EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR006-00331 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_4hpf 
Coordinate
chr17:35571782-35573184 
TF binding sites/motifs
Number: 9             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
FOXP1MA0481.2chr17:35571814-35571826TACTGTTTACAT-6.11
IRF1MA0050.2chr17:35572867-35572888ACAAAAAAAGTGGAAGTGAAA-6.04
IRF1MA0050.2chr17:35572873-35572894AAAGTGGAAGTGAAAGCTGAT-6.57
Lhx3MA0135.1chr17:35572325-35572338TAATTAATTAATT+6.78
Lhx3MA0135.1chr17:35572326-35572339AATTAATTAATTT-6.92
POU6F1MA0628.1chr17:35572327-35572337ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr17:35572327-35572337ATTAATTAAT-6.02
ZNF24MA1124.1chr17:35572210-35572223AATTCATTCATTA+6.17
ZNF384MA1125.1chr17:35572336-35572348TTTTTTTTTACA-6.07
Enhancer Sequence
AGCCATTCTG AATTCAATTC TGAACGCAAC CATACTGTTT ACATTTTAAT AATGGATTTG 60
CACATGCTCT CACAAATACT GACTTGTGGT GCTTAAATTG GTGATTTGAG TTCTCGTTTC 120
CCAGTTTTTA AGAACACTGT TAATTAAAAA CAAAAAACAA GTATAATATG AATTACAAAT 180
AAAGTTACAA TGCAGTTACG ATGCAGTATG CAAAATAATG AGAGCGTAAA GGGCAATGCA 240
TTTTATTTTA AACATAGATT TCTATCAGGG TACACACAAC AGTGCCACAA GTTGGTAGCT 300
GTCTGTGGCA CCCTCACTTT AAATAAAATC TGTTATTTAA TTTTTTTTTC CAGCAGCTGG 360
GGTACTGGAA ATCAAAGGTA AAATAATTGC CATTAAATTA CAAAAATTTA AAGTAAAAAA 420
CAGACGTTAA TTCATTCATT AGTTTTCTGC CACTTTACAG AAATTTCCTT CAATTTAATT 480
TTCTGGTAAA TTTCTGTAAT TTAGCGGTCG TTATTTTACA CTTTAAATAG CGTAAAATAA 540
TTATAATTAA TTAATTTTTT TTTACAGTTA GGCTACGACT TAGGACACTG TTCATATTTC 600
TGTCGGGCTA CAGAGCACCA TCTTAGTTTC ATATTAAATA ACATTTAAAT GTGCACGTCT 660
GGTGTTCGAT ACTTCGATAC TCGATACTTC CAATTGTCAT GCGTGCGCCA AAAAGAACCC 720
CCACCCCCAA AGAACTTTAA ACAGTTATAA ATTAATTTTA AAATGTTGAT TGTTAAAAAT 780
ACTGTTTATT AACATTTATT TGTTAGTGTT TTATCCTAAA TTGTTGATTG TTAAATATAC 840
TGTAAATTAT TGTCTTTTTT GTGGTTTTGT TTACTACTAT AGCTTTTGTT TTCAAATGTT 900
CTGTTTGATG TAAATATCAG AAATGCTTTG ACAATACATA TGTAACATTT GTCATGTCAG 960
TAAAGAAAGG TTGAATTTGA GAGAGAGAGA GAGAGAGAGA GAGAGAGAGA GAGAGAGAGA 1020
GAGAGAGAGA GAGAGAGAGA GAGAGAAATC CATCTTGATT TATTTTTCAA AATACACACA 1080
CACACACAAA AAAAGTGGAA GTGAAAGCTG ATAGGGGTGC AGCGGAGCAG CACTAGACAG 1140
ATGCTGTGTA TGTTGAGAAA CTCTTTCAGT GCTAAAGCCT GGCCTGCACC TCAGCTAACT 1200
TTCAAGCCCT GTATACTCAC TTAATACCCT CCTCTGCTTC CTGGCCCAGC CTCGGCCTCC 1260
TGTCATGCAT ATCAATGCTG CATGAGAGCT AGAACAGAAG GATTGAGGAT TGGGCCGAGC 1320
GCTGAGGCCT ACACAACAGT CGGAATCAAT CAAGTCTGCA GGATTACTGC TCCACTGAGT 1380
TGTGATCAAT AGATCCACAG CA 1402