EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species
EnhancerAtlas 2.0
TagContent
EnhancerAtlas ID
DR006-00410 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_4hpf 
Coordinate
chr18:49340683-49342475 
TF binding sites/motifs
Number: 28             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Alx4MA0853.1chr18:49342419-49342436GTTTATTAATTAATTTG-6.07
BHLHE23MA0817.1chr18:49341171-49341183AAACATATGCTG+6.04
FOXC2MA0846.1chr18:49341951-49341963TTTGTTTATTTA-6.18
FOXC2MA0846.1chr18:49342147-49342159TTTGTTTATTTA-6.18
FOXC2MA0846.1chr18:49342380-49342392TTTGTTTATTTA-6.18
FOXD2MA0847.2chr18:49341952-49341965TTGTTTATTTAAT-6.06
FOXE1MA1487.1chr18:49341951-49341966TTTGTTTATTTAATT-6.29
Foxd3MA0041.1chr18:49342142-49342154GTTTGTTTGTTT+6.32
Foxd3MA0041.1chr18:49342198-49342210GTTTGTTTGTTT+6.32
Foxd3MA0041.1chr18:49342300-49342312GTTTGTTTGTTT+6.32
Foxd3MA0041.1chr18:49342459-49342471GTATGTTTGTTT+6.37
Foxd3MA0041.1chr18:49341983-49341995GATTGTTTATTT+6.62
Foxd3MA0041.1chr18:49342367-49342379GATTGTTTATTT+6.62
Foxj3MA0851.1chr18:49342144-49342161TTGTTTGTTTATTTATT-6.03
Foxj3MA0851.1chr18:49342377-49342394TTGTTTGTTTATTTATT-6.03
HOXD9MA0913.2chr18:49341373-49341383GTTTTATTGC-6.02
Lhx3MA0135.1chr18:49342209-49342222TGTTAATTAATTA-6.12
Lhx3MA0135.1chr18:49342422-49342435TATTAATTAATTT-6.37
PBX1MA0070.1chr18:49341872-49341884TTTGATTGATAG-6.18
PHOX2AMA0713.1chr18:49342216-49342227TAATTAGATTA-6.32
POU6F1MA0628.1chr18:49342423-49342433ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr18:49342423-49342433ATTAATTAAT-6.02
PROP1MA0715.1chr18:49341931-49341942TAATTTGATTA-6.02
PROP1MA0715.1chr18:49342429-49342440TAATTTGATTA-6.02
PROP1MA0715.1chr18:49342216-49342227TAATTAGATTA-6.14
Phox2bMA0681.1chr18:49342216-49342227TAATTAGATTA-6.32
RELMA0101.1chr18:49341667-49341677GGGGATTTCC+6.02
SOX10MA0442.2chr18:49341575-49341586TGCTTTGTTTT-6.02
Enhancer Sequence
TTATGTATTG TAAATTTAAT ATAACTTTCT CCTTTTTAAA AAAACGTTAT TTATTTTATT 60
CTGTAAAGCT ATGCGAACTA TGCAAAGTCT CATGCATACA CAGCAATATT TTCAACATCA 120
GTTGTTTATA CACTTGACTC ATTACGAAAT TGTGGGTAAA TATTCAAGCA TTTCCCATTG 180
CTTTTACTAA AACTAAAATG ATATACAACA AATAAGTCAT TTACAGTAAA CTGACTCCAA 240
TATTAATGTG AAACAATCAC AACACGGTGG TTATATTACA GCAAGAAGGT GGCTGGCTTG 300
AGTCCTGTCT GAGTCGGTTG TTGAGTTTGC AGGTTCTCCC CGTGTTGGCG TGGGTTTCCC 360
TTGGGTGCTA TGGTTTCAAA CACGTGCTAT AGGGGAATTG ATGAACTAAA CTGGCCGTAG 420
TGTATGAGTG TGTGCGTGAG AATGAGTGTG TATGGATGAG TTGTGGCTGC AAAGGCATCT 480
GCTTTGTTAA ACATATGCTG GAATAGTTGC TGGTTCATTC CTCTACGGCG ACCCCTGAAA 540
ATAAGAGACT AAGCTGAACC AAGAGAGTAT AATTATTCAT GATTAATAGT GACTAATGGC 600
TTCATATGAT GGCTGTTGTG CTGGAACCAA ACATGTTATA TTGATATATA CTTTAGTCTG 660
GGTAAGTGTA GGTCAGATGT GCAGCACACG GTTTTATTGC TGGCCAATGA GGTCTGGATG 720
CAGTGGTTGT GATGGGTAAT TCTGTGGTTG CTATGGGGAA GAACTGCAGC TGGTCGGGAT 780
GGTGTTGTTG ACCAGTGAAA AGATGGACTT TTACGCTGGA CAGAGTTCAG ACAAAAGACT 840
CCAGCAAACC CCCATTGGCC TCCGCTTCTC TCTGCACATT ATCCTTTTCT TCTGCTTTGT 900
TTTTCCCACT GGCTGTAACC CACTGATGCC CACAATCCTT GCATGGATGT TGAGCGAGGT 960
GCTGGGAAGT GTCCTGGAGT CTCTGGGGAT TTCCTGCATG CTTTCACACT GATGTGCACT 1020
AACAGACTTT ATTGGGCTAC AAATGAAAGG AGGAACGGCT GTGCAATGGT ATTTCACAGC 1080
AAATGCTAAC AGCAGGCTTC AGCGAATCAG CTAAATACAG CAAGCTTTAC TTATTTGTTT 1140
GTTTGATTAT TTTTGTTGTT TGTTAGTTTA TTTATTGGAT TTTTATTTAT TTGATTGATA 1200
GTTAGTTTAC TTATTTGATT AAAAATGTTT TATTATTTGA TAATTTTTTA ATTTGATTAT 1260
TATATGTTTT TGTTTATTTA ATTTAACTAT TTATTTATTT GATTGTTTAT TTGATTAAAT 1320
ATTTATATAT TTGTTTGTTC ATTTATTTGT TTGTTAGTTT TTTATTTGAT TATTTATTTT 1380
TTATTGTTTG ATTATTTATT TTTAATTTTT ATTTGTTTGA TTATTTATTT TTTGTTTTTA 1440
TTTGTTTGAT TATTTATTTG TTTGTTTGTT TATTTATTTA TTAGATTTTT TATTAATATG 1500
TTTATTTATT TATTAGTTTG TTTGTTTGTT AATTAATTAG ATTATTTATT TATTAGTTTG 1560
TGTTTGAATA TTTGTATGTT AATTTATTTA TTCGATTATT TATTTATTTG TTTATTTGTT 1620
TGTTTGTTTA TTAATTCTTT TGATCATTTA CTCATTGGGT TGTTTGAAAG ATTATTTATT 1680
TTTTGATTGT TTATTTGTTT GTTTATTTAT TTGATTATTT ATCCGATTGT TCATTTGTTT 1740
ATTAATTAAT TTGATTATTC ATTTATTTAT TAATTAGTAT GTTTGTTTGA TT 1792