EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR006-00316 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_4hpf 
Coordinate
chr17:17944665-17946483 
TF binding sites/motifs
Number: 12             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Alx1MA0854.1chr17:17945313-17945330TTTAATTAATTAATTCA-6.49
ArxMA0874.1chr17:17945314-17945331TTAATTAATTAATTCAT-6.04
ArxMA0874.1chr17:17945313-17945330TTTAATTAATTAATTCA+6.31
FOXK1MA0852.2chr17:17944688-17944702TGAGTAAACAAGGA+6.14
Lhx3MA0135.1chr17:17945316-17945329AATTAATTAATTC-6.29
Lhx3MA0135.1chr17:17945315-17945328TAATTAATTAATT+6.78
POU6F1MA0628.1chr17:17945317-17945327ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr17:17945317-17945327ATTAATTAAT-6.02
TFAP2AMA0003.3chr17:17945713-17945724AGCCTCAGGCA+6.32
TFAP2B(var.2)MA0812.1chr17:17945713-17945724AGCCTCAGGCA+6.62
TFAP2C(var.2)MA0814.1chr17:17945713-17945724AGCCTCAGGCA+6.62
YY1MA0095.2chr17:17945395-17945407CAAGATGGCTGA+6.04
Enhancer Sequence
GGCTTTTCAA CCAACATTAG GGTTGAGTAA ACAAGGACAG AATTTTCATT TTGCCATGAA 60
CTAAGCCTTT AAGTCATCCC GAGACCTGAC TTTGAGGTCA TGTATCTCTC CCTTTGAGGG 120
GTAAAAGTGC TTCTGTCCTG CTTTGAAAAG ACTCTGGCCC CCCAGCAAGC CACCAATGGA 180
CTGAAGGTTT ATTGGCTGGG GTCGAGATTC TGTTTCAGAG TTCAGATAAC AGTCCTGGCT 240
GACTCTTCCC ACGGCTGGAG TGAAAAGGCC TTCAGTTGCC CCCATTCAAG ACCCTCCATC 300
AGGCCTTTAG AATCCTTCTG CGACACTCAA AGGTACAGAT GTCTGGCTTG TCATAAAACA 360
GATCCCAATT TACGAGTAAA GCTTTCAGTG TAGAGGTCAC CCCTTTTTTC TGAGTTTCAT 420
GTGTTTGATT GAACTTGAGT TGATGTTTTC TTATTCATTG ACAATAGACA TAGCTTGCCG 480
TTTTTTAACA ACCCTAACGG AAATCTGATA TATGGCCATA GTGCTGGGGG TAACGCATTA 540
CAAGAAATGT GAGTTGCATG ATAATTTTAT TTTATTTAAG TACAGAGTAA ACTTACGCAT 600
TACTTAAAAA ATATTTGAGT TACTTTTTTA AAAATGTATT GCGAGTTTTT TAATTAATTA 660
ATTCATTTAA AAAAATTATT TGCTGAATTA AAATAAGTGT AATCACAATG ATGCAGTAAT 720
AGACAGAAAT CAAGATGGCT GAGCCGAACA TTTCTGAGAT AGAAGTATTC TTATTTTTCT 780
GAACTCATGG AAGAAAAGAA GATATTAGTC TTATTGAACA GTGATTTTGA GACATAAATA 840
TTAAAATAGC AAGCACATTG CTTTTCTATT TTATTAATGT GTTTTTATGG CATGTATAGC 900
ATCAGTAAGT TCTCAGAAGG AAACATTATT CTATTCTATC TTATTTTTTT TAAAGGTAAG 960
TGAAAGTGTA GGTTATACAG TGGGTCGTTA AATGCAGAGC GCCTCTATTA AAAAAAGACA 1020
AGTACCATGC AAGTTCTGAA AGAGATCAAG CCTCAGGCAG GTATGAACAA GTAACTCAAA 1080
AGTAACTCAA TGCAGATACA AAGTAACGCA ACTACTTTTT TGACGAGTAA CTCAATATCG 1140
TAATGCATTA CTTTCAAAAG TAACTTTGCC CTACACTGGC CATTAGTGCT GGGTAAGTTA 1200
CCTAAGAAAG TAATTACTTA CTGATTACTT CATTAAAGTT GTATTTAAAT AGCTTTTACT 1260
TTGTCTGAAA AGTAGTGTAA TGACTCCATA TTTAATTTAA TTTCTTGACT CGATATTGCT 1320
TATAATCCCT TTAAATCCCA ATGCAGAGAC AATAGAAATG AAACAATTTA AATTCTTTCA 1380
ATTTAAGTCA AACTATGTCT TTTAGCTTTA TTCAGAAGTT AAAGTCTATT TTTTTTTTCA 1440
ATCATTCAAT TGATAAATGT AACTTTAGTT ACAGTGAAAA TAATTTTATT ATTCTGCAAT 1500
ATATATAATA AATGCATTTT CTCTCCTTCT CTGAATTTAT TTATACAGAA CTGTTGAATA 1560
TAAATACATA AGGTATTTAA GGTGAATATA TTGTAAGAAA CTGTCATTAA ATTGGCAAAA 1620
AAAGAAAACT GAAGAATCTT TATTTCAGCA AAAATTACAG TGAAGTTACT TTGTAACTAA 1680
TTACACCCAA CACTACAATA ATTATAGATA ACATAATTAC GTACATATTT GTAATTCTAA 1740
TAGTTGAAAA TTAATATATG CACTGGCATT TTTGTAATTA TTTGAAATAT TTGTTGCATT 1800
TATTCAGTGG TGAAAAGA 1818