EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR006-00405 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_4hpf 
Coordinate
chr18:44279533-44280873 
TF binding sites/motifs
Number: 11             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
BACH2(var.2)MA1470.1chr18:44280555-44280575AAATCATGACGTGCTGGTAG+6.87
HNF4GMA0484.1chr18:44279700-44279715AGGGGTCAAAGGTCA+6.89
NFYAMA0060.3chr18:44280325-44280336AGCCAATCAGA+6.32
NFYBMA0502.1chr18:44280320-44280335CAATCAGCCAATCAG+6.94
NR2C2MA0504.1chr18:44279700-44279715AGGGGTCAAAGGTCA+8.33
NR2F1MA0017.2chr18:44279706-44279719CAAAGGTCATGGG+6.48
Nr2f6MA0677.1chr18:44279701-44279715GGGGTCAAAGGTCA+7.95
RXRBMA0855.1chr18:44279701-44279715GGGGTCAAAGGTCA+8.42
RXRGMA0856.1chr18:44279701-44279715GGGGTCAAAGGTCA+8.42
RxraMA0512.2chr18:44279701-44279715GGGGTCAAAGGTCA+8.42
Sox3MA0514.1chr18:44279888-44279898AAAACAAAGG-6.02
Enhancer Sequence
AGAAACATTA CCCTGCTTAT TACCGCCCTG AGGAGAGAGA GTCTTATGAA TACCAATTTT 60
TGTGCGCGCA CACGTGTTTT GCGGTAACAA TAATTTCAGA GCGACCCACA GTTCCTGCTG 120
GGAGGAATCC CAGCATGCTC CGGTCCGGCC AGGACTGGCA GACTCCAAGG GGTCAAAGGT 180
CATGGGGAAA GGTTGCTTTT ATCTGCTAAT GAGGTCGCTA CCTAGGGCTC CTAATGTCTG 240
TTTGGCCGTC TGCGAGCAGG GGGCAGCGGC ACACTGAAAG ACCATGCTTG ACACCGATGC 300
CATCCGTCCC GGCGTGGAGC GATCAGAGCC GAGGGGCGAC TGGTCCCGAG AACAGAAAAC 360
AAAGGGCGCA GAAATTGCAG TCAGTCCCCT GGAGGTCCAG CTTGCTGTGT TTAACGTCTT 420
CTCATGCTAA TATCCAGCGA TGGGCCGGTT AGGAGATCTG ATGGATTGTC AAAGGTCTCA 480
AATAGATGAT AGGCTACAGT GACTGCGAAA CAGAGGACAA CAGGAGACCT GTGGAGAAGC 540
CTGAGACTCT TTCTTAGTCT GCTGCACTAA ACATCTGTCT GATCTTATGA TGTATCTTGA 600
TTTCTGTAGC GCTTTTATCA AGTAGATTGT CTCAAAGCTG CTTAACATAG ACGGAGAAAA 660
GAAAAATAAC AGTATTTCAC ATAGTGTAAC ATTCCAGGCA TTCAGGAGAG TAGTGGTAGA 720
ATCCCTAACC TGATTTCAGC AAGTAGGACA TGTTCTTAAC AGCTATGTTG ATCCTGGAAC 780
AACATTCCAA TCAGCCAATC AGAATTAAGG GATATGTTTA CCGTTTATGT AAAGTTTACC 840
CTTACAGTTT TATGCACTTC TACATGATTG TCATCCAACT AGTATTCCCT TCTGATTTTG 900
GGAATAATTT ACAGTTATGC TTTGGTTTAG GGGTAGGCAA TAGGTATGGA TTACATTTTC 960
AACAAAAAAA AAGTGATATT CCAGGATCAA CATGTCTGTT AATCCAGGAT TGAATCGTAG 1020
CAAAATCATG ACGTGCTGGT AGAATACTGG TGTAAACCTT GTTACATTAA AACTAATTCA 1080
AATCAGTATG ATGTCTCTGC TGAAGTTCAG TTCAGTTTCA TACAAGTGGC ACTGATGAAG 1140
GACAATCTAC TAAAGAGCAA CTCCACTGAA GTGCGTTTAT GCAGTTCTAT ACAGTATATG 1200
CTAGCATGTT TGTTTTTCTC ACTATGCTTC AACTGATGAC ATACATGAGA CTAAACTTCA 1260
TATTGCTGAT TCTCGAGTAC ATCAAATATA GATTTTTGTG TTACAAAATG ACAACAGGAC 1320
AGAATCCTTA ATGTTTTCAT 1340