EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR006-00399 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_4hpf 
Coordinate
chr18:41852911-41855343 
TF binding sites/motifs
Number: 7             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Foxd3MA0041.1chr18:41854203-41854215GTATGTTTATTT+6.11
Foxj3MA0851.1chr18:41854640-41854657AATTTTGTTTATTTTTG-6.15
Foxq1MA0040.1chr18:41854810-41854821TATTGTTTATT+6.62
PHOX2AMA0713.1chr18:41852973-41852984TAATTGAATTA-6.14
Phox2bMA0681.1chr18:41852973-41852984TAATTGAATTA-6.14
STAT1MA0137.3chr18:41854381-41854392TTTCCCAGAAA-6.02
STAT3MA0144.2chr18:41854381-41854392TTTCCCAGAAA-6.32
Enhancer Sequence
GTATCTATCT GAAAAATATG AGATGTCTCA CAGTCAAAAC ATCTAGTTCT GTTGTTTTTA 60
CTTAATTGAA TTAGCGGCGT TCCAATCATG TTTATAGTTC TGTACAGACC TGGAGCATTT 120
TAATCTTCTT AAGATTTCTA CTAAAAAAAT AAGCTTGAAT GGGTGATTTC AGTACACAGT 180
GGAGACCAAA TGTCTGAGAC CACAATTGTG AAAAATATTT GTTTTGAAAA TATAGTTTTT 240
TACAGAATAT TGCTGGCTGC AGTACACATT ATTTTTATTA TTATATATTA TTACATTATT 300
TTATAAAAAA AAAAAAAAAA AAAAATATAT ATATATATAT ATATATATAT ATATATATAT 360
ATATATATAT ATTCAATGCC AATCAAATTC NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN 420
NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN 480
NNNNNNNNNN GCCACCCCTG ATATATATGG TTAAAGTCAG AATTATTAGC ACCCCTTTGA 540
ATTTTTTTCT TTTTTAAATA TTTCCCAAAT GATGTTTAAC AGAGCAAGGA CATTTGCACA 600
GTATTTCACA GAAAATATAT TTTCTTCTTG AAATAGTCTT ATTTGTTTTA TTTAGGCTAG 660
AATAAAAGCA GATTTAAATT TTTTAAAAGC CATTTTAAAA CAGACAAAAT TATTAGCCCT 720
TTTAAGCTCT ATTTTTTTTC GATAGTCTAC AGAACAAACC ATCAATATAG AAAAACTTGC 780
CTAATTACAC TAACCTGCCT AGTTAACCTA ATTAACCTAG TTAAGCCTTT AAATGTCACT 840
TTAAGCTGTA TAGAAGTGTC TTGAAAAATA TCTAGTAAAA TATTATTTAC TGTCTTCATG 900
GCAAAGATCA AATAAATCAG TTATTAGAGA TGAGTTATTA TTATGTTTAG AAATGTGTTG 960
AAGAAATCTT CTCCCCGTTA CACAGAAATT GGGGAAAAAA TAAACAGGAG GGCCAATAAT 1020
TCAGGGGGGC TAATAATTAT ATAAATATTC ATATTATATA TAAATATGAA TGTCAAAAGA 1080
AATGCATCCA GTCTGGTTAG CGACATTTTA AAAATATCTT TAGCGTTTAA CAGAACAAAG 1140
AAATTCGTTC AGACTTAGAT CAACGAAAGG ATATGTACAG AATTTTCATC AATAGTAATG 1200
CAGCATTTGA AATCATATTG TTGGATTTTT TTGTTTAAAA TCTACAAATG ATAAAAATGG 1260
TCTCAGACCT TTAAACATTC GGGACAGTAA AGGTATGTTT ATTTATGATG AGATACACAT 1320
CACACACACA CACACACACA CACACACACA CAAGCTTGTT TTGGTGGTTT ATGAGGACTC 1380
TCTATAGGTG CAATATCTTT TATACTGTTA AAAACGCTTA TGATATGGTT TTACCCTGCT 1440
CATACACTGT TAAAAGTCAC AGAATTTTAC TTTCCCAGAA AGTTCCACAA TGCTACTGTC 1500
ATTTTTCACA GTAAATTACA TTAGTATCAC TTCACAGAGT TTAAATGTGT AATTCAGAAA 1560
GATTTTTTTG TATTTAGAAT TTTATCGTGA AATTGACGCA GGCATCATAA TTACAGGAAA 1620
TTACTGTAAA AATCTTCTGC ACGTGAGTTT TAGGAATTCA AACTCGGGGA TGAAAGTAAC 1680
ACACGGGGGG GTCAAAAGTA ACAACAATAT TTGCTAGATT TTCCAGCTTA ATTTTGTTTA 1740
TTTTTGATAT ATCTGACTTA ATGTTAACAG CAAACATATT TGTCCTTTAT TCTTCCCAAA 1800
CACGATTAAA TGGCATTTTC ATTTTAAATT TCACTTCGAT TAAATATTTT AAAATCAGTC 1860
CAACATTGCA AAATGTTAAA CTTTTCTAAC ATTTTTGAAT ATTGTTTATT ATTATTGGCA 1920
ATAAGCATTC ATTTTTTATA AAACCTCTAA ATCCAAACAC TGCAAACTGT AATGTGGAAG 1980
CAAAAAAATG TTACTTTTGT CCCCACTGGA ACTAAACCCA TTTCAAGAGT TCCCACTTAG 2040
CTGATGATTG ATTATAAAGC TTGTTTGCCA TGCATAAGAT CCTTGAGCCC AGGGCTTCCT 2100
CCCATTTCCA AGGCGAGAGG GTAGTTTGAG CTCAGGTAGA TCTAGAGAAC TACCCTGCTG 2160
TATTAACTAA TGAACAGATA GTGATTGCTC TTAAGAGATC ACTACTTACT AGGAGCATGT 2220
CTATGTTGCC AATTTGGATT AGTCAATTAA CTTAAGTTGC ATTTTTTTGG ACTGCGGGAG 2280
GAAACCGGGG GAAACCCACA TGAGGATGGG GAAAGCGTGT AAACTCCACA CAGAAACGTC 2340
GGCTGGCTTG GTAAGGACTA AAACCAGTGA CTTTCTTGCT GTGAGGCAAC AGTGCTAACC 2400
ACTGGGCCAC TGTGCCACCC ATCTTGGAAA GG 2432