EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR006-00409 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_4hpf 
Coordinate
chr18:45171480-45173443 
TF binding sites/motifs
Number: 13             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
CTCFMA0139.1chr18:45171690-45171709GCACCACCAGGTGGCAGTC-6.45
RFX1MA0509.2chr18:45171987-45172003TGTTGCTATGACAACA-6.64
RFX1MA0509.2chr18:45171987-45172003TGTTGCTATGACAACA+6.65
RFX2MA0600.2chr18:45171987-45172003TGTTGCTATGACAACA+6.45
RFX2MA0600.2chr18:45171987-45172003TGTTGCTATGACAACA-6.59
RFX3MA0798.1chr18:45171987-45172003TGTTGCTATGACAACA+6.14
RFX3MA0798.1chr18:45171987-45172003TGTTGCTATGACAACA-6.46
RFX4MA0799.1chr18:45171987-45172003TGTTGCTATGACAACA-6.32
RFX5MA0510.2chr18:45171987-45172003TGTTGCTATGACAACA+6.18
RFX5MA0510.2chr18:45171987-45172003TGTTGCTATGACAACA-6.4
SPI1MA0080.4chr18:45173309-45173323CACTTCTGCTTTTT+6.05
ZNF384MA1125.1chr18:45171601-45171613TTAAAAAAAAAA-6.44
ZNF384MA1125.1chr18:45171600-45171612TTTAAAAAAAAA-7.22
Enhancer Sequence
ATAACTGGTT TTAAAAAGCA TTTTGATATT GGTAAAGGCG TCTGCAACTT TTGTGAAGCA 60
TCAAATCACC GGCATATTAA CTATCAAAAC ATGTTCATGA CTGCATAAAT GTATTATTGC 120
TTTAAAAAAA AAATCACATA TTGTGCATGT TTATTATACA CAATTTGTAC TAAGCGATCT 180
AAAAAGTTTA TATTAATAAG TTTTCTCTGT GCACCACCAG GTGGCAGTCT TTGTACTTTC 240
ATTTCAAGAG TGCAGATTGC ATAAGTTTTA TTAATATATT TATACTTTAT ATATATAAAC 300
TTTATTTATT TTATTAATAA CTATAACTTT ATATATATAG TTTAAAAAAT ATTTACTCTT 360
TTCCCAAGTG TACATAACTA CTACTGTAAG AAAATATCAG AATTCGGTCG GTACGTACTT 420
TCTGTATTAT ATTTGCTTGA ACTGAGCCGA TCTAATCCTG TTTATATAAA TTGAACCTGC 480
TCCCGATCAG GCTTAAGCTA GCAGAACTGT TGCTATGACA ACAACTCTCG GATCAGCTTT 540
GAAGAACGAA ACGATCCTGG ATCGTGTCAA ATCGTCAATA TCCAAATCCA GCTAACTGAG 600
TAATCCACGT ACGAAGAACG GACCCCTGGA ATGTCCTGCC GGTGTCCTGC AGAGTTTAGC 660
TCCAACTTGC CTTAACACAC CTACACAGAT GTTTTTAGAA AGCCTAGTAA GGGCTTGATG 720
TCTGATTGGG GTTGGAACTA AACTTTGGAC ACCAGTCCTC CAGGACTAAG TTTGGACGCC 780
GCTGAGTAAT GACCTACTGA CTATATGTCC ATCCACCAGG GGAAATAGTT TGTCCTAAAT 840
TGTTTTGAGT TCAGGAAGCA TAAAAATAAG GCTCCTTGAG AGAGAATGCC CAATTTGGAT 900
GAACAGTGCC CAGAAACAAC CGCTTAGATT ATAATCTTAA TGGAACAATC AGCTTTTTTT 960
TGAATAGGCT CACTTTACAA CTCCCCCTAG AGTTAAACAG TTGATTTTTA TTTTTATAAT 1020
GTTTGCAAAC ATTCAGAGAA TCTCCGGGCC AGGTGGAAGC ACAGTTAGCT TAGCATAAAT 1080
CATTGAATCA GATTAGACCA TTAGCATCTC GCTCAAAGAC TTCTGATAAT TTTCCTAATT 1140
GTAGCTTGAC TCTTCTGTAG TTACATAGTG TACTAAGACT GACGGAAAAT GCAAAGTGGC 1200
TATTTTCTAG GATCTGTATA GGATCCATGG AGACATTTGA CGATTCAAAG CTCGTATAAA 1260
CTCTTTATAA ACTCTTTTAC AGAGTTGTAA AGTGTGGCCA TTTTCCTCAA AACTAATATG 1320
TGAATCCAAA AATCCGCTGT GACTTTTCAC CTGCTCTGAC CTTTCTCTTG CTCTTCCCTG 1380
AGGTTTACTG TGCATGTAAG AAAAAGTCCT TCATAAAAAG ATCCAAAATA AATCATGTTC 1440
AGTCTCTGAG CCCTGAGGCT TCCTAACAGG AGATGCTCTT TTGAGGTGTT TTATAGCCAT 1500
TGCTAGTTGT TAAAGGAACT TTTATCCCAG TCTCCCCGTC GGGACCCCCT GTGTTAATAC 1560
CTGATGGTGC TCTTCTTCAA TGCCGAATTG GATTGCTTAG GCCTTCGGCA GCAAAACTCA 1620
GATAAGCGTG GCAGATGCAA GCTGTAAAGA CCGTCCCAGG GCCGTGCTGG TGTCTCTGAC 1680
AGAATGAGAG ATTGCAGGAG CTGCTTCACA TGAGTCTACT GGAGATCACT TTGTTTTGAA 1740
GGGCGCCGAA GAGGAGGGAA GCGCACTGTG ATTCATGCTC CCCTAATGGA AAGCTCTCAG 1800
TGCCCTGGAG TACATACTTT AGCACAACAC ACTTCTGCTT TTTCATCCAC AGGAAAAAAA 1860
AAACACATTC TGGAAGGTGG AAGAATAAGG GGGGAAATAG TGATAATGCT GCTTTTTCCT 1920
CAGTTCCTGG CCTCGTAAAC AGTGCAGATC TTTTGACACA CTG 1963