EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR006-00305 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_4hpf 
Coordinate
chr16:47903021-47904447 
TF binding sites/motifs
Number: 7             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
BACH2(var.2)MA1470.1chr16:47903023-47903043AAATCGTGACGTGATCAATA+6.29
BHLHE23MA0817.1chr16:47903837-47903849AAACATATGCTG+6.04
CDX2MA0465.1chr16:47903078-47903089AAGCAATAAAA+6.32
CDX2MA0465.1chr16:47903098-47903109AAGCAATAAAA+6.32
LMX1BMA0703.2chr16:47903705-47903716TTAATTAAAAT-6.62
Lhx3MA0135.1chr16:47903699-47903712TAATAATTAATTA-6.18
ZNF384MA1125.1chr16:47904330-47904342TTTTTTTTTACA-6.07
Enhancer Sequence
GAAAATCGTG ACGTGATCAA TACTTATTTC CCCTACTGTA AATAGGAATA CAAGAATAAG 60
CAATAAAAAT GTAAAATAAG CAATAAAAAG TAAAAGAATG AAAATGGATA AAACAGATAA 120
TAAATCTCAC CAATGCAGGT TGGCGGGCTG GGCTGCCAGT AGAACCTGTT GTCCACCTGA 180
ATGCAGGTGA TTCTGGGTTC GCCTTGGAGG TCGTAGCCCG GATCACACGC GAAGGTCATG 240
GTGTCGCCTG GTTCCTTCCC TTCTCCGCTG CGGCTGCCAT TCATGGGCGT CCCAGGATCC 300
CTGCAGGCGG TCGCAACTGA ACCTGCATAA TAGGAAATGA TGACCGGCTG AGCTCACTTT 360
TCACTTACCA GGATTTCTCC ACAGGAGGTG GCATTTCCTG CTTGGAAATG AGGTTGCGTG 420
GCCTCGGTGC ATCACAATGG CTCACTGGGA GCTCTGTCGA AGCAGAACGC CATCTAATGC 480
AGTTCTGAGA TACAGTACGG CAGCACCGCT AGGCTGAATC ACTCGCTAAT GGAGGTATTC 540
TTAAGCATTT ACTTTCAAAT TACTTTTACT TTCTTCGAAT AGAGGGACCA TTTTTCTGTG 600
CAAGCATCCT TTTTAGACAA TTACACTCAA AATGTGTCAC ACAAGGTAAA ATGCTGTAAA 660
AATAAAATAA AAATAAAATA ATAATTAATT AAAATAAAAT AAGGGTTTTA ACATGGTGCA 720
GTGAGTAGCA CAATTGCCTC ACAGCAAGAA GGTCGCTGGT TCGAGCCTCA GCTGGGTCAG 780
TTGGCATTTC TGTGTGGAGT TTGCATCCAC TGTGTAAAAC ATATGCTGGA TAAGTTGGTG 840
GTTCATTCTG CTGTGACGAC CCCAGATTAA TAAAGGCACT AAGCCGAAAA GAAAATGAAT 900
GAAAACAAAA TAAATACATA CATAGATACA TACATACAAA AATAAAAATA AATAAATAAA 960
TAAAAAATAA ATAAATGACA CTAAGGCAAT TCTGAAATGT TTTCTGTGAA GTGAACACAA 1020
GTACTTAAGA ATAAAAAGAC TTTATTTAGT GAAGATAAAT ACTGTACACT GTAAAAAATG 1080
AATAGTTGAC AAGACTAAAA ATAAGTGAAA AGGCCTCTTG ATTTTTAAAT GATTAATTTA 1140
CTTTACTTTA AAAAAGTGTG TAAGTTTGTT CCTTTAAAAT GTTTAAGTTA AATCAACTTA 1200
ACAGTTCCAA GTTACAAAGG ATTTAGTCAC TTTAAGTAAA GTCAACTTGT CACTTTTAAG 1260
GCAACTGGTT TACTGACCTT ATTATGTAAA GTATATGAAT TTTTATTATT TTTTTTTTAC 1320
AGTTTTTTTT TTGTGTTTCT TACTGTACTT TTTTCAGCCT GATCTCACGA GGAAACATAA 1380
GTATTTTACG TTTTGTCAGT TTAGTGGCTA ATTCAGTTCA GTCATA 1426