32
POU1F1MA0784.1chr2:52980648-52980662GTTATTTGCATATT-6.07
POU2F1MA0785.1chr2:52980650-52980662TATTTGCATATT-6.37
POU2F2MA0507.1chr2:52980648-52980661GTTATTTGCATAT+6.1
POU3F3MA0788.1chr2:52980649-52980662TTATTTGCATATT-6.04
POU5F1MA1115.1chr2:52980650-52980661TATTTGCATAT-6.02
POU6F1MA0628.1chr2:52981840-52981850ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr2:52981840-52981850ATTAATTAAT-6.02
SOX10MA0442.2chr2:52981502-52981513AAAACAAAGAC+6.14
TP63MA0525.2chr2:52980319-52980337AACGTGTCAAAACATGTT+6.17
TP63MA0525.2chr2:52980319-52980337AACGTGTCAAAACATGTT-6.74
TP73MA0861.1chr2:52980319-52980337AACGTGTCAAAACATGTT-7.11
Enhancer Sequence
TCAATAAATG TGCAAATAAA ATATGATGCA CAAACTTATT AATGATTCCT ACTTGTCTTC 60
TCGGGATAAA TAGTGGGCAA AATCTGATAT GTAGCGTGGA AAAAAAGAAG AAAGAGTTCA 120
TCAGACGCTG AATTCGAACC GAGTTCATGC TCGAACGTGT CAAAACATGT TGATGTGCGT 180
CTTACGAGCT GCGCCACTGA GACTGTTAGG GGAACTGCAA TATTTTACAC ATATAAACTT 240
CACTGTTTCT TTTTTAATTT ACTCAGTGCG ATGTTCAGAC CCAACTGTGT TAACCGCATC 300
AGCTAAACTC TCCCCACTCA ATTTTTTTCT TTTGTTGTTA ATTCCGGAGA AAAATCTTGC 360
AAATAACACC GCTTTTCTCC AGTCTACCTC TGAAAGGAGC ACCTCCAATT CACATTCTGT 420
TCAAAGTTTC TCTTCTTGCT TGCTTTTGCC ATTGCTTTTT CGTTGGGTTT TGCCAAAGTA 480
GAGTTATTTG CATATTCATA AGGGGGAGCA GGCAGGGAGG GGTTTTGTGC TTGTGCATGT 540
TGCGCTCAGT TTTACGTTCA TTCAGATGTA CAAAACAATA TGCGTGAGAT TCGGCGTACG 600
CAGTGTTTCA TACATCTGCA TTTTTTTCTG CATACGCACA TTTACAGCTT TGTCGTACAC 660
AATGTTTTAG TAAGATTTCC ACGCAAGTCT TCGTACATGA GGCCCCAGGC CACATAAGAA 720
ATCATAAATT ATTTCTGTAG AAAATATTCC CCCGCGACTT GGTTTCTTCC ACTCACCCCC 780
CGCCATCTCA CGTGAAATGG ACTATGCCAA AATCCACCAC GGAACGGTAA GAACGATAGA 840
ATATAGCGCA GTGGTGGTTG TTGATAGTTT AAAGTTATAA AAAAGGTATT ATAGAGTCCA 900
AATCAGCAGA GCATTTAAGG ACTGTGCATA TATGTGTGCG TGTATCGCTA AATAAGTACC 960
CAAAATCATT GCAATATGTA TCTATATGGA GTTTCACATA ATCATACTCA TTAGGGCTGT 1020
AACATGCCAA TGCATACATT TAATTCGGCT ATACGGTTGT ATTATTGTTA ATATGTTCGT 1080
CAGTTGAAAT GTTTGGCACA GATGTTATGC ATTTGATGCA TAAAACCTTG ATTGAAACAT 1140
AATCAGACCG CGATAGTGCA ACTAGCGCAT GCGCACTGAG TTGTTCATGA TTAACCTGGA 1200
TGCACGAGCG CAGTAGCTGT GTTCACGTGA AGACCCCATC CCAGCCTTCA TGACTGAAAT 1260
ACTTGGTTTT CCACCAAGGC AACCCGGAGT GCTGAAATAT AATTGGCTAC ACTGGCAGTG 1320
GGTGGGTTAA ATGACCAAAA CAAAGACAGA CGTGTCGGCA CACATTCAAA GCAGAATATC 1380
TTACTTCATA GTTCTCAAAG TCTTGTGTAT TTTTCATTAC AAAATGGTTT CCACATCAGG 1440
GGCAGTCGCC GCCACCAAAA CTGCTCTACT TTCATAGCAT AAATCACTCG CCTCATAACT 1500
TATGATCTCT GTAGTTCCAA AGGAAAATGC TTATGAAACA CTGTGAAAAA CTGACTGCAT 1560
GTTTCTGACA AGTTCTCAGT TGTCTATCAC AGAGAGCGCG GGGTACACAG GATCCTGTGG 1620
TGAAGCAAAA CAGTGGGATA TCAACGGTAT CTTGCCTTTT GCAAAAACCA AGCCATTAAT 1680
TAATTCCTTC CTTCTACAAC AGAGTCACAG ATTGAAACTA ACCAAGAGGC TCTTTGCAAT 1740
TAAGATGCAC AGATCCAATT AAGAGAGTGA TTAATTGCTG GGGAGGGAAG TTAAATAGGA 1800
ACGGCTGCAA AATAAGACCC AGCGGTCGGT CCTGAAACTG GTCCACCATC AGCGAGGACG 1860
AGGAATCAAG GAAGTAATTG AACGGCAACG TGAGGCTAAA AAGTTTCAGT CTGAATCAGA 1920
GCTATGAATG ATGACTGTAT AAAACAATAC TGTTCACTAA CATGTTTTAA TCTTCCTTGC 1980
TTCTGTCAGG AAAAAAATAT ATCGTGTTTC TCATCATATT ATTCCAGGAA TAATTAATTT 2040
GCAGGATGCC ACATTAACTT TATAGC 2066