EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR006-00435 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_4hpf 
Coordinate
chr19:40339016-40340426 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
TFAP2B(var.2)MA0812.1chr19:40339285-40339296TGCCTCAGGCT-6.14
TFAP2C(var.2)MA0814.1chr19:40339285-40339296TGCCTCAGGCT-6.32
ZNF143MA0088.2chr19:40339677-40339693CTATGCATTATGGGAG-6.95
Enhancer Sequence
AAGTTTTAAT ATTACTGGAC TCAAACTTTT GATAAATGCA GTATTGTGCA TTGCCGTATA 60
TCCAGAAATA TAGACATGCA TATAAACATA AATACCTACG AATACAAATG AGATGATTGT 120
GGGTGAGCAC GGAATCAAAG TACAAAATAA TAGGGCCCAG AATCTGCTTT TTCTCCTTTG 180
ACCCTGCTCT CTGTATATCT CCTTTCTAAA GTCTCCTCTG AGTCCTTGTC TTTGCGCTGT 240
GGGTTGCGCT GGGAATCTGT GCATCCCTGT GCCTCAGGCT GCCAGCGAGG AGGCCCGGTT 300
CAGCCCTGCT CTGTGGGCAA CAACACTGAC AAACAGCAGG TTTCAGGCTT GATATGTGGC 360
TGCTTGTGTA ATCAAACTGT CCCTGGCCAA TACGACAGCG CTGGAGGTTT TTTTTTCATG 420
ACCTCTCTTT CATATATGCT TTCATAAAAA GCGCATGACT GCAGGCAGAA TGTGCATTTT 480
TGACAGATGA CATTGTGCCT TTTACAATAT AGTTTGATTT ACTGCGCAAT TTTGCAACTG 540
TTCAAATATG CAAGTGGGTC AGGCTTGAAA GTCAAAGACA GAAACTTGAA GATACAGTAA 600
ACTGTAAACC GAATGAATTA TTACATAGCA CCAACTATAA CCGCTCAACT TGAATGCCCT 660
GCTATGCATT ATGGGAGATA GCACAAACAC AATATCTTTG AGCCGCTGGT ATTTATGAAA 720
TATTTATGTG TAAATCGGGC AGTGTAAGTG TGTACGGTTG AGTTAAGAAG AACTAAAAGC 780
ACTGAGGCTG TTAAGTGACT GACATTTTAA TCAGAAAAGC CTTTTTCATG AACAGACCCA 840
CATATCACCT TTGTGTCCAG GGTATCAGTG ACATTTTATT CTTAATTCTG TTGTTTCTTT 900
GCTTTTAAAG TGTTATGAAA CTTTCTCTTG CAGTGTTGTG TGCCCTTTCT AAAATTATCA 960
CCACCAAAAT GTCACCAAAA TTAACCAAAA CTGACCCACA AATTCAAGAA AAAAAACGCT 1020
AAAATGTACC TGTACAATTT AAATAAACTA TTAGACTCGG TTGTCTCGAT AAAGTTAATT 1080
GTGAAAATTA ATAAAGATTT AGTGAAACTG CATTGCTGCA ACGATTTACC TGATATGCCA 1140
ATCAGGCACA TTTCTGTTGA GTTTAGAAAC GCGGTAGCCA ATCAAATGCG TTTAAATTAG 1200
TCACCGCTGA TGATCGTCAT GGTTTGTTTA ATGGCGCGAG TCCTGTGAGA GGTTTGTCTG 1260
ACTAGACTTC GCGCGCTCAA GTTTTCACCG GATTTCACCT CCTTATAAAC AGCAAATTAG 1320
TGAAACAAAG TAAGTGAGAG ATTAATTTGC CTTCACTGAT TATGAAAGTA ATGTGGGTTT 1380
GGAATAACTT GCTAATAACT TGCCTTGGAC 1410