EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR006-00404 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_4hpf 
Coordinate
chr18:43888681-43890720 
TF binding sites/motifs
Number: 16             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
ALX3MA0634.1chr18:43889184-43889194TTTAATTAGA-6.02
ARGFXMA1463.1chr18:43889184-43889194TTTAATTAGA-6.02
BHLHE41MA0636.1chr18:43888815-43888825GTCACGTGAC+6.02
BHLHE41MA0636.1chr18:43888815-43888825GTCACGTGAC-6.02
ELK3MA0759.1chr18:43888925-43888935ACCGGAAGTA+6.02
ETV1MA0761.1chr18:43888925-43888935ACCGGAAGTA+6.02
ETV4MA0764.1chr18:43888925-43888935ACCGGAAGTA+6.02
MITFMA0620.2chr18:43888811-43888829CATGGTCACGTGACCTAC+7.97
MITFMA0620.2chr18:43888811-43888829CATGGTCACGTGACCTAC-7.97
TEAD1MA0090.2chr18:43890140-43890150ATGGAATGTG-6.02
TEAD4MA0809.1chr18:43890140-43890150ATGGAATGTG-6.02
USF1MA0093.2chr18:43888815-43888826GTCACGTGACC+6.14
USF1MA0093.2chr18:43888814-43888825GGTCACGTGAC-6.14
USF2MA0526.2chr18:43888811-43888827CATGGTCACGTGACCT+6.87
USF2MA0526.2chr18:43888813-43888829TGGTCACGTGACCTAC-7.28
ZNF143MA0088.2chr18:43888873-43888889CGTGGCATTATGGGAC-6.17
Enhancer Sequence
CCGCCTACTA CTCAGTAGGT ACTGCTTTTG AATTTAAATG TACTACTCGG CAGTTACAAA 60
CGTACGTTCT ATACAGTATG AATGTGAAAA GTATGAACAG AATTCGGACG TACTATATCC 120
ACCATTTTGT CATGGTCACG TGACCTACCT GCATCAGTTG CGTTGCTTAA CTTCCATTTA 180
TGAATTCTCT CACGTGGCAT TATGGGACAG CGCAGCGTGC ATAGGATGCG CACTCCGGAA 240
TCTCACCGGA AGTAGCAAGT CATCCGGGTA CTTCTCGCAA ACTGATTTTC GAACTCTATG 300
AATTTGGACA TACTACTCGA CTCGCATACT GATTTTAGCA TACCATATAG TATGGAAGTA 360
TACGGTTTCG GACGCAGCCA ATGATTCATT TGAATTATTT AGCCTAACAT GTTTACCATT 420
ACAAAATATA TCAAATGTTT CTCTAAATAA AATAAATTGT GTTGAAAGGG GAGAAAAAAA 480
AAGTTAGTTT TTTTACCCAG ACATTTAATT AGAATATATT TTAAAAGGAG TAATCACAAT 540
ATCGTAAAAC AGAGATATTT TTATCCGAGG TTATCATACC ATCAGAATCT TATACCAGCC 600
CATGCCTAAT GTCGACCAAG CAAGACATCG TATGAGGTCT AATGTGAAAC TTTGTGATGC 660
AAGATGAGAT CAGGGTTAAG GTTGGGTTTG ATAAAAGGTT CCATCATTTT AATTTTCTTT 720
TAACAAAAAG TGTGCTAATT GCTCTGTGCA TCTTTACCAC AAACTAGCAC TAACACTTAT 780
ACTTCTACAA TTACCTGCAA TATTACAGCA TCAAAAGAGT TAACGCACAC TCATGCAGAA 840
ATTACAGGGA CAAGCTCTGG TAGAAGTGTC AAGATAAAAG TATCTTGAAT TTGTAACCAA 900
TTACAACGTT AATTCATTTT CAGATCTATG AACAGACCAT AAACGTTATT AAATGTCTAA 960
TGTGAGTTCA ATAATGATGG CAGCAGCAGC TGGCACAATG TCAACACGAT AGGCCTCATT 1020
GTAAAACAGT CTCGCGTTTA CCTAAAGCAT TTAAAAATGA CAAACTTTAA TAAATGTGAC 1080
TTCAGTGTTG TTATGCATCT ATAAAAACAG GTGAAGTTGC ACATTGACTA CACAGCTGTG 1140
GAGCTTAAAA TTAGACATAA AAAATGTTTG GTTACCTTAA GTTAAGCGAA AGCGTATAGT 1200
TCATTGAACT CATTCCACGA ATACTAAAAA ACAATGTTAT GTTATACGAT ATAACCAGTG 1260
TCACGTTGTA GTTATTAAGC TAAAATGTAC ATCTTAAAGG TTAACCGTAT TGATTCCACA 1320
TAACGTGAAA CTCGGCGTCA CGCAGCAAAC GTTAATGCTA ATGTTTAGCT ACGCAGCTAC 1380
CACTGACGGC TTCAAGTCAG ACAGATTTTA ATAGTCGGAT ACATTTTAAA TCTTTAGCAA 1440
ACACGGTTAT CATAATACGA TGGAATGTGG CTTTTATTAT AAGCAAATCT AAATATTTAA 1500
TCTGTTAGGA AGGAAATTTT AGCAGTGCTC AAGCTCGTTA GCTTTGGGCT TGCACACAGG 1560
CCGCACGCGT AACCTCAGAT TCACAATCAC CAGTATAAAG AACTAAACGC TCGTTTCATA 1620
AACGCTAAAA CAGAAGCAAG AACATATTTA ACTCTTAACT AAAGCAGCTA CACAAACACT 1680
GCGAGCCAAA AAGACATCAC AAATTTGTAA ACACCAAGAC ACAAAGAAAC CCACAAAACC 1740
GACTTAATCC CCAGAACACA ACACGTAAGG ATTTGACGTT CTGCAAACTT ACCAAACGTG 1800
GCAGAGAATA TCTTTCAGTG TGTTTGTGTT TGTGAATTAT AGGTGTAGAG TTGTGACATA 1860
TTTCGGGGTG TAAAGCGAGT GTGTAAGATG GCTTCCAGTC ATCTTTAAAC CCTCCCATAA 1920
TCAGTCACAT GAGACAGAGC CCTGTCTAAT CCACACAAAC GCAACGCATA TGACGATTGT 1980
TTAGAAAACG CAATTTAATG CTGCCGTCAT TTCAAATGCG TTGTTAAATA TATATATTA 2039