EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR006-00288 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_4hpf 
Coordinate
chr16:13649409-13651791 
TF binding sites/motifs
Number: 5             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Foxj3MA0851.1chr16:13651202-13651219GTTTTTGTTTATTTTTG-7.03
Nkx3-2MA0122.3chr16:13651390-13651403AAATCCACTTAAT+6.2
ZNF384MA1125.1chr16:13649897-13649909TAAAAAAAAAAA+6.37
ZNF384MA1125.1chr16:13649896-13649908TTAAAAAAAAAA+6.44
ZNF384MA1125.1chr16:13649895-13649907TTTAAAAAAAAA+7.22
Enhancer Sequence
CACAGAGAAA GAAAGGAAAG GAGAGTCATA GGAGGCCTGA ACTTATCAGA GCTGCTATCA 60
GGAACACAAG CAACTGGTGT AGTCTGTGAG TGACTGACAG AAACAGGAGG AATCAGAAGT 120
CTGACAGCAT CACAGCTTTG ACAGTAAACA GCTTTGCTTA ATAAAAAACC CCACAGATCT 180
CCAACATGCT TTTAACAGTA AGTCAGGCTA TTAAGCTTCA AAAAGGAAGT GGTCAAACAA 240
TAGCTGTGTG TGAAACTGAA CATTTGCTCG TCATTCAAGA AAACCTTGAC AATGGCATGT 300
GAAGTAGAGA AGTAGAGACC TGTAAACAAA TCATTCTATT GAGGCACACT TTTTTAATAC 360
GTTGTTTTTT CCTGTGTGTG AATGATTGGT TTATGAATTT ATATCAATGT TGTTTTTGAG 420
TTCAGTTCAC AGTGAATCGA ATAACAAACA ACAAAACAGT GTCCGAGAGA GCTTAACATA 480
CTGCAATTTA AAAAAAAAAA CGTGCAATTA CAAAGAAATT GCCAACAAAT TGAGAAAATA 540
CTTTCATCTG TTTGACAGCA CCCATGCTGC AAATACTCAC AACAAACCTC ACAACGCAAA 600
CAAATTAATA AAACACGCTG CATGTTCTTA CAATTCAAAC AAATAAAACG CACTGCATTT 660
TCTCACAACA CAAACAAACT AATAGAACGT GCTGCATTTT CTTACAACGC AAACAAATAA 720
AACGCGCTGC ATTTTTTAAC AACACAAACA AAAATAAAAA ACTGCTCTGA CATTTTTTTA 780
CAACGCAAAC AAATTAATAA AACAAGCTGC ATTTTTTCAC AATGCAATCA AATAAGACGC 840
GCTGCATTCT CTCACAACAC AAACAAATTA ATAAAACGCA CTGCATTTTC TTACAACACA 900
AACAAAAATA ATTAAACACG CTACATTATT TCTAAAACGC AAACAAATAA AATTGCACTG 960
GCATTTTTTT ACAACACAAA CAAATTAATA AAACATGCTG CTTTTGTCAC ACAACGCAAA 1020
CAAATTAATA AAAAGGGCTG TATTTTCTAA AACGCAGACA AATACAACGT GCTGCATTTT 1080
CTCACAACAC AAACAAAAAT AATAAAACTG CGCTGGCATT TTTTCACAAC ACAAACAAAT 1140
TAATAAAAAG TACTGCATTA TCTCACAGCG CAAAAAGATC GAAACACAAC AGAAATGTTT 1200
CAAGGAGACT TAAAAACTTG ACAAACACCT CTGTGCCGTA ACTTTTGTTA AGTGATATAA 1260
AAGGCGATCT TAGAAAGGGG AATTTTTTGT TTGTTTTATT TTAATATCTC GATTCCCTTG 1320
TCTTTAGTAT TTATTAGCCT TAGTAACCAT AACCTAAATA GCATGGGTCT GTCCTGTTTT 1380
ATGGTCTCCT TGAAACATTT CCGTTGTGTT GTGAGAAAAT GTAGCGCATT TTATTAATTT 1440
GTTTGCGTTG TGTGAAAATG CAGCACTTTT GTTTAAATGT GTTTGTGTTT TGAGGATTTG 1500
CAGCATGTGT GCTATCAAAC GGATGAAGAT CTTTTCTCAA TTTGATGGCA TTTTTTTATA 1560
ATTGCATGCG TTTTCTTAAA TCGCAGCACA TTAAGCTCTC TCGGCCACCA TACAATGAAC 1620
TTTTTTGGTC CATTACTGAA ACAGACTTTG AATATGGGGT ATCCGACAAC CTTCTTGAAA 1680
CTTTCGAAAC TTTCATATAT AACTTTTTGA TATATAAAAA TTTTAAATTG CTATTTCACA 1740
AATAAAAAAG AAATCATCAC TTATTTATCC TTATGTTGTC CCAAAACCAC AAGGTTTTTG 1800
TTTATTTTTG AAGACCACTC AAACCTCTTA GTTCAATTTA AATACATTTA TGATGTCTTT 1860
TAATAAATTG AAAAAAAAAA CTTCTAATGG AAATAACTAG ATTCTCCTGT TTCATTAAAA 1920
TATCTATTCA TTCAAGACTC TTAATAATAA ACATTATTTT CTGGTCAATG TACGACCTTT 1980
AAAATCCACT TAATTTTTCC GTTACACGAA ATGTTCATCA AATTATTAAA ATGTTCTTCA 2040
AACTAAGAAT TAAAATGATC CCTTAAAAGA GATCCCAAAA TGTTTATTCT GCAGCATGAC 2100
TGCAAAATCC CCCATTTGGA ACATTCATTG TGTATTTCTG TGGCAAGTAA ATCAAGACAG 2160
AATATTAATT TTGAACTAGT CCCAGTCTCC ATTCACTATT GTATATTAAA CAGTGATAGT 2220
ACATTGAAGC TAAAGTTTCT CCTTTTCTCT TCCACAAAAC AAAACAAATC GTATGACTGT 2280
GGAACGACAT GAGGGTGAGT AAACAAAGAC AACGTTTTCA TTTTTAGGTC TTTTTAAACT 2340
ATTCCAATGG GAGGAATTTT GTGCCCAACT AGCCAAGGAT AT 2382