EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR006-00470 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_4hpf 
Coordinate
chr2:46216371-46218349 
TF binding sites/motifs
Number: 22             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
ATF2MA1465.1chr2:46217569-46217583TAATGACATCATGT+6.47
Arid3bMA0601.1chr2:46218059-46218070TTAATTAATAT-6.62
FOXB1MA0845.1chr2:46216442-46216453AATGTAAATAT+6.32
FOXP1MA0481.2chr2:46218006-46218018AAGTAAACAGAT+6.74
FOXP2MA0593.1chr2:46218006-46218017AAGTAAACAGA+6.32
Foxq1MA0040.1chr2:46218105-46218116AATTGTTTATT+6.02
JUNMA0488.1chr2:46217571-46217584ATGACATCATGTT-6.07
Lhx3MA0135.1chr2:46218056-46218069TAATTAATTAATA+6.25
Lhx3MA0135.1chr2:46218049-46218062TATTAATTAATTA-6.25
Lhx3MA0135.1chr2:46218052-46218065TAATTAATTAATT+6.78
Lhx3MA0135.1chr2:46218053-46218066AATTAATTAATTA-6.78
POU6F1MA0628.1chr2:46218050-46218060ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr2:46218054-46218064ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr2:46218058-46218068ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr2:46218050-46218060ATTAATTAAT-6.02
POU6F1MA0628.1chr2:46218054-46218064ATTAATTAAT-6.02
POU6F1MA0628.1chr2:46218058-46218068ATTAATTAAT-6.02
ZNF143MA0088.2chr2:46217525-46217541CAGGGCATCGTGGGTG-6.75
ZNF24MA1124.1chr2:46217235-46217248GAATGAATGAATA-7.52
ZNF24MA1124.1chr2:46217223-46217236GAATGAATGAATG-7.82
ZNF24MA1124.1chr2:46217227-46217240GAATGAATGAATG-7.82
ZNF24MA1124.1chr2:46217231-46217244GAATGAATGAATG-7.82
Enhancer Sequence
CTCCTACAGT TGTGTACATT TTGTTTGTTT TTTAAGTTGA TTAACAAAGG GTAAAATACT 60
TTGATTGGCC TAATGTAAAT ATTTGAGATT GGCTTTGGAC ATTCCTAATT TCTACTAATG 120
CATACCTTTT AAAGTCCTGT TAACGGTCTA CATGTATGCT TCATGATCTG GGCTCTCTTT 180
TATTAGTGAC AAAAACATTC AAAAACTTCT CAAATGCTTT AAAGTAAGTA CATTTGATTT 240
ATAGAGAGCA TTTATCACAG CAAGCTGGCC AAAATGCTGA ATGTATACAA GTTTGGAGCA 300
AAAGTAAGAG GAATAAAACA AACTAATGCA AATACACACA GCAATTAAAA ACCTTGGGAG 360
TAAAAATATA TCTTCAACTT TTGTTTTTTA AAAGATGAAG TTGAAGTTGC AAGGCAAATG 420
TCCATAAATA TATGAATAAT TATGAATAAT AAACTATCTG AATAATTTTG GCTTCACTGT 480
GAAATATAAT TTAAATATAA ATAAAAGGTA TAATTAGCAC TGTTGTGTCA CAGCAAAAAG 540
GTTGCTAGTT AGAATCCTGG TTGGGCCAGT TGTCATTTTC TGTGTGGAGT TTGCATGTTC 600
TCCCTGTGTT TGCATGGGTT TCCTCTGGGT GCTCCGGTTT CCCCCACAGT CCAAAGACAT 660
GTGGAATACT TTAAGTGAAT TAGGTAAAAC AAAATTGGCC ATAGTGTATG AGTGTGTGAA 720
TGAGTGTGTA TGGTGTTTCA CAGTACTGGG TTGCAGCTAG AAGGGCATTC ACTGCGTGAA 780
AAATCTGCCG GAATAATTAG TGGTTCATTC CACTGTGGTG ACCCTAGCTA AATAAGGGAC 840
TAAAGTGAAG GAGAATGAAT GAATGAATGA ATGAATAAGC AGTGTGAATA GTTTCAGGCT 900
TGACTGTACA GTATGTGCTT TACTCAGATT TGATTGCTCC AGTTTGATTT TGTGATCTCA 960
AACCCAGAAC AAAACGTACT CCAGAGCAGG TTTGCCATGT GGAGCAAGTT AACCCACCAT 1020
CCTAAACCTG GGTAAAAACC CAAGCAGGCT TAATGCAACA GGCCTCTGAA CTGTGGATCA 1080
TCCCGGATAT TTCAGGTTGT TGTTTCTGGT GTTGAGAGCA GCCGCTGTGC TGTAGAGAGT 1140
GTAATCTTTC CCCGCAGGGC ATCGTGGGTG AGATTAGCAC AGCTGGATGC TGGGAGTCTA 1200
ATGACATCAT GTTGAGATTT GGCCAGAGCT GGGTCATGAT GATACGGTGT GTTACAGCTA 1260
GATTAAAGCC TCTCAGCAGT CAGAGATGAT GAGATGACAA TGAGTGTGAA GACAGAGACG 1320
CAAGCACACA ACTCTGACTT CACAGTCAGG CCTCGAAGAA AACAGCTGAG CTCTGTTTAA 1380
CCAGCTTCGA CTTGGTTTCT TTAGTCTGGA TGACAGTTCA GTGAGGCTCT TTTAAAGTTC 1440
TGGCTAATAT TAAGACTAAA GACTTCTTTT GTCAAATTTA GCTATTAAAC TAACATTTTT 1500
AAAGCCTGCT GTTTGTTTTT TGTTCATATT TACTCAATAG TTTAGTGTCG CAGTGTAGTT 1560
GATTTATTTA TTTATTTATT TTTTATTTAT TGCACTAATA ATAAACTTTA TTACACTGAA 1620
ATAACAACAA CATTTAAGTA AACAGATAGA CAATTATTAT TATTATTATT ATTATTATTA 1680
TTAATTAATT AATTAATATT AGCAACATAT ATTATACATA TTAAAAAATA TTTAAATTGT 1740
TTATTATTGT TATTGCTGTT AATATACATG TTCATGTTAA TATGCCATGT AGTAGTACTG 1800
GTAATAATAA TAATAATAAT AATAATAATA ATAAAAATAA TAATATTTAT TATTATTATT 1860
ATTATTATTA TTATTATTAT TATAAATATA AAATATTTAA ATAATATTTA TTATATTTAT 1920
TGCTGTTATT ATATTTTCAT GTTAATATGG CTAATAATAA TATTTATTTA TTATTATT 1978