EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR006-00307 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_4hpf 
Coordinate
chr17:1637890-1639376 
TF binding sites/motifs
Number: 10             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
EWSR1-FLI1MA0149.1chr17:1638788-1638806CTTTCCTTGCTTTCTTTC-6.45
LMX1BMA0703.2chr17:1638270-1638281TTAATTAAATT-6.32
LMX1BMA0703.2chr17:1638267-1638278ATTTTAATTAA+6.62
MAFGMA0659.1chr17:1639054-1639075AAAAAGCTTAGTCAGCAGATG+6.24
MAFGMA0659.1chr17:1639054-1639075AAAAAGCTTAGTCAGCAGATG-6.33
MAFKMA0496.2chr17:1639055-1639074AAAAGCTTAGTCAGCAGAT-6.37
MAFKMA0496.2chr17:1639055-1639074AAAAGCTTAGTCAGCAGAT+6.66
ONECUT3MA0757.1chr17:1638998-1639012TAATAATCAATAAA+6.23
RARA(var.2)MA0730.1chr17:1639313-1639330TGACCCTTGTGTGAACT-6.87
Rarb(var.2)MA0858.1chr17:1639313-1639330TGACCCTTGTGTGAACT-6.62
Enhancer Sequence
CACATACACA CTCGCATGCA TACACACACA TACTGACACA CAAATGCGCA TACAAACACA 60
CACACGCATG ACACACAAAT GCTCACACAC ACTCTCATGC ATACACACAC ACAACACTGC 120
TCTCACACAC ATACAGACAC ACACAAAAAC CACTGCTCAC ATACACACAC GTACTGACAC 180
ACAAATGCAC ATAGACACCC GCGCACACAC ACACACACAC ATACTGACAC ACAAATGCGC 240
ATACACACTC GCATGCATAT ACACACACAC ACACACATAA ACACACACAC ACACACTAGA 300
GATGCGCGGA TGGCGGTTAC AGCCGTGGAC TCCGCGGATA AACCGTGGAT CGGGCGGATG 360
ACGTGACGAA AAATAATATT TTAATTAAAT TCGGGCGGGC GGTGGGCGGT TGTACTGTTT 420
TTGTACACAG CTGGCGCACC AACGAAAAAG CCTAGAACTG ACTTCACAGA ATGGGTGGAG 480
GAATCGGATA CACTAATTCT GGATGAAGTA CAGAAGTTTT CATCTACAAA ATTAAGAATA 540
GACGGATCAG CAGAGGAAAA TCTACTTTCC TTTTGGGAGA AACAAGGCAG TCATTCCCAC 600
GACTACAGCA CCTTGCCAAG AGAATATGCA TTCCTGCAAT AAGTGCTGCG AGCGAGCGCT 660
CCTTCAGTGC AGCAGGGCGC ATTAGAGGCC AGGCGCTCTC GTCTGAATGT TGAAATGATG 720
TGTCAAAATG CGTTTTCTAG GCTACAATAA TAATAAAAAA ATGTACAGTA CAGTGCGTTT 780
CATTTAGGCT ATTTATTTAT TTTTGTCCCT TTGCACCGAT TGGAGACGGA GTTCACTGCT 840
GATATTCTGA GAGCTTTATA GGGGTGCTTC TCATTTCTTA TTTGTGTATC CTCGTGTTCT 900
TTCCTTGCTT TCTTTCCTCG TCTTTCCACC CCTATAGGAT GTGAGGGAAG GACGCAAAAA 960
AAACAAAAAA CTCAAGGACC GAGGAATCGA ATCAAGTGAA AAGACACGTC CTCGTATTGT 1020
TTAGCGTCAC TTCAAAGCGT CTATTAATGC TGGATTTGAC TTGCACGTTT GGATTAACTG 1080
CATGTCATTA AAGTCATTCT CTATTTTCTA ATAATCAATA AAGAAACATT CATTTAATAA 1140
TAAAAAGGAA TAAGCCATTC AAATAAAAAG CTTAGTCAGC AGATGACGGG TGGGTGCGGT 1200
TTTAAAATTT GGTCAAAAAT GTTAGTGCGG ATGGATGGCG GACGGATGAG GAGTTTTATG 1260
ATGCGGTTGC GGATGAAATA ATAGCCCATC AGCGCATCTC TAACACACAC ACACACACAC 1320
TCTCACTCAC TCTTTGACCC AGCCCTCTAA ATGAGGTCCT CCTATTGACT GGTGTTGTTT 1380
TTAAATGAAG CCAATTATAA TGACAACAGA GGAGCTCAGA GTGTGACCCT TGTGTGAACT 1440
GCTGGACAAT TCTTCCATTA AATCAAGACG CTGCTCCTTT TCTTGA 1486