EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR006-00308 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_4hpf 
Coordinate
chr17:1985371-1986847 
TF binding sites/motifs
Number: 25             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
KLF13MA0657.1chr17:1986092-1986110ACAAAGGGGGCGTGGCTC-7.55
KLF14MA0740.1chr17:1986095-1986109AAGGGGGCGTGGCT-7.58
KLF16MA0741.1chr17:1986097-1986108GGGGGCGTGGC-6.62
Lhx3MA0135.1chr17:1985582-1985595GATTAGTTAATTT-6.03
POU1F1MA0784.1chr17:1985859-1985873AATATGCAAATAAG+6.92
POU2F1MA0785.1chr17:1985859-1985871AATATGCAAATA+6.37
POU2F2MA0507.1chr17:1985860-1985873ATATGCAAATAAG-6.57
POU3F3MA0788.1chr17:1985859-1985872AATATGCAAATAA+6.04
POU4F1MA0790.1chr17:1985539-1985553CATTAAATATTCAT-7.06
POU4F1MA0790.1chr17:1985760-1985774CATTAATTATTCAT-8.42
POU4F1MA0790.1chr17:1986027-1986041CATTAATTATTCAT-8.42
POU4F2MA0683.1chr17:1985537-1985553CTCATTAAATATTCAT-8.33
POU4F2MA0683.1chr17:1985758-1985774CTCATTAATTATTCAT-9.03
POU4F2MA0683.1chr17:1986025-1986041CTCATTAATTATTCAT-9.03
POU4F3MA0791.1chr17:1985761-1985777ATTAATTATTCATGAG+6.25
POU4F3MA0791.1chr17:1986028-1986044ATTAATTATTCATGAG+6.25
POU4F3MA0791.1chr17:1985537-1985553CTCATTAAATATTCAT-7.75
POU4F3MA0791.1chr17:1985758-1985774CTCATTAATTATTCAT-9.33
POU4F3MA0791.1chr17:1986025-1986041CTCATTAATTATTCAT-9.33
POU5F1MA1115.1chr17:1985860-1985871ATATGCAAATA+6.02
Pou2f3MA0627.1chr17:1985858-1985874TAATATGCAAATAAGT+6
SP1MA0079.4chr17:1986096-1986111AGGGGGCGTGGCTCG-6.14
SP3MA0746.2chr17:1986096-1986109AGGGGGCGTGGCT-6.46
SP4MA0685.1chr17:1986094-1986111AAAGGGGGCGTGGCTCG-6.87
SP8MA0747.1chr17:1986096-1986108AGGGGGCGTGGC-6.92
Enhancer Sequence
TTATGAGTAC AAGTTTCAGA TTAGTTTATT TAGTAATAAT AGTTATAATT TGTAAATAAA 60
TCAAACGGTA TTTTTAAAAT AATATTCAAT ATTGTATTAA TAATATTTGA ATATCTAAAC 120
ATAAATTTGA ATTTGAGTTT CATTGCAGGG CTGCAACCCT CATCATCTCA TTAAATATTC 180
ATGAGCTGGC GGTTTATGAG TACAGGCTTT AGATTAGTTA ATTTAATTTA AGTCATCATA 240
CCTAGTGTAT TATTTGCGTA TAAATAAAAA CATTCTAACG TTAATAATAT GCTTTTGCTG 300
GTAACGTAAG ATAATTCAGA CAAAATCAAC TTTGAATATT TGAAATTAAT TTTTATTTAA 360
GTTTGATTGC AGGGCTGTCC TCATCTTCTC ATTAATTATT CATGAGCCGG TCAGTTATTG 420
AGATTAGTTT ATAGAATTCA TCACAACTAG TGTCTTATTT GTAATGACTC AAACTTTATA 480
ACATTAATAA TATGCAAATA AGTAAACAAC AGTACTTAAT CAACCCCATC ACAATGACCT 540
AAACTGCTGG TAAAACCTAA TGTAAGATAA TTCAGTTCAA ATAAGTGTGT ATCTAATTAT 600
CCAGTTTTAG ACATTTGCAC GGTATCATCC CCGGGCTGTC CTGACCCTCA TCATCTCATT 660
AATTATTCAT GAGCTGACCT GTTTATCAGC GCGCGTCTCA AATCACCCGC TCACCGCGTA 720
CACAAAGGGG GCGTGGCTCG TCTCCTAGGT GATGCTGTGT CACACACACA CATAGTATGC 780
ACACACCACT CACACACATT TACAGTACAC GCACTCCGCA AAGACAACCC ACAGGAGCGC 840
GCGCGCGTGC GTGCCTGCGA GAGACACAGA AACGGAGAGA AGCAGAGGAG GAATATCTAG 900
CAGACCTCCC ATCATCTATA TGTGGATTAT ACCGTCATCA TCATCATCAT TATTAAAATC 960
AGCATGGCTC CTCCATCACG GCACCGGTAG CAGGATCAGA TGCTCCTGCA GTGGGAGGCT 1020
GACCGAGCGA GCGCGCGCAC GCGGCTGAGT GTGTGTATGC GTGTGTATGC ATGCGTGTAT 1080
ATGTGTGTGT GTCCTCTCAC ACAGCCACAA AGCCTCTTCC CAACAGAAGA GGCTGCTAAA 1140
TTCATCCTGA CACAACGGCG AGGTAAGAAA TGCGTTTTTT TTCTTGCTAT GTTTACGCGA 1200
GCCGCGGGCA CGCGCTTATA TGGTGATGCT GAGCTGCTTT ATTGTGTACA TCGCCGGATA 1260
AAAACACAGA CAGACAGCCA GACAGACAGA CAGACAGAGA TCGCGCACAA GCACAAAGCA 1320
ATGAGAAGCC GAAGAGAAGG TGAAGCTGTG ATGTGGAAAT GCTTTTACCT CAGCTCCTCC 1380
TCCATCCACA TTTGCATGCA TTAAGATCAC AGTGATATAC TTGAGGAGCA TCAGTGTAAA 1440
CCGGGCAGAA ATGGTAGGAA CAAACAAAAT GGAAGT 1476